推荐:graph2vec - 深度学习图表示框架
1、项目介绍
graph2vec
是一个基于 TensorFlow 的开源实现,它源自论文 "graph2vec: Learning distributed representations of graphs"。该项目旨在通过深度学习方法为无向图学习分布式表示,从而在各种图数据分析任务中发挥作用。提供了从根节点到子图的weisfeiler-lehman(WL)核计算,以及使用skipgram模型训练图嵌入的完整流程。
2、项目技术分析
graph2vec
使用了 TensorFlow 1.4.0 版本作为基础深度学习库,支持对无向图进行操作。它依赖于 NetworkX 进行图的构建和处理,以及 Scikit-Learn 和其相关的科学计算包(Scipy, Numpy)。项目采用的主要算法是 skipgram 模型,该模型以图的WL核产生的根节点子图为基础,学习图的低维嵌入表示。
运行该项目需要执行一系列步骤,包括:
- 获取并解压代码库。
- 准备数据,确保所需的数据集位于指定目录下。
- 在
src
目录下运行main.py
脚本,以生成子图,学习图嵌入,并进行图分类。
此外,main.py
支持多个命令行参数,用于调整批大小、嵌入维度、负采样数量、学习率等超参数,以适应不同的应用需求或优化性能。
3、项目及技术应用场景
graph2vec
可广泛应用于以下场景:
- 图分类:利用学习到的图嵌入,可以将图分配给预定义的类别,例如化学分子结构分类。
- 图聚类:通过对图的嵌入进行聚类,发现图数据中的隐藏模式。
- 图相似性检索:对于给定的一组图,寻找最相似的图对于搜索引擎和推荐系统非常重要。
4、项目特点
- 易于使用:项目提供清晰的指南和可配置的命令行选项,使得设置和运行变得简单。
- 强大的表示学习:通过 WL 核与 skipgram 结合,能够捕捉复杂的图结构信息。
- 灵活性:支持自定义超参数,适用于各种规模和复杂性的图数据集。
- 兼容性:基于 Python 2.7 实现,能够在 Ubuntu 16.04 上稳定运行。
如果您正在寻找一种高效的方法来处理和理解图数据,graph2vec
提供了一个强大且灵活的工具。无论您是研究者还是开发者,都值得尝试这个项目,并将其纳入您的图分析工具箱。
引用该项目时,请参考以下论文:
@article{narayanangraph2vec,
title={graph2vec: Learning distributed representations of graphs},
author={Narayanan, Annamalai and Chandramohan, Mahinthan and Venkatesan, Rajasekar and Chen, Lihui and Liu, Yang}
}
欲了解更多详情,可以直接访问项目仓库:https://github.com/MLDroid/graph2vec_tf