SISSO 开源项目使用教程

SISSO 开源项目使用教程

项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SISSO

1. 项目介绍

SISSO（Sure Independence Screening and Sparsifying Operator）是一个数据驱动的算法，结合了符号回归和压缩感知技术，用于构建准确且可解释的模型。该算法由欧阳润海等人开发，最初用于材料设计领域，但也可以作为一种纯应用数学方法应用于其他回归问题。SISSO 通过用户提供的特征和目标值，自动筛选出对目标值贡献最大的描述子，从而实现特征的自动构造和高性能筛选。

2. 项目快速启动

2.1 环境准备

在开始使用 SISSO 之前，请确保您的系统已安装以下依赖：

• Fortran 编译器（如 gfortran）
• MPI（可选，用于并行计算）

2.2 下载与编译

1. 克隆 SISSO 项目到本地：

   git clone https://github.com/rouyang2017/SISSO.git
   cd SISSO
   

2. 编译 SISSO 程序：

   make
   

2.3 配置与运行

1. 准备输入文件 SISSO.in 和 train.dat，模板可以在 input_templates 文件夹中找到。

2. 运行 SISSO 程序：

   ./SISSO > log
   

3. 查看输出文件 SISSO.out 和 Models 文件夹中的模型结果。

3. 应用案例和最佳实践

3.1 材料设计

SISSO 最初应用于材料设计领域，通过筛选出对材料性能有显著影响的描述子，帮助研究人员快速找到最佳材料组合。例如，通过 SISSO 筛选出的描述子可以用于预测新材料的电导率、热导率等物理性质。

3.2 回归问题

SISSO 不仅限于材料设计，还可以应用于其他回归问题。例如，在金融领域，SISSO 可以用于筛选出对股票价格有显著影响的特征，从而帮助投资者做出更明智的决策。

3.3 最佳实践

• 数据预处理：在使用 SISSO 之前，确保数据已经过适当的预处理，如归一化、缺失值处理等。
• 参数调优：根据具体问题调整 SISSO 的参数，如 desc_dim（描述子维度）、nsample（样本数量）等。
• 模型验证：使用交叉验证等方法验证模型的泛化能力，确保模型在不同数据集上的表现一致。

4. 典型生态项目

4.1 Jupyter Notebook

SISSO 可以在 Jupyter Notebook 中使用，通过 Bash 命令调用 SISSO 程序，并结合 Python 进行数据分析和可视化。

4.2 并行计算

对于大规模数据集，可以使用 MPI 并行计算来加速 SISSO 的运行。通过 mpirun 命令调用 SISSO 程序，可以显著提高计算效率。

4.3 数据处理工具

结合其他数据处理工具，如 Pandas、NumPy 等，可以更方便地进行数据预处理和结果分析。

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通过本教程，您应该能够快速上手使用 SISSO 项目，并了解其在不同领域的应用案例和最佳实践。希望 SISSO 能够帮助您在数据驱动的模型构建中取得更好的成果。

SISSO A data-driven method combining symbolic regression and compressed sensing for accurate & interpretable models. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SISSO