卟啉是一种非常重要的化学物质,是血红素,叶绿素,血蓝素,维生素B12的核心结构,如果没有卟啉也许也可能有生命但肯定不是现在的样子。 如此神奇的物质到底是如何作用的,按照QSAR的原理,结构决定分子的一切,就用神经网络的反向传导原理去模拟卟啉的网络结构看看平衡态的单双键的键值到底是多少。
虽然很难说这么算出来的值和实际的化学物质的键值有什么联系,但是就像破译密码,去分析一下字母出现的频率对破译总是有帮助的。
将卟啉的分子旋转很容易观察到这种结构的高度对称性,根据这种对称性由神经网络的反向传导原理做出网络结构
这是至今为止用这种办法模拟的最复杂的分子,有38个原子,通过用原子反向传导的启动顺序来实现结构的对称性,
第一步:n31,c33,c34
第二步:c32,c35 ,h33,h31,h34
第三步:cb,cc
第四步:c25,c42,hcb,hcc
第五步:n21,n41,c24,c43
第六步:c23,c44,h24,h43
第七步:c22,c45,h23,h44
第八步:ca,cd
第九步:c12,c15,hca,hcd
第十步:c13,c14,n11
用这个顺序分10次启动着38个网络可以得到相对对称性比较强的结果,这个网络的计算速度很慢只收集了20组数据,也许数据再多些对称性还会更强
具体数据
fff31[0] | fff31[3] | fff31[k31-1] | fff32[0] | fff32[2] | fff32[3] | fff33[0] |
0.50019965 | 0.49999936 | 0.50003875 | 0.50048135 | 0.50032246 | 0.50042307 | 0.50010892 |
0.50010612 | 0.49999967 | 0.4998955 | 0.50003275 | 0.49995561 | 0.50000973 | 0.49954929 |
0.50000252 | 0.4999985 | 0.49967599 | 0.49989962 | 0.49898636 | 0.49921918 | 0.49977703 |
0.50042953 | 0.50341906 | 0.50020105 | 0.50094352 | 0.50075112 | 0.50073435 | 0.50018997 |
0.50004792 | 0.49999935 | 0.49987747 | 0.5001011 | 0.49989094 | 0.49987704 | 0.49993117 |
0.50115668 | 0.49999601 | 0.50016529 | 0.50000657 | 0.50021275 | 0.50006499 | 0.49986455 |
0.5000539 | 0.49999852 | 0.49997342 | 0.49990866 | 0.49985083 | 0.49979737 | 0.49978022 |
0.50004478 | 0.49999899 | 0.50006119 | 0.50023457 | 0.49987327 | 0.49987355 | 0.49986672 |
0.50002944 | 0.49999875 | 0.49999546 | 0.50022422 | 0.49991016 | 0.49984897 | 0.49981 |
0.49996945 | 0.49987321 | 0.50008228 | 0.49994547 | 0.50029236 | 0.50024357 | 0.50042444 |
0.50061788 | 0.49999895 | 0.50014232 | 0.49985192 | 0.50088449 | 0.5006523 | 0.49984362 |
0.49997235 | 0.49999943 | 0.50050985 | 0.49990911 | 0.50001606 | 0.49998451 | 0.50010931 |
0.49976872 | 0.49999749 | 0.49984323 | 0.50010407 | 0.49989588 | 0.49997081 | 0.49976063 |
0.50064954 | 0.49999926 | 0.49998032 | 0.49994929 | 0.50045048 | 0.50035429 | 0.49977302 |
0.50001121 | 0.49999954 | 0.50005306 | 0.50014886 | 0.50005381 | 0.50001695 | 0.49998713 |
0.50003148 | 0.49999973 | 0.49970092 | 0.49985557 | 0.49997962 | 0.49996956 | 0.49984922 |
0.50053 | 0.49999909 | 0.50014123 | 0.50007013 | 0.50010349 | 0.5000875 | 0.49990008 |
0.50073978 | 0.49999844 | 0.50005865 | 0.50018205 | 0.4999626 | 0.50011862 | 0.49996281 |
0.49997846 | 0.49999926 | 0.50002686 | 0.4995364 | 0.49995221 | 0.49999518 | 0.49990723 |
0.50031286 | 0.49999957 | 0.50008032 | 0.50008314 | 0.50031622 | 0.50027187 | 0.49991514 |
0.50023261 | 0.50016361 | 0.50002516 | 0.50007342 | 0.50008304 | 0.50007567 | 0.49991553 |
fff33[1] | fff33[k33-2] | fff35[2] | fff35[3] | fff35[k35-1] | fff34[1] | fffcb[0] |
