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原创 error: RPC failed; curl 16 Error in the HTTP2 framing layerfatal: expected flush after ref listing

【代码】error: RPC failed;

2024-06-08 11:44:34 129

原创 conda

【代码】conda。

2024-06-08 11:41:47 182

原创 pipeline

【代码】【无标题】pipeline。

2024-06-05 17:51:38 90

翻译 Using the current 1000 genomes reference (Phase4 reference) to use BreakSeq2 to perform SV calling

Q:A:

2024-05-15 14:24:37 8

原创 vcf 提取SNP 以及INDEL

GATKSNPINDELVCFTOOLSSNPINDEL。

2024-05-09 21:20:00 221

原创 python UnicodeDecodeError: ‘utf-8‘ codec can‘t decode byte 0xa0 in position 6538: invalid start byte

python 读取数据,报错:f = open(filepath)UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xa0 in position 6538: invalid start byte修改f = open(filepath,encoding='gbk')没有问题。

2021-03-18 20:04:40 126

原创 R 坐标

xlim() + ylim()coord_cartesian(xlim=c(),ylim=c())coord_flip(xlim=c(),ylim=c())

2020-09-24 23:11:47 239

原创 VCFtools

比较文件的snp位点vcftools --gzvcf file1.vcf.gz -gzdiff file0.vcf.gz --diff-site --out outpre--diff-site 如果没有这个参数,则他只输出log,有这个参数,输出比较的结果。CHROM POS1 POS2 IN_FILE REF1 REF2 ALT1 ALT210 71776 71776 B T T C C1

2020-09-16 21:03:07 322

原创 SMC++ Resource temporarily unavailable

在run smc++的时候,遇到问题,OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create failed for thread 16 of 48: Resource temporarily unavailableOpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 4134580 maxexport OPENBLAS_NUM_THREADS=1orimport osos.environ['OP..

2020-09-13 19:26:52 573

原创 R ggplot legend

theme(legend.title = element_blank(), legend.text=element_text(face=''))p + geom_historam(binwidth='', )

2020-08-24 11:08:25 563

原创 R 语言 heatmap plot

library(gplots)> blueredfunction (n)colorpanel(n, "blue", "white", "red")<bytecode: 0x262fe60><environment: namespace:gplots>> blueredfunction (n)colorpanel(n, "blue", "white", "red")<bytecode: 0x262fe60><envir...

2020-07-22 19:04:59 486

原创 R 语言 绘制 correlation以及相关性热图

PerformanceAnalyticschart.Correlation()histogram=true 在对角线做柱状图和密度图。histogram=false 不做图

2020-07-15 22:24:04 1925

原创 R 语言 plot 函数

plot(font.lab=) 修改坐标轴字体

2020-06-27 11:07:03 423

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