rpy2的安装和使用（踩坑）

创建环境后, 通过conda的r channel同时安装R和rpy2。

conda install -c r rpy2

当前环境下，可以通过启动R，install.packages("***")在当前环境下安装包。

其他的包在调用rpy2的时候，会出现R_HOME不存在或者已安装的R包无法被检测到的情况。

激活环境后, 创建环境变量：

export R_HOME=/home/***/anaconda3/envs/环境名/lib/R
export R_LIBS_USER=/home/***/anaconda3/envs/环境名/lib/R/library

检测我们的配置是否成功：

python -m rpy2.situation

注意：Calling 'R RHOME'应该与环境变量R_HOME一致。

此时我们再通过在命令行激活python：

>>>from rpy2.robjects.packages import importr
>>>importr("***") # 调用之前调用失败的R包

 我们在jupyter打开时，可能出现仍然无法成功调用R包的情况，因为jupyter打开时是默认使用Jupyter打开时激活环境的R，如果在jupyter内通过更换python核的方法，可能就会出现Calling 'R RHOME' 与环境变量R_HOME不一致的情况，所以使用jupyter时需要保证你的jupyter是从你安装了目标R包的环境中激活的！