介绍一些医药研发中常用的数据库,网址及说明如下,欢迎取用: 数据资源简介网址说明1PDB蛋白质序列及结构数据库RCSB PDB: Homepage蛋白相关类2PDBsum与PDB数据库类似,更便于查询蛋白配体相互作用信息PDBsum home page3Uniprot 关于蛋白质的全部信息UniProt4STRING蛋白互相作用关系的数据库https://string-db.org/5STITCH化合物与蛋白质之间的互作关系STITCH: chemical association networks化合物-靶点类6BindingDB药物靶点的蛋白质与小的药物样分子的相互作用Binding Database Home7drug2gene化合物-靶标为中心的数据库Gene2drug8GEO DataSets基因表达数据集https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/基因相关类9NCBI Gene关于基因的全面信息https://ncbi.nlm.nih.gov/gene10Ensembl关于基因的全面信息Ensembl genome browser 10811Connectivity map (Cmap)细胞被化合物处理前后的基因表达数据集GEO Accession viewer12GTExPortal不同靶点在不同的组织中的表达量GTEx Portal13reactome蛋白通路数据库Home - Reactome Pathway Database通路14WikiPathways公共管理的通路数据库WikiPathways - WikiPathways15Pathway Commons通路元数据库Pathway Commons: A Resource for Biological Pathway Analysis16KEGG通路数据库KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes17PubChem有机小分子生物活性数据PubChem化合物类18DrugBank药品类型,简介,化学结构,成分,临床实验,药物靶点等https://go.drugbank.com/19ChEMBL生化活性数据库ChEMBL Database20ChemBank生化活性数据库ChemBank - view assays21Ligand ExpoPDB中结合的配体数据集Ligand Expo Downloads22ChemSpider化合物性质ChemSpider | Search and share chemistry23ZINC免费的化合物虚拟筛选数据库ZINC24ClinicalTrials临床试验数据库Home - ClinicalTrials.gov其它25ReDO_DB老药新用相关数据库ReDO_DB - Drug Repurposing Database | Anticancerfund26CLUE THE DRUG REPURPOSING HUB老药新用相关数据库THE DRUG REPURPOSING HUB27OMIM孟德尔疾病目录https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim28Achilles肿瘤细胞系的RNAi筛选DepMap: The Cancer Dependency Map Project at Broad Institute29CTD2化合物探针集对肿瘤细胞系的作用http://www.ctd2.nci.nih.gov/30PhenomicDB表型-疾病关系的元数据库PhenomicDB: a multi-species genotype/phenotype database for comparative phenomics | Bioinformatics | Oxford Academic31opentargets靶标-疾病相关性证据的数据库Home - Open Targets32GWAS Catalog基因单核苷酸多态性与疾病关系的目录GWAS Catalog33HuGe Navigator基因-疾病联系HuGE Navigator|Home|PHGKB34CCLE肿瘤细胞系百科全书Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)35TCGA肿瘤患者的基因组信息The Cancer Genome Atlas Program - NCI