rpy2入门【安装R 安装rpy2 基本操作 常见问题】

rpy2 这个 R 包 是一个连接Python和R语言的接口，使用它就可以愉快的在Python中写R。

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因为 rpy2 是 R 与 Python 的接口，因此在下载rpy2前，应先检查其对应的版本。

rpy2 对应版本查询

进入 rpy2 官方文档： 戳这里
在 Document 节 选择你感兴趣的版本：

比如我想下载的是 rpy2 3.5.1 则我点击对应的3.5.x版本，进入以下页面，点击 background：

可看到其依赖的 Python、R 的版本：

Python我已经有了，是3.7.3版本的，因此需要配置4.0以上的R，需要注意这里不要用conda 下载 R 语言，因为他默认最高的版本才3.6，如下所示：
用conda搜索可安装版本

conda search r-base

这里建议直接在 官网 下载。

安装R

因为 windows 和 linux 的教程很多，所以这里只演示 mac os 的配置。首先是从 官网 中下载对应版本的 dmg 文件，然后傻瓜式安装，安装完成后，在 launcher 会出现这样的图标：

这是R语言的GUI，可以双击打开输几个命令测试下，因为基本是dmg自动配置的，所以应该都不会出现什么问题。

但要在rpy2中使用R，还需要配置一个东西，即在我们的配置文件中设置R的路径。
首先进入配置文件：

vim ~/.bash_profile

然后插入R的路径：

R_HOME=/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.1/Resources

这里需要注意，与用 brew 安装 或 windows 和 linux 系统里不同，我们用dmg安装的库是类似以上路径，其中的前缀 /Library/Frameworks/R.framework/Versions/ 大家都一样，我这里的 4.1 是指我的R是 4.1 版本的，大家可以根据自己下载的版本进行修改，如果不确定可以直接进 /Library/Frameworks/R.framework/Versions/ 中搜索。

配置完成后，更新下配置文件：

. ~/.bash_profile

然后下载对应版本的rpy2即可：

pip install rpy2==3.5.1

安装完成后，进入python测试下：

import rpy2
print(rpy2.__version__)

输出为3.5.1，则安装完毕，接下来是rpy2的常用操作。

常用操作

TODO

常见错误

rpy2.rinterface_lib._rinterface_capi.RParsingError: 
Parsing status not OK - PARSING_STATUS.PARSE_INCOMPLETE

这是解析错误，检查自己写的R语句格式，比如有没有少括号之类的。