专访百奥智汇王泱洲:未来3-5年单细胞测序会爆发式增长,而我们的独有优势是大数据及分析平台

专访百奥智汇王泱洲:未来3-5年单细胞测序会爆发式增长,而我们的独有优势是大数据及分析平台

 

2013 年,单细胞基因测序(Single Cell Sequencing)被 Nature 杂志评为年度技术,也被认为将对生命科学界和医学界带来重要改变。

 

传统测序中,多以数十万个细胞基因组作为测序对象,所获得的信息来自于众多细胞的平均值,这种对平均值的检测具有局限性,掩盖了细胞异质性方面的信息,导致无法精确、真实地阐述和理解生物学过程和机制。而以单个细胞基因为测序对象的单细胞测序及分析平台可以通过技术手段剖析细胞异质性问题,从而获得更加精准真实的生物学信息,对生物学机理研究有着重要推动。

 

随着第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)技术成本下降,单细胞测序得到了更多的发展。数据显示,单细胞分析市场预计将从 2019 年的 21 亿美元增长到 2025 年的 56 亿美元,复合增长率为 17.8%。根据 GENReports 报告显示,关于单细胞分析的文章发表在过去几年也有着爆发性增长。

 

现任北京大学教授,曾在 Genentech 工作 16 年,担任科研部生物信息首席科学家的张泽民博士是单细胞测序及生物信息学分析方面的国际领先科学家。2018 年底,张泽民博士创立了百奥智汇。

 

2020 年 8 月,拥有 20 多年生物技术及制药领域管理和运营经验的王泱洲博士加入百奥智汇,并担任 CEO。王泱洲博士曾任中美冠科生物技术股份有限公司 COO 及董事,拥有纽约州立大学布法罗分校罗斯韦尔·派克癌症研究所(全美第一家癌症研究中心) 分子细胞生物学博士学位及计算机硕士学位。

 

在加入新公司之际,王泱洲博士与生辉分享了他对百奥智汇的未来管理计划及对单细胞测序行业的看法。

 

“我们不是设备或试剂公司,而是一家药物发现和大数据平台公司”

 

生辉:你在今年 8 月加入百奥智汇,百奥智汇最吸引你的地方是什么?

 

王泱洲:百奥智汇吸引我的地方主要有以下几个方面:

 

第一, 百奥智汇在科学、技术方面深厚的实力和底蕴。百奥智汇处于单细胞及测序领域,我们知道,这是一个靠技术、科研实力吃饭的领域。在我学习了百奥智汇创始人张泽民博士的多篇国际权威杂志发表的论文后,真正感受到百奥的科研基础的雄厚,从科研实力上可以说是“真正的领先”。

 

第二, 百奥智汇在数据方面的积累。除了张泽民博士在计算方法学领域的学术实力外,百奥智汇在数据方面也有很深的积累。目前,百奥智汇已经建立在规模和质量方面国际领先的单细胞大数据和分析平台,这是非常有价值的。现在市面上的数据很多,但有效的、整理好的数据并不多,我们有一款单细胞大数据云平台产品,里面已经涵盖了超过 600 个研究的 1300 多个数据集、2000 多万个单细胞的数据。从数据量和标准化程度数据以及数据质量方面都是国际领先的。从单个细胞水平上广泛收集和注释了患病和健康组织的全面科研数据,对未来药物研究、发现等方面都有至关重要作用。

 

第三, 人才。我们知道人才,尤其对于高科技公司,是极其重要和关键的。我接触到百奥智汇后发现,公司无论从运营管理、科研和工艺开发方面都是人才济济,是今后公司发展的核心竞争优势和基础。

 

这些都让我十分振奋。百奥智汇坚实的基础和优越的资源,完全有能力可以和国际上任何一家公司在生物高科技领域以技术实力竞争,并成为这个领域的领导者,这也是我加入这家公司的原因和目标。

 

生辉:你计划将百奥智汇打造成一家怎样的公司?

 

王泱洲:这也是我加入百奥前后一直在思考的事。我希望把百奥智汇建立成一个在生物机理研究领域的全球领导者。这里的 “机理研究” 表示百奥智汇会从以生物机理研究方面系统性地打造出公司的战略优势,使公司成为一家机理和数据为主导的新药研发公司。同时,我们也将会基于我们的单细胞测序药物研发和诊断标记物研发方面的优势,在制药和学术界搭建战略联盟,加速突破性疗法的发展。

 

我们不是一个生物设备、仪器和试剂公司,而是一个药物发现和大数据平台公司。我们与先进的测序设备公司合作,使用他们的产品产生数据,通过我们的数据及算法平台对这些数据和公共数据进行整合、处理,从而产生对药物研发方面的深刻认知和有价值的系统化数据和元数据,我们的产品不是设备或试剂,而是新的知识、数据和它们代表的价值。我们的理想是通过我们单细胞为核心的平台系统支撑整个药物研发产业链的发展,造福人类。

 

生辉:百奥智汇的核心优势是什么?

