Bader分析

本文介绍了Bader分析,一种基于电荷密度划分分子中原子的方法,用于电荷分析和原子硬度定义。文章详细讲解了如何下载相关程序,进行电荷分析计算,并分析输出结果,包括ACF.dat、BCF.dat和AtomVolumes.dat文件的内容。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、背景

理查德·贝德(Richard Bader)开发了一种将分子分解为原子的直观方法。他对原子的定义纯粹基于电子电荷密度。Bader使用所谓的零磁通表面来划分原子。零通量表面是2D表面,其上电荷密度垂直于表面。通常在分子系统中,电荷密度在原子之间达到最小值,这是将原子彼此分开的自然位置。除了作为分子中原子可视化的直观方案外,Bader的定义通常也可用于电荷分析。例如,Bader体积内的电荷与原子的总电子电荷很接近。电荷分布可用于确定相互作用的原子或分子的多极矩。Bader的分析也被用来定义原子的硬度,可以用来量化从原子中去除电荷的成本。

二、程序下载

1)下载网址:http://theoryNaN.utexas.edu/vtsttools/scripts.html (用到chgsum.pl脚本)

http://theoryNaN.utexas.edu/henkelman/code/bader/download/bader_lnx_64.tar.gz (下载bader处理脚本)

2)将前面下载的内容解压,然后复制到~

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