蛋白质翻译后修饰SUMO化位点预测工具 —— SUMOsp 2.0

最新推荐文章于 2018-06-04 19:47:33 发布
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Systematic study of protein sumoylation: Development of a site-specific predictor of SUMOsp 2.0 .
Jian Ren , Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Mei Zhu, Xiwei Wang, Andrew Shaw, Longping Wen, Xuebiao Yao and Yu Xue .
Proteomics.2009; 9:3409-3412 [Abstract] [Full Text]

 

  The past decade has witnessed the rapid progresses on functional dissections of protein sumoylation (Geiss-Friedlander and Melchior, 2007 ). The SUMO (small ubiquitin-related modifier) gene SMT3 was firs

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casularm
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SUMO的流量输出工具是`sumo-xml2csv`，它可以将SUMO仿真生成的输出文件（.xml）转换为CSV格式，以便于后续处理和分析。 以下是使用`sumo-xml2csv`工具的基本命令格式： ``` sumo-xml2csv [-h] [-o OUTPUT] input.xml ``` 其中，`-h`是可选参数，用于查看帮助信息。`-o OUTPUT`是可选参数，用于指定输出文件的名称。`input.xml`是SUMO仿真生成的输出文件。 示例命令如下： ``` sumo-xml2csv -o output.csv simulation_output.xml ``` 这将把名为`simulation_output.xml`的SUMO仿真输出文件转换为名为`output.csv`的CSV文件。 请注意，您需要在命令行中执行该命令，并确保在执行命令之前已正确设置了SUMO的环境变量。 转换完成后，您可以使用Python等编程语言或其他工具来读取生成的CSV文件并进行进一步的处理和分析。

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