0.50006506 | 0.49999942 | 0.50025393 | 0.5006656 | 0.50016661 | 0.49984494 | 0.50044868 |
0.49958234 | 0.49999958 | 0.49999794 | 0.49994297 | 0.50001034 | 0.49999937 | 0.50025687 |
0.49986515 | 0.49999856 | 0.49998205 | 0.50005606 | 0.49998829 | 0.49999847 | 0.50011179 |
0.50013178 | 0.49999741 | 0.5008465 | 0.5007784 | 0.50017728 | 0.49977348 | 0.50088464 |
0.49984447 | 0.49999914 | 0.50016527 | 0.50007667 | 0.50006144 | 0.49999919 | 0.50020863 |
0.49989821 | 0.49999593 | 0.5001718 | 0.50023535 | 0.5001552 | 0.49999634 | 0.50094277 |
0.49985058 | 0.4999985 | 0.50006598 | 0.4999732 | 0.50008298 | 0.49999855 | 0.50017652 |
0.49995062 | 0.49999913 | 0.49991282 | 0.50008138 | 0.49998608 | 0.4999993 | 0.50012143 |
0.49988395 | 0.49959695 | 0.49985779 | 0.49996588 | 0.50000778 | 0.49999895 | 0.50038103 |
0.500325 | 0.49982716 | 0.50022117 | 0.50047745 | 0.50050116 | 0.49999953 | 0.50032956 |
0.49993679 | 0.49935859 | 0.49994412 | 0.49990603 | 0.49997023 | 0.49999912 | 0.50136799 |
0.50015923 | 0.4999995 | 0.50000371 | 0.50008705 | 0.5001555 | 0.49996428 | 0.50031738 |
0.49985865 | 0.49999794 | 0.50008964 | 0.49994859 | 0.49988112 | 0.49999698 | 0.50059988 |
0.49986914 | 0.49974864 | 0.49985469 | 0.50004765 | 0.50008088 | 0.49999928 | 0.50021728 |
0.49997176 | 0.49999931 | 0.50013645 | 0.50013885 | 0.50002452 | 0.49999962 | 0.50032392 |
0.49989511 | 0.4998048 | 0.50001424 | 0.50000602 | 0.49987978 | 0.49999968 | 0.50016511 |
0.49999887 | 0.49986126 | 0.49999536 | 0.49992045 | 0.50002578 | 0.4999994 | 0.49973779 |
0.49986386 | 0.49987657 | 0.50012103 | 0.50000727 | 0.50022788 | 0.49999827 | 0.49946778 |
0.4999935 | 0.4995214 | 0.49996289 | 0.50002233 | 0.49999887 | 0.49999904 | 0.50061912 |
0.49998683 | 0.49986337 | 0.50002062 | 0.49999628 | 0.50003708 | 0.49999971 | 0.50023305 |
0.49994655 | 0.49987216 | 0.5000809 | 0.50011667 | 0.50007094 | 0.49997817 | 0.50034556 |
fffcb[1] | fffcc[kcc-1] | fffcc[kcc-2] | fff23[0] | fff23[1] | fff23[k23-2] | fff23[k23-1] |
0.49999915 | 0.50073138 | 0.49999922 | 0.50040289 | 0.50043833 | 0.4999995 | 0.50007386 |
0.49999962 | 0.50007961 | 0.49999948 | 0.49993656 | 0.49997129 | 0.49950055 | 0.50005679 |
0.49999969 | 0.50001437 | 0.49999868 | 0.50003959 | 0.50007342 | 0.49999844 | 0.50009282 |
0.49999643 | 0.50001733 | 0.49999625 | 0.5008443 | 0.50085125 | 0.49999682 | 0.50142912 |
0.49999895 | 0.50088103 | 0.49999914 | 0.49995281 | 0.49991245 | 0.49980069 | 0.49997439 |
0.49999558 | 0.50012657 | 0.49999711 | 0.50022333 | 0.50016094 | 0.4999964 | 0.49988615 |
0.49999869 | 0.50022729 | 0.49999882 | 0.49991694 | 0.4998907 | 0.49958297 | 0.49993646 |
