开源项目 phy 使用教程

开源项目 phy 使用教程

phyphy: interactive visualization and manual spike sorting of large-scale ephys data项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ph/phy

1. 项目的目录结构及介绍

phy 项目的目录结构如下：

phy/
├── CHANGELOG.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── docs/
├── phy/
│   ├── __init__.py
│   ├── cluster/
│   ├── gui/
│   ├── io/
│   ├── plot/
│   ├── stats/
│   ├── template/
│   ├── utils/
│   └── version.py
├── requirements.txt
├── setup.py
└── tests/

主要目录和文件介绍：

• CHANGELOG.md: 项目更新日志。
• CONTRIBUTING.md: 贡献指南。
• LICENSE: 项目许可证。
• MANIFEST.in: 打包清单文件。
• README.md: 项目介绍和使用说明。
• docs/: 项目文档目录。
• phy/: 项目核心代码目录。
  • __init__.py: 初始化文件。
  • cluster/: 聚类相关代码。
  • gui/: 图形用户界面相关代码。
  • io/: 输入输出相关代码。
  • plot/: 绘图相关代码。
  • stats/: 统计相关代码。
  • template/: 模板相关代码。
  • utils/: 工具函数相关代码。
  • version.py: 版本信息文件。
• requirements.txt: 项目依赖文件。
• setup.py: 安装脚本。
• tests/: 测试代码目录。

2. 项目的启动文件介绍

phy 项目的启动文件主要是 phy/gui/gui.py。这个文件包含了启动图形用户界面的主要逻辑。用户可以通过运行这个文件来启动 phy 的图形界面。

python -m phy.gui.gui

3. 项目的配置文件介绍

phy 项目的配置文件主要是 phy_config.py。这个文件用于配置 phy 的行为和参数。用户可以根据自己的需求修改这个文件中的配置项。

配置文件示例：

# phy_config.py

# 配置示例
from phy import IPlugin

class MyPlugin(IPlugin):
    def attach_to_controller(self, controller):
        # 在这里添加自定义配置
        pass

用户可以将这个文件放置在当前工作目录或者 ~/.phy 目录下，phy 会自动加载这个配置文件。

phyphy: interactive visualization and manual spike sorting of large-scale ephys data项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ph/phy