新冠检测的最优分组算法

面对有限的检测试剂,文章探讨了如何通过分组检测策略有效利用资源。在少量感染者情况下,选择分组数接近 e(约 2.718)可最大化节约试剂;而在大量感染者时,采用最大分组数可减少检测次数。文章通过数学模型分析,给出了感染率为 p 的情况下最优分组数的公式,并举例说明在实际应用中如何平衡试剂使用和检测轮数。
摘要由CSDN通过智能技术生成

为了应对疫情,全球各国都需要检测潜在感染者。由于检测试剂相对短缺,如何用尽量少的试剂进行检测就成为一个有意思的问题。这里假设采样量足够,且不考虑检测时间要求。

目前,很多国家采用的都是分组检测机制,即将待检测群体进行分组,同组内样本混合进行检测。如果某组结果为阳性,则对该组再进一步进行检测。

一个很自然的问题:该怎么分组才能节约试剂?

先来看两种极端的情况。

少量感染者

通常,群体内的感染者是少数。

假设群体一共 64 人,其中只有 1 个感染者,采用 2、4、8、64 等分法。

  • 2 分法,要测 6 轮,共 2*6=12 次;
  • 4 分法,要测 3 轮,共 4*3=12 次;
  • 8 分法,要测 2 轮,共 8*2=16 次;
  • 64 分法,要测 1 轮,共 64 次。

实际上,当人数很多时候,如 N 个人,采用 x 分法,其总测试次数大概为 y=x*log(x, N),容易知道该函数在 x=e 时取极小值。

此时应当取 e 附近的 x 值,例如 2 或 3,可以节约试剂。同时,人数 N 最好选为能整除 x 的值。

大量感染者

第二种场景,64 个人全部都是感染者,同样采用 2、4、8、64 等分法。

使用ResNet50模型进行新冠肺炎CT检测的代码实现步骤如下: 1. 准备数据集:收集有标注的新冠肺炎CT图像数据集,分为训练集和测试集。 2. 数据预处理:对图像数据进行预处理,包括图像大小调整、数据增强、标准化等。 3. 定义模型:使用PyTorch中的ResNet50模型作为基础模型,对其进行微调,以适应新冠肺炎CT检测任务。 4. 训练模型:使用训练集对模型进行训练,调整模型参数,使其能够更好地分类新冠肺炎CT图像。 5. 评估模型:使用测试集对模型进行评估,计算准确率、精度、召回率等指标,评估模型性能。 6. 部署模型:将训练好的模型部署到应用程序中,实现新冠肺炎CT检测功能。 下面是一个简单的代码示例: ```python import torch import torch.nn as nn import torchvision.models as models # 定义ResNet50模型 class ResNet50(nn.Module): def __init__(self, num_classes): super(ResNet50, self).__init__() self.resnet = models.resnet50(pretrained=True) self.fc = nn.Linear(2048, num_classes) def forward(self, x): x = self.resnet(x) x = self.fc(x) return x # 创建模型实例 model = ResNet50(num_classes=2) # 定义损失函数和优化器 criterion = nn.CrossEntropyLoss() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.001) # 训练模型 for epoch in range(10): for images, labels in train_loader: optimizer.zero_grad() outputs = model(images) loss = criterion(outputs, labels) loss.backward() optimizer.step() # 评估模型 total = 0 correct = 0 with torch.no_grad(): for images, labels in test_loader: outputs = model(images) _, predicted = torch.max(outputs.data, 1) total += labels.size(0) correct += (predicted == labels).sum().item() print('Accuracy: {:.2f}%'.format(100 * correct / total)) ``` 需要注意的是,以上代码仅为示例,具体实现方式需要根据具体任务和数据集进行调整。
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