0.49999945 | 0.49992766 | 0.49999931 | 0.49993298 | 0.4998538 | 0.49960473 | 0.50001209 |
0.49999877 | 0.50005185 | 0.49999829 | 0.50005504 | 0.50014444 | 0.4996862 | 0.50020586 |
0.49999949 | 0.49998917 | 0.49999953 | 0.50020001 | 0.50023592 | 0.4999996 | 0.50008233 |
0.49911899 | 0.49989181 | 0.49999908 | 0.5000246 | 0.50004223 | 0.49999902 | 0.50002788 |
0.49999941 | 0.50013054 | 0.49993168 | 0.50041392 | 0.50027112 | 0.49999957 | 0.50047726 |
0.4999969 | 0.49991814 | 0.49999812 | 0.50056221 | 0.5006461 | 0.49999692 | 0.50012349 |
0.49999893 | 0.50128043 | 0.4999993 | 0.50025034 | 0.50021646 | 0.49999891 | 0.50010424 |
0.49999966 | 0.50067906 | 0.49999955 | 0.5000392 | 0.50014251 | 0.49999951 | 0.50036009 |
0.49999962 | 0.49980864 | 0.49999973 | 0.50007426 | 0.49997496 | 0.49984161 | 0.49992156 |
0.49986741 | 0.49998809 | 0.49999914 | 0.49990143 | 0.49987844 | 0.49999913 | 0.50003671 |
0.4995979 | 0.50008517 | 0.49999866 | 0.50013036 | 0.50008033 | 0.49999833 | 0.50016058 |
0.49999901 | 0.50122336 | 0.49999919 | 0.50000631 | 0.50001812 | 0.49962438 | 0.49990265 |
0.49999971 | 0.50080529 | 0.4999996 | 0.50027203 | 0.5001783 | 0.49999962 | 0.50036147 |
0.49992817 | 0.50029284 | 0.49999549 | 0.50015896 | 0.50014906 | 0.49988115 | 0.50016129 |
fff22[2] | fff22[3] | fff22[k22-1] | fff25[0] | fff25[1] | fff25[k25-1] | fff24[1] |
0.49992617 | 0.49989369 | 0.50010548 | 0.5000196 | 0.5000264 | 0.50043152 | 0.49999944 |
0.50026909 | 0.50036236 | 0.50084211 | 0.49988071 | 0.49990175 | 0.50024929 | 0.49999964 |
0.4998901 | 0.49984563 | 0.49931961 | 0.50012875 | 0.50026516 | 0.50011945 | 0.50281136 |
0.50056616 | 0.50071765 | 0.50162348 | 0.50011622 | 0.50024094 | 0.50085211 | 0.49999548 |
0.4999439 | 0.50003387 | 0.50058948 | 0.49987269 | 0.49991388 | 0.50018269 | 0.49999896 |
0.49993821 | 0.4998576 | 0.49956177 | 0.50111962 | 0.50141685 | 0.50093453 | 0.50361099 |
0.50033323 | 0.50057982 | 0.50038767 | 0.49894098 | 0.49834126 | 0.50006932 | 0.49999828 |
0.50048478 | 0.50033193 | 0.50025575 | 0.49840564 | 0.49856365 | 0.50006533 | 0.499999 |
0.50066482 | 0.50054869 | 0.50117947 | 0.50021016 | 0.50027769 | 0.50037132 | 0.49999884 |
0.49993777 | 0.50000134 | 0.50008677 | 0.5000354 | 0.50000781 | 0.50031343 | 0.49999954 |
0.49977988 | 0.499753 | 0.50024421 | 0.50020346 | 0.50043235 | 0.50134989 | 0.50246726 |
0.50027269 | 0.50030586 | 0.50010064 | 0.49993845 | 0.50005384 | 0.50031622 | 0.49999962 |
0.49987256 | 0.50001043 | 0.50013767 | 0.50018258 | 0.50016619 | 0.50058406 | 0.49999808 |
0.49997636 | 0.49993806 | 0.5000449 | 0.50001943 | 0.5000611 | 0.50019331 | 0.49999884 |
0.50020027 | 0.5002892 | 0.50008556 | 0.49994761 | 0.49996279 | 0.50031366 | 0.4988074 |
