MPICH 安装

1，下载MPICH ：  http://www.mpich.org/downloads/

2，解压文件，并进入目录运行命令：   

      (1)tar zxvf mpich-3.2.tar.gz

      (2)cd mpich-3.2
      (3)./configure --prefix=/home/renzhen/mpich                  （ = 后面是文件安装路径）
      (4) make && make install

3，配置环境变量：

      在PATH 上添加 /home/renzhen/mpich/bin 路径

      可以通过向文件 /etc/profile 最后添加一行  export PATH=/home/renzhen/mpich/bin:$PATH

      然后记得source /etc/profile

4，配置多服务器间无密码访问

     步骤1: 用 ssh-key-gen 在本地主机上创建公钥和密钥
     renzhen@yrscentos$ ssh-keygen -t  rsa       所有提示都按回车跳过

     步骤2: 用 ssh-copy-id 把公钥复制到远程主机上
     renzhen@yrscentos$ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub renzhen@192.168.0.3

     步骤3: 直接登录远程主机

     renzhen@yrscentos$ ssh renzhen@192.168.0.3

 

     以 ssh hostname 方式登陆,node*在实际情况中要替换成服务器的主机名，可通过hostname获得主机名：

     向 /etc/hosts 里添加：   192.168.0.3 （ip）  :     hostname (计算机名)

     测试：

     renzhen@yrscentos$ ssh hostname

     注意：各太服务器的用户名要相同，不然不能通过ssh hostname 登陆，看到其他博客说道可以通过配置 .ssh/config 文件，可以使不同用户名可以 ssh hostname 登陆，但是我没有配好。大家也可以试试，成功的话别忘了告诉俺一声。

5， 添加servers文件

     在mpich 下新建servers 文件，并添加 hostname:线程数，包含所有的主机名。

     例如：

      renzhen-pc:2
      yrscentos:2

      ......................

6， 运行测试程序

    （1）单点运行

      renzhen@yrscentos$ mpirun -np 4 ~/mpich-3.2/examples/cpi

      (2)  多点并行

      renzhen@yrscentos$ mpiexec -n 4 -f ~/mpich/servers ~/mpich-3.2/examples/cpi

7，可能出现的错误：

利用mpich 进行多点并行运算时，出现以下错误：

➜  bin  ./mpiexec -n 4 -f ~/mpich/servers ~/mpich-3.2/examples/cpi
Process 3 of 4 is on yrscentos
Process 2 of 4 is on yrscentos
Process 0 of 4 is on renzhen-pc
Process 1 of 4 is on renzhen-pc
Fatal error in PMPI_Reduce: Unknown error class, error stack:
PMPI_Reduce(1258)...............: MPI_Reduce(sbuf=0x7fff2a4c16e0, rbuf=0x7fff2a4c16e8, count=1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, root=0, MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Reduce_impl(1070)..........:
MPIR_Reduce_intra(823)..........:
MPIR_Reduce_impl(1070)..........:
MPIR_Reduce_intra(878)..........:
MPIR_Reduce_binomial(186).......:
MPIDI_CH3U_Recvq_FDU_or_AEP(629): Communication error with rank 2
MPIR_Reduce_intra(843)..........:
MPIR_Reduce_impl(1070)..........:
MPIR_Reduce_intra(878)..........:
MPIR_Reduce_binomial(248).......: Failure during collective

或：

[renzhen@yrscentos 桌面]$ mpiexec -n 4 -f ~/mpich/servers ~/mpich-3.2/examples/cpi
[proxy:0:0@renzhen-pc] HYDU_sock_connect (utils/sock/sock.c:172): unable to connect from "renzhen-pc" to "yrscentos" (No route to host)
[proxy:0:0@renzhen-pc] main (pm/pmiserv/pmip.c:189): unable to connect to server yrscentos at port 58753 (check for firewalls!

出现这两种情况可能是因为防火墙的问题。第一种情况是登陆的主节点正常，而从节点的防火墙没关闭。在ssh能免密码登陆的情况下，第二种情况是自己的防火墙没有关闭。