 

王泱洲:主要是我们的大数据平台,也是一个分析平台。如果说只是做单细胞测序服务,用购置几套设备找几个能人就可以开始,国内目前做单细胞方面的公司已经有不少了。但我们基于张博士的研究衍生出来的实验和分析平台,对于数据的质量、分析都有严格和系统的控制和把握。

 

从数据的角度来说,是否有数据积累、是否有能力分析数据、是否能最佳地使用数据,这些对生物机理研究和药物研发都是至关重要的。我们的数据库、数据建模、数据分析能力源于张博士的多年研究和积累,是我们的核心优势。未来我们会在大数据和人工智能方面有更多的投入,进一步加速新药研发。

 

“单细胞测序正处于‘清晨’”

 

生辉:近几年单细胞测序行业发展迅猛,有业内人士认为这个行业的爆发点已经到来,你如何看待这样的观点?

 

王泱洲:这个问题我看到很多业内人士已经表达过自己的观点。我们无法预言未来,但我个人的观点是这个行业正处于“清晨”,可能未来 3-5 年会迎来爆发期。

 

我们回头看 NGS 行业刚刚兴起的时候,测序价格很高,机器也很复杂,但现在已经很成熟了。而单细胞测序领域未来要比 NGS 行业发展更为迅速,现在单细胞测序领域的研究、文章和数据都在指数增长。所以我认为未来 3-5 年这个行业会爆发式增长,至于能不能发展到工业化,可能还需要一段时间孕育。

 

生辉:你认为单细胞测序行业面临的主要挑战有哪些?

 

王泱洲:我觉得主要有两方面的挑战:

 

第一个,数据的来源与处理。现在虽然有很多数据在不断发表,不断加入公共数据库中,但是绝大多数数据,尤其是开源数据,在注释、标准化和整合方面都有很大的欠缺,所以很多希望使用单细胞数据的公司很难获取到有价值的、整合好的数据。这恰恰也为单细胞测序行业带来机会,如何对数据进行有效的、系统性的整理和加注,是大家都在思考的问题。谁能解决这个问题,谁就能在这个领域领先。

 

第二个,标准化的数据及分析平台。目前,基本上每家公司都有自己的软件,一个博士后写一个 java 或者 python,可以满足实验室的单方面用途。但这会导致数据割裂、整合成本极高,工业化用途也会受到很大制约。对于药物发现而言,这些少量的、无法整合到一起的数据价值有限,所以需要有标准化的数据平台,让数据是可管理的。

 

也正是看到了这两方面的挑战,百奥智汇花了很大精力建立了我们的大数据平台和分析平台。某种程度上,未来是药物研发也将是高性能计算的挑战,比拼的是算法、软件研发进程和性能整合系统。而百奥智汇恰恰在这些方面也有多年的积累和优势。

 

生辉:单细胞测序行业,国内外是否存在着明显的差异?

 

王泱洲:总体来说,国外在单细胞测序方面要更强大一些,有更多的公司在单细胞测序方面有了规模化的发展,这些公司对其战略和定位也更清晰。目前国内在单细胞测序方面真正有自己的技术平台、做数据挖掘的公司还不多。我个人认为,不论是国内还是国外,这个市场还处于未完全开发状态,是一个令人振奋的新兴领域。

 

生辉:关于药物研发,未来百奥智汇会自主研发还是和药厂合作?

 

王泱洲:这两方面都会有,单细胞测序数据平台的应用是非常广泛的。未来不论是药企、大学还是医院,只要需要这个数据平台的数据进行科研和开发的,我们都可以支持。我们自己也一定会自主研发新药,公司已经在系统性的扩大自主研发的能力和规模。

 

生辉:目前国外很多做 NGS 测序的公司也逐渐开始做单细胞测序,你怎么看百奥智汇和这些公司的关系 ?

 

王泱洲:他们是我们的依靠,我们之间是完全互补。他们更多的是做测序仪器和设备试剂,而我们更多的是做数据、做药物研发,这并不矛盾。基于我们的数据平台和技术,我还是非常乐观的。

 

生辉:有没有下一轮的融资计划,或者是未来的上市计划?