0.50020502 | 0.50029231 | 0.50035448 | 0.50004077 | 0.50003246 | 0.50015676 | 0.49999955 |
0.49998177 | 0.50004386 | 0.50017051 | 0.50005986 | 0.50006146 | 0.49974755 | 0.49965503 |
0.49989585 | 0.49994097 | 0.50008219 | 0.49990466 | 0.49988534 | 0.49947531 | 0.50283988 |
0.50035826 | 0.50055529 | 0.5002116 | 0.49974637 | 0.49976497 | 0.50061856 | 0.49999898 |
0.50021103 | 0.50019332 | 0.50010669 | 0.49956958 | 0.49961353 | 0.50022776 | 0.49999964 |
0.5001354 | 0.50017474 | 0.5002745 | 0.49991713 | 0.49994947 | 0.5003286 | 0.50050879 |
fff43[0] | fff43[1] | fff43[k43-2] | fff43[k43-1] | fff41[0] | fff41[1] | fff41[k41-1] |
0.49997106 | 0.5000213 | 0.49971931 | 0.49992479 | 0.50072746 | 0.50083917 | 0.49968088 |
0.50029626 | 0.50044224 | 0.49999955 | 0.50017573 | 0.50012413 | 0.50010448 | 0.50010565 |
0.49994049 | 0.49985167 | 0.49999798 | 0.49996012 | 0.50033869 | 0.50055936 | 0.50027846 |
0.50053196 | 0.50054944 | 0.4999964 | 0.49994252 | 0.50057464 | 0.50049491 | 0.50058502 |
0.49993888 | 0.49999225 | 0.49941118 | 0.49959321 | 0.50049813 | 0.50062439 | 0.50054859 |
0.50100501 | 0.50107215 | 0.49999538 | 0.50028318 | 0.50052636 | 0.50042154 | 0.50044409 |
0.50049902 | 0.50049526 | 0.4999987 | 0.4999205 | 0.50035989 | 0.50024596 | 0.50020299 |
0.5001435 | 0.50006338 | 0.49999926 | 0.49996017 | 0.50017791 | 0.5001548 | 0.50017397 |
0.50009072 | 0.50004057 | 0.49999875 | 0.50000425 | 0.50046308 | 0.50046066 | 0.50059627 |
0.49995016 | 0.50004745 | 0.499177 | 0.49907509 | 0.50026593 | 0.50018547 | 0.50015502 |
0.50055341 | 0.50047726 | 0.49999856 | 0.50014116 | 0.50025657 | 0.50028526 | 0.50020624 |
0.50045895 | 0.5004191 | 0.49999957 | 0.50048557 | 0.500311 | 0.50039287 | 0.50033015 |
0.50077521 | 0.50069712 | 0.49999777 | 0.50006397 | 0.50030001 | 0.50033105 | 0.50029139 |
0.5000031 | 0.49997521 | 0.49965745 | 0.49943978 | 0.50018407 | 0.4998656 | 0.49977361 |
0.50027239 | 0.50021373 | 0.49999945 | 0.5004268 | 0.5001096 | 0.49989828 | 0.50004256 |
0.50003337 | 0.50004132 | 0.4999177 | 0.49979565 | 0.50019766 | 0.50023264 | 0.50013589 |
0.50035891 | 0.50031288 | 0.49999941 | 0.50007948 | 0.50019742 | 0.50022202 | 0.50025759 |
0.50003675 | 0.50007735 | 0.49999869 | 0.50013593 | 0.50062461 | 0.50048221 | 0.50046413 |
0.50008891 | 0.50001298 | 0.49967727 | 0.49989978 | 0.5010638 | 0.50077961 | 0.50017017 |
0.4999921 | 0.50008221 | 0.49960687 | 0.4997475 | 0.50010692 | 0.49989845 | 0.49992292 |
0.50024701 | 0.50024424 | 0.49985731 | 0.49995276 | 0.50037039 | 0.50032394 | 0.50021828 |
fff45[2] | fff45[3] | fff45[k45-1] | fff44[1] | fffca[0] | fffca[1] | fffcd[kcd-1] |
