SimpleNN 开源项目教程

SimpleNN 开源项目教程

SimpleNN项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SimpleNN

项目介绍

SimpleNN 是一个用于构建神经网络原子间势能的开源软件包。它基于 Behler-Parrinello 类型的神经网络，可以从第一性原理数据中构建原子间势能。该软件包提供了一个与 LAMMPS 接口的模块，用于进行分子动力学模拟。

项目快速启动

安装

首先，克隆项目仓库到本地：

git clone https://github.com/ArtemOnigiri/SimpleNN.git
cd SimpleNN

安装所需的依赖项：

pip install -r requirements.txt

运行示例

以下是一个简单的示例，展示如何使用 SimpleNN 进行训练：

import simplenn

# 加载数据
data = simplenn.load_data('path/to/data')

# 定义模型
model = simplenn.Model()

# 训练模型
model.train(data)

应用案例和最佳实践

案例一：硅氧化合物模拟

在硅氧化合物模拟中，SimpleNN 可以用于构建原子间势能，从而进行分子动力学模拟。以下是一个具体的应用案例：

# 加载硅氧化合物数据
data = simplenn.load_data('path/to/SiO2_data')

# 定义模型
model = simplenn.Model(symmetry_functions='SiO2')

# 训练模型
model.train(data)

# 进行分子动力学模拟
sim = simplenn.Simulation(model)
sim.run('path/to/SiO2_structure', steps=1000)

最佳实践

1. 数据预处理：确保输入数据的质量和完整性，这对于模型的训练至关重要。
2. 参数调优：根据具体应用场景调整模型参数，以获得最佳性能。
3. 并行计算：利用并行计算资源加速训练过程。

典型生态项目

LAMMPS 接口

SimpleNN 提供了一个与 LAMMPS 接口的模块，使得用户可以在 LAMMPS 中使用 SimpleNN 构建的势能进行分子动力学模拟。

数据处理工具

SimpleNN 生态系统中还包括一些数据处理工具，用于数据的预处理和后处理，提高数据的质量和可用性。

通过以上模块的介绍和示例，用户可以快速上手并应用 SimpleNN 进行原子间势能的构建和分子动力学模拟。

SimpleNN项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SimpleNN