CESM1.2运行B模块及ocn_run_mct问题解决

运行B case需要什么？

首先，作为大气人，时常运行的是F case，但是有些研究确实需要B case来帮助我们解决问题，这时候小白作为一个长期使用F case的人，就发现相同的安装方式，在有些服务器可以运行B case（很少），但是大部分运行不了。我们首先解决这个问题。
cesm_setup过程报错信息如下:

Can't locate Switch.pm in @INC .......

针对这个问题，就是perl5缺失了Switch.pm这个文件，因此我们要补上：
我们采用最简单的方法cpan工具解决：

cpan 
install Switch.pm

一般这样处理能解决问题，如果还有类似的问题，可以考虑安装一下libxml2和XML的四个插件（安装过程，详见另一个帖子）

下面以BWCN模块为例，来说明运行过程中的bug
首先正常的create newcase，setup, build这些都一样（详见）
但是，海洋具有更大的热惯性（小白非海洋专业，不知道对不对），因此需要更长的spin-up时间。
因此，pop2设置有一个独立与大气的热启动方案，设置如下：
该文档在run/pop2_in,也可以在script/$case/user_nl_pop2里面改

&init_ts_nml
 init_ts_file = '/public/home/yupf/model/install/cesm1.2/output/BWCN/run/BWCN.pop.r.0001-01-06-00000.nc'
 init_ts_file_fmt = 'nc'
 init_ts_option = 'ccsm_branch'
 init_ts_outfile = './BWCN.pop.h.ts_ic'
 init_ts_outfile_fmt = 'nc'
 init_ts_suboption = 'spunup'
/

下面每个参数简单讲解一下：
init_ts_file 是海洋的initial file, 默认是二进制文件，但是是支持使用nc文件的（可以用某个试验的重启文件）
init_ts_file_fmt 如果initial file是nc文件，这个参数需要设置成’nc’
init_ts_option = ‘ccsm_branch’ 这个如果用的是热启动，也就是某个试验的初始场启动，需要把这个改成branch，默认是startup
init_ts_suboption = ‘spunup’ 这个一定要记得改，默认是null

运行B case遇到的bug：ocn_run_mct？

紧接着需要讲解一下关于热启动遇到的bug
情况：大气模块运行了两天，然后就断了，报错如下：

(shr_sys_abort) WARNING: calling shr_mpi_abort() and stopping
  pop2 ymd=       10107   pop2 tod=            0
  sync ymd=       10108   sync tod=            0

这是大气的时间和海洋时间差了一天导致的
后面发现大气模块的启动时间需要和海洋的热启动文件的时间对应。
如果海洋启动文件是：00010106；大气需设置成：00010105
如此，便可以解决以上bug。

至于如何使用B模块，开展一些大气模块具有的化学包的试验（namelist冲突），后面有时间在详细记录。