perl应用:从NCBI提供的信息中获取需要的序列(下)use Scalar

101 篇文章 7 订阅
52 篇文章 0 订阅



use strict;
use warnings;

my $annotation =' ';
my $dna =' ';
my $record =' ';
my $save_input_separator =$/;

open (DNAFILENAME,'f:\\perl\\strawberry.gb')||die("can not open the file!");
$/ = "//\n";
$record = <DNAFILENAME>;
($annotation,$dna) = ($record=~/^(LOCUS.*ORIGIN\s*\n) (.*)\/\/\n/s);
print "$annotation \n\n\n$dna\n";

这里面关键就是用到了模式匹配:

($annotation,$dna) = ($record=~/^(LOCUS.*ORIGIN\s*\n) (.*)\/\/\n/s);

这一行表示,如果在$record中可以匹配到(Locus.*ORIGIN\s*\n)   和(.*)   那么就将第一个括号中的数值赋给$annotation,把第二个括号中匹配的内容赋给$dna.

另外一个就是$/这个变量的用法。

  • 1
    点赞
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值