重症医学数据库MIMIC-IV简介

本文介绍了MIMIC-IV数据库,一个由MIT发布的重症医学数据库,用于医疗大数据研究。MIMIC-IV源自医院EHR和ICU信息系统,数据经过采集、数据准备和去身份化处理。数据库分为core、hosp和icu三个模块,提供患者信息、住院记录、临床事件等数据。研究人员使用该资源时需引用相关文献。

前言

继MIMIC-III之后,MIT又发布了全新版本的数据库MIMIC-IV。目前版本为V0.4。本文主要对MIMIC-IV进行简要介绍。

引用要求

When using this resource, please cite:
Johnson, A., Bulgarelli, L., Pollard, T., Horng, S., Celi, L. A., & Mark, R. (2020). MIMIC-IV (version 0.4). PhysioNet. https://doi.org/10.13026/a3wn-hq05.

Please include the standard citation for PhysioNet:
Goldberger, A., Amaral, L., Glass, L., Hausdorff, J., Ivanov, P. C., Mark, R., … & Stanley, H. E. (2000). PhysioBank, PhysioToolkit, and PhysioNet: Components of a new research resource for complex physiologic signals. Circulation [Online]. 101 (23), pp. e215–e220.

方法

MIMIC-IV来自两个住院数据库系统:定制的医院电子病历系统 (EHR)和ICU自身的临床信息系统。
MIMIC-IV的创建分三个步骤进行:

  1. 采集
    • 从各自的医院数据库中提取了进入BIDMC急诊科或重症监护病房之一的患者的数据
    • 创建了一个主患者列表 (master patient list),其中
### MIMIC-IV 波形数据库概述 MIMIC-IV Waveform Database 是一个公开可用的重症监护医学研究资源,它包含了来自 ICU 患者的高分辨率生理信号记录[^1]。这些数据通常以多参数智能监测(Monitoring)集成接口 (Multiparameter Intelligent Monitoring in Intensive Care, MIMIC) 的形式提供。 #### 数据库结构 该数据库的数据存储采用分层文件夹结构设计,主要分为以下几个部分: - **患者元数据**:包括患者的年龄、性别以及其他去识别化的基本信息。 - **波形数据**:由床边监护仪采集的心电图(ECG)、动脉压(ABP)和其他生命体征的时间序列数据[^2]。 - **注释文件**:用于标记重要事件(如心律失常发作时间)以及临床干预措施的具体时间节点。 具体来说,每名患者的波形数据被保存在一个独立的 `.wav` 文件中,并附带相应的头文件(`.hea`)来描述采样率、通道数等技术细节[^3]。 #### 下载方式 访问并获取 MIMIC-IV Waveform Database 需要遵循以下流程: 1. 注册账户并通过 PhysioNet 提供的身份验证程序获得权限。 2. 登录到指定平台后,在线浏览或者批量下载所需数据集片段。 3. 使用官方推荐工具如 `wfdb` 库加载本地拷贝中的二进制格式文件以便进一步分析处理[^4]。 对于编程环境支持方面,Python 用户可以利用 WFDB 软件包轻松实现读取操作;而 MATLAB 则内置了专门函数方便调用此类医疗设备导出的标准兼容型资料[^5]。 ```python import wfdb record = wfdb.rdrecord('path_to_record') # 替换为实际路径下的单条目名称 print(record.__dict__) ``` 以上代码展示了如何通过 Python 中的 WFDB 工具快速解析一条记录的内容概览。 #### 使用方法指导 为了有效利用此数据库开展科学研究活动,请注意以下几点建议事项: - 明确项目目标后再决定选取哪些特定类型的变量作为输入特征参与建模过程; - 对原始连续测量值执行必要的预处理步骤比如滤波降噪和平滑插补缺失点位; - 结合领域专业知识解释模型预测结果背后蕴含的实际意义而非单纯依赖统计显著性指标评估性能优劣程度差异情况等等[^6]。
评论 17
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值