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R
Talini
这个作者很懒,什么都没留下…
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#TCGA系列#利用R处理多个文件夹下的miRNA表达数据
- 当我们TCGA官方下载数据miRNA表达数据时,这些数据大多都位于多个文件夹下,而且有类似文件容易混淆。 - 说实话,R处理文件并没有perl好用,但并不代表不能处理f1 <- list.files(pattern="isoforms.quantification",recursive=T)f2 <- list.files(pattern="isoforms.quanti...原创 2019-10-12 10:57:12 · 4357 阅读 · 6 评论 -
#TCGA#利用R包edgeR做miRNA表达谱的差异分析
之前我们通过perl得到表达矩阵,现在利用R做差异分析(只截取部分数据)得到的火山图得到的热图R代码#设置好工作路径,并卡好p值和foldChange值setwd("E:/text")foldChange <- 1padj <- 0.05#加载edgeR包library(edgeR)#读入表达矩阵,注意读入后fc是数据框fc <- read.de...原创 2019-07-13 11:01:19 · 7508 阅读 · 2 评论