0.49996633 | 0.50006436 | 0.49985917 | 0.49999931 | 0.50031605 | 0.4999993 | 0.49987055 |
0.50011105 | 0.50011398 | 0.4998191 | 0.49999947 | 0.50032817 | 0.49999965 | 0.49999359 |
0.49968582 | 0.49997216 | 0.50023153 | 0.49978231 | 0.5004906 | 0.49999881 | 0.49996756 |
0.49987465 | 0.500059 | 0.50129321 | 0.49999691 | 0.50086156 | 0.49842741 | 0.50007455 |
0.50008382 | 0.50001283 | 0.50006541 | 0.49999911 | 0.49981409 | 0.49982699 | 0.50002393 |
0.49992609 | 0.50018966 | 0.50007258 | 0.49999721 | 0.50065531 | 0.49999682 | 0.49999379 |
0.50018118 | 0.50008648 | 0.50002576 | 0.49999857 | 0.50056506 | 0.49999847 | 0.49973498 |
0.50007352 | 0.50012303 | 0.49905665 | 0.49899029 | 0.50032759 | 0.49999907 | 0.49994671 |
0.49989926 | 0.5000607 | 0.50010489 | 0.49972002 | 0.50052037 | 0.49999837 | 0.50007799 |
0.50002909 | 0.49999735 | 0.4999068 | 0.49999954 | 0.50027719 | 0.49999961 | 0.4998546 |
0.50014378 | 0.50009536 | 0.49960663 | 0.49999886 | 0.50043137 | 0.49999898 | 0.49989525 |
0.50018819 | 0.49993146 | 0.49941147 | 0.49999964 | 0.50018834 | 0.4999994 | 0.49987623 |
0.49986169 | 0.49991328 | 0.49982653 | 0.49999725 | 0.5004574 | 0.49999766 | 0.49937213 |
0.50002925 | 0.50006435 | 0.50004791 | 0.499999 | 0.50031794 | 0.499999 | 0.49986168 |
0.50001201 | 0.50000082 | 0.49998205 | 0.49999957 | 0.50060691 | 0.49999949 | 0.4998989 |
0.49999527 | 0.50003528 | 0.50003613 | 0.49999965 | 0.5001794 | 0.49999907 | 0.50048386 |
0.50002863 | 0.50007962 | 0.50004981 | 0.49999939 | 0.50045939 | 0.49999928 | 0.49949244 |
0.50013691 | 0.49979306 | 0.50028974 | 0.49957603 | 0.50033612 | 0.49999838 | 0.49984085 |
0.49999836 | 0.50002775 | 0.50004129 | 0.49999875 | 0.50075727 | 0.49999904 | 0.50000007 |
0.50000969 | 0.50005036 | 0.50002828 | 0.49999971 | 0.50012856 | 0.4999996 | 0.49994021 |
0.50001173 | 0.50003354 | 0.49998775 | 0.49990253 | 0.50040094 | 0.49991172 | 0.49990999 |
fffcd[kcd-2] | fff13[0] | fff13[1] | fff13[k13-2] | fff13[k13-1] | fff11[0] | fff11[3] |
0.49999922 | 0.5004933 | 0.4999993 | 0.49998591 | 0.50007549 | 0.50029879 | 0.49999936 |
0.49999949 | 0.50028044 | 0.49999957 | 0.49988437 | 0.49990008 | 0.50031679 | 0.49999942 |
0.49953307 | 0.50026401 | 0.50277956 | 0.50009305 | 0.50016632 | 0.50049142 | 0.49999851 |
0.49999643 | 0.50006157 | 0.49999612 | 0.50019271 | 0.50027622 | 0.50083577 | 0.4999971 |
0.49999925 | 0.50043567 | 0.49999919 | 0.49994416 | 0.49987041 | 0.49982186 | 0.49999921 |
0.49999677 | 0.50091405 | 0.49999645 | 0.49979665 | 0.49977624 | 0.50061919 | 0.49999585 |
0.4999988 | 0.50068305 | 0.49999839 | 0.50012808 | 0.50011691 | 0.50052059 | 0.49999862 |