 

王泱洲:有融资方面的计划。这也是我来百奥智汇的重点工作之一。公司目前在商业化机制和运营方面需要加速,我们会不断地把公司的商业运营体系和规模扩大和优化,在这些方面我们需要资金的支持。

 

关于上市,是几乎所有高科技新创公司想要达到的目标。上市是一家公司价值呈现的最重要途径之一。对于上市我们自然也有计划,不过在实现这个目标过程中还有很多步骤和必要的里程碑,我们会放眼未来,立足当下。先把目前的商业运营系统、规模搭建好,把产品管线、大数据平台、分析平台丰富起来,一步一个脚印把事情做好,真正产生了价值,我相信到时候资本市场对于我们会更认可。

 

生辉:对于融资,百奥智汇更偏向于怎样的投资者?

 

王泱洲:我们更偏好在资本市场有丰富经验、阅历、和信心的投资伙伴。在大数据、人工智能和药物研发方面,有能力、有信誉的投资者我们尤其欢迎。

 

我们认为,共赢来源于大家对战略方向的目标一致和执行层面的互相理解和支持。从公司角度看,投资者不应该只是一个以财务回报为唯一的被动投资人,而更是一个长期的战略伙伴。原因很简单:单细胞领域在未来会是一个颠覆性的领域,有足够的机会可以在科研、商业方面产生巨大的价值。能和我们的投资人有持久有效的战略合作,是真正共赢的基础。所以我们希望能和我们的投资伙伴以及其他战略伙伴在形成合作关系之后仍然保持紧密沟通,使他们对我们的理念和做法能更加理解,并给予公司不断的指导和支持,共同成功。

道翰天琼CiGril机器人API

道翰天琼CiGril认知智能机器人API用户需要按步骤获取基本信息:

  1. 在平台注册账号
  2. 登录平台,进入后台管理页面,创建应用,然后查看应用,查看应用相关信息。
  3. 在应用信息页面,找到appid,appkey秘钥等信息,然后写接口代码接入机器人应用。

开始接入

请求地址:http://www.weilaitec.com/cigirlrobot.cgr

请求方式:post

请求参数:

参数

类型

默认值

描述

userid  

String  

平台注册账号

appid  

String  

平台创建的应用id

key  

String  

平台应用生成的秘钥

msg  

String  

""

用户端消息内容

 

接口连接示例:http://www.weilaitec.com/cigirlrobot.cgr?key=UTNJK34THXK010T566ZI39VES50BLRBE8R66H5R3FOAO84J3BV&msg=你好&ip=119.25.36.48&userid=jackli&appid=52454214552

注意事项:参数名称都要小写,五个参数不能遗漏,参数名称都要写对,且各个参数的值不能为空字符串。否则无法请求成功。userid,appid,key三个参数要到平台注册登录创建应用之后,然后查看应用详情就可以看到。userid就是平台注册账号。

示例代码JAVA:


import java.io.ByteArrayOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStream;
import java.net.HttpURLConnection;
import java.net.URL;

public class apitest {

    /**
     * Get请求,获得返回数据
     * @param urlStr
     * @return
     */
    private static String opUrl(String urlStr)
    {        
        URL url = null;
        HttpURLConnection conn = null;
        InputStream is = null;
        ByteArrayOutputStream baos = null;
        try
        {
            url = new URL(urlStr);
            conn = (HttpURLConnection) url.openConnection();
            conn.setReadTimeout(5 * 10000);
            conn.setConnectTimeout(5 * 10000);
            conn.setRequestMethod("POST");
            if (conn.getResponseCode() == 200)
            {
                is = conn.getInputStream();
                baos = new ByteArrayOutputStream();
                int len = -1;
                byte[] buf = new byte[128];

                while ((len = is.read(buf)) != -1)
                {
                    baos.write(buf, 0, len);
                }
                baos.flush();
                String result = baos.toString();
                return result;
            } else
            {
                throw new Exception("服务器连接错误!");
            }

        } catch (Exception e)
        {
            e.printStackTrace();
        } finally
        {
            try
            {
                if (is != null)
                    is.close();
            } catch (IOException e)
            {
                e.printStackTrace();
            }

            try
            {
                if (baos != null)
                    baos.close();
            } catch (IOException e)
            {
                e.printStackTrace();
            }
            conn.disconnect();
        }
        return "";
    }
    
    
    public static void main(String args []){        
            //msg参数就是传输过去的对话内容。            
            System.out.println(opUrl("http://www.weilaitec.com/cigirlrobot.cgr?key=UTNJK34THXK010T566ZI39VES50BLRBE8R66H5R3FOAO84J3BV&msg=你好&ip=119.25.36.48&userid=jackli&appid=52454214552"));
            
    }
}

 

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