新冠病毒将如何变异？机器学习给你答案

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图源：unsplash

 

病毒和其他微生物一样，为了在地球上存活，不断进化和变异。这对于人类来说就有点儿可怕了，尤其是新冠病毒肆虐全球的今天，它还想整什么幺蛾子？

 

事实上，变异已经发生了。先来看一段由人类病毒进化而来的蝙蝠病毒的RNA核苷酸序列：

 

AAAATCAAAGCTTGTGTTGAAGAAGTTACAACAACTCTGGAAGAAACTAAGTT

 

以及一段新冠病毒的RNA核苷酸序列：

 

AAAATTAAGGCTTGCATTGATGAGGTTACCACAACACTGGAAGAAACTAAGTT

 

显然，新冠病毒为了适应新宿主，其原始结构已发生改变。准确来说，已经有20%的原始结构发生变异，但因大部分结构并未改变，所以病毒还未发生变种。

 

图源：singularityhub

 

研究者发现新冠病毒已发生重复变异以持续存活。在与新冠病毒的较量中，我们不仅要知道如何消灭病毒，还要了解病毒如何变异以及怎样应对病毒变异。本文将尝试用K-Means和PCA探究这一点。

 

 

什么是基因组序列？

 

如果您对RNA核苷酸序列有所了解，那么可直接略过这部分内容。

 

基因组序列，通常我们称之为“解码”，是对样本进行DNA分析的重要步骤。一般来说，正常细胞中有23对携带DNA结构的染色体。