0.49999934 | 0.50048616 | 0.49999903 | 0.49999819 | 0.50008455 | 0.50031137 | 0.49999924 |
0.49964084 | 0.50062664 | 0.49999829 | 0.50011285 | 0.50001105 | 0.50050133 | 0.49999894 |
0.4999996 | 0.50032619 | 0.49999958 | 0.50006047 | 0.50002944 | 0.50026452 | 0.49999939 |
0.49999871 | 0.50045614 | 0.49999904 | 0.49998842 | 0.50001623 | 0.50039865 | 0.49999888 |
0.49999957 | 0.49994903 | 0.49999958 | 0.50005089 | 0.50003174 | 0.50017595 | 0.49999954 |
0.49999704 | 0.50084742 | 0.49999696 | 0.50023996 | 0.49994657 | 0.50044015 | 0.49999774 |
0.4999993 | 0.49987357 | 0.49999902 | 0.50003703 | 0.50003293 | 0.50029987 | 0.49999911 |
0.49999948 | 0.50043561 | 0.49999963 | 0.50019062 | 0.50023792 | 0.50060331 | 0.49999959 |
0.49999957 | 0.50000763 | 0.49999968 | 0.49998734 | 0.49997155 | 0.50016754 | 0.49999964 |
0.49999924 | 0.50028011 | 0.49999907 | 0.49993145 | 0.50002786 | 0.50044911 | 0.49999929 |
0.49975496 | 0.49999903 | 0.49999848 | 0.50003359 | 0.50009362 | 0.50031033 | 0.49999806 |
0.49999892 | 0.50050408 | 0.4999991 | 0.49956865 | 0.49979302 | 0.50073476 | 0.4999992 |
0.49999963 | 0.50023114 | 0.49999969 | 0.49998138 | 0.50000761 | 0.50011775 | 0.49999955 |
0.49994546 | 0.50035774 | 0.50013779 | 0.50001029 | 0.50002329 | 0.50038395 | 0.49999881 |
fff11[k11-1] | fff14[0] | fff14[1] | fff14[k14-2] | 迭代次数 |
0.49971593 | 0.50000549 | 0.5000339 | 0.49999936 | 44108166 |
0.49998395 | 0.50001542 | 0.50001887 | 0.49999949 | 66937874 |
0.50005091 | 0.50044628 | 0.50063103 | 0.49999817 | 18384926 |
0.50085759 | 0.50016079 | 0.49975235 | 0.49965013 | 9723685 |
0.49997969 | 0.49989575 | 0.49987961 | 0.49999911 | 36257843 |
0.49926504 | 0.49992108 | 0.50012411 | 0.49999741 | 8300326 |
0.49987796 | 0.50003816 | 0.50012632 | 0.49999885 | 19494573 |
0.49992699 | 0.50010562 | 0.4999931 | 0.49999901 | 35411263 |
0.50061301 | 0.50056219 | 0.50057442 | 0.49999868 | 22619520 |
0.49979945 | 0.50005131 | 0.4999224 | 0.4999995 | 56931165 |
0.49966922 | 0.50011232 | 0.50007893 | 0.49999869 | 25758383 |
0.50002018 | 0.49967318 | 0.49976008 | 0.49962138 | 59195356 |
0.49928664 | 0.50022612 | 0.50014007 | 0.4999968 | 12364981 |
0.49986298 | 0.4994961 | 0.49971089 | 0.49944753 | 34545786 |
0.49990148 | 0.50001138 | 0.50004109 | 0.49999966 | 67322789 |
0.50033006 | 0.50006437 | 0.49985019 | 0.49988136 | 83398458 |
0.49986927 | 0.5006338 | 0.50056939 | 0.49999942 | 39325217 |
0.50042237 | 0.49998445 | 0.50011196 | 0.49948588 | 17928160 |
0.50003741 | 0.49998486 | 0.49998489 | 0.4999992 | 29406931 |
0.49983431 | 0.50001848 | 0.50000822 | 0.49999971 | 89129362 |
0.49996522 | 0.50007036 | 0.50006559 | 0.49990347 | 38827238.2 |