bsub 命令常见用法如下:
bsub –n z –q QUEUENAME –i inputfile –o outputfile COMMAND
其中z代表了提交作业需要的cpu数,–q指定作业提交到的队列,如果不采用–q选项,系统把作业提交到默认作业队列。
inputfile 代表程序需要读入的文件名(例如 namelist等),outputfile 代表一个文件,作业提交后标准输出的信息将会保存到这个文件中。COMMAND是用户要运行的程序。
(1)对于串行程序COMMAND可以直接使用用户的程序名
例如,对一个串行作业mytest, 提交方式为:
bsub –n 1 –q debug –o mytest.out ./mytest
(2) 对于并行作业COMMAND为“mpirun.lsf 程序名”
例如对于一个72个小时内完成,使用16个cpu的并行作业mytest,提交方式为:
bsub –n 16 –q normal –o mytest.out mpirun.lsf ./mytest
bsub 命令可以使用输入脚本提交具有相同参数的作业,格式为:
该脚本的参数与命令行"bsub –n Z –q QUEUENAME –o outputfile COMMAND”参数相同。
提交时为 bsub < 脚本名
例如要提交一个72小时内完成,需要16个cpu的并行作业mytest,可以编写作业脚本 bsub.scriptfile
#BSUB –n 16
#BSUB –q normal
#BSUB –o mytest.out
mpirun.lsf ./mytest
作业提交方法为:bsub<bsub.scriptfile