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Part.I Introduction
本文主要记录一下笔者使用 GSL 过程当中所做的一些笔记。
Chap.I 传送门
一些传送门
Chap.II GSL 简介
GSL 全称 GNU Scientific Library,即 GNU 科学计算库。GNU 是什么东西呢?GNU 是一个自由的操作系统,其内容软件完全以 GPL 方式发布。GPL 又是什么东西?不要急~要想理解GNU 操作系统,必须先了解 GUN Project ,GNU计划、GNU项目,随你怎么翻译好了…… 它又被译为 革奴计划 ,是一个自由软件集体协作计划,1983年9月27日由理查德·斯托曼在麻省理工学院公开发起。它的目的是创建一套完全自由的操作系统,称为GNU1。GNU 全称 GNU’s Not Unix!
,递归定义缩写。
GPL 的全称是 GNU General Public License ,被翻译为 GNU通用公共许可协议 ,缩写为 GPL 或 GNU GPL ,说到底,这只不过是一个协议系列,那这一系列协议有啥特点呢?它有两个特点(copyleft):
- 一方面,它给予了用户充分的自由,允许用户 运行、学习、共享和修改软件 ;
- 而另一方面,它死死限制了用户的一个方面的自由,那就是:GPL的派生作品只能以相同的许可证 发布 。这两个特点结合起来翻译成人话就是“软件随便用,源码也给你,随你怎么copy怎么修改,这都是你的自由,但是!你不能将大家伙的劳动成果变成你一个人私有的!”
就简单将 GNU 理解为一个项目,在这个项目中需要遵守 GPL 协议,即可以运行、学习、共享和修改 GNU 项目中的软件,但是不能据为己有。而 GSL 就是 GNU 中的一个项目,它是一个数学相关的科学计算库。
Part.II GSL 编译与安装
因为笔者使用的是 Windows 系统,在 Windows 下可以使用 『MSYS2 + Visual Studio』 对 GSL 进行安装和编译,也可以使用『CMake + Visual Studio』 对 GSL 进行安装和编译。前者已经有前辈写好了教程,下面主要针对后者的操作进行一下记录。
Chap.I GSL 的编译
这一步的目的是生成 GSL 动态库。
首先安装 cmake,VS等,然后需要查看 cmake 的路径是否添加到了系统变量path
中。方法:我的电脑→右键属性→高级系统设置→环境变量→系统变量→path→添加 cmake.exe
的路径进去
下载最新版 gsl-2.7。然后解压,在gsl-master
目录下新建build
文件夹
在build
文件夹上方输入 cmd
,进入 Windows cmd.exe
程序:
然后生成动态库,输入指令:
cmake -G"Visual Studio 16 2019" -DGSL_INSTALL_MULTI_CONFIG=ON -DNO_AMPL_BINDINGS=1 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=%cd%/install -DBUILD_SHARED_LIBS=ON -DMSVC_RUNTIME_DYNAMIC=ON A:/downloads/gsl-master
注意:最后的路径是你自己的路径哦,Visual Studio 16 2019
也需要根据你自己本地的 VS 版本更改。之后得到了这样的一些文件
然后 编译gsl,继续在cmd
中输入:
cmake --build . --config Release --target install
// 生成 Release 版本的库
cmake --build . --config Debug --target install
// 生成 Debug 版本的库(不必)
得到所需文件
最后得到的文件树如下:
gsl
├─bin
│ ├─Debug
│ └─Release
├─include
│ └─gsl
└─lib
├─cmake
│ └─gsl-2.7
├─Debug
├─pkgconfig
└─Release
好像 Release
版本和 Debug
版本得到的东西是一样的。第二部分将介绍如何使用得到的这些库。
其实除了得到的库之外,我们已经生成了一个 GSL 项目,它包含了 GSL 所有的源码以及丰富的实例,如果要看 GSL 中的函数实现方式可以build
文件夹下找到 GSL.sln
文件,双击打开它(用 VS Studio 打开的),就可以看到这样的项目框架:
我们可以简单测试一下,将第一个test
项目即test/block_test
设为启动项目,然后运行,看到可以顺利运行!具体的到底运行了什么,可以细看一下~
下面部分将介绍如何使用生成的 GSL 库,或者说,如何将 GSL 融入自己的项目中。
Chap.II 基于 VS 可视化操作的使用
新建一个项目,然后依次加入『附加包含目录』、『附加库目录』、『附加依赖项』
// 附加包含目录
A:\aWork\third-party\gsl\include
// 附加库目录
A:\aWork\third-party\gsl\lib\Release
// 附加依赖项
gsl.lib
gslcblas.lib
注意:dll
文件要加到工程目录,或者将其路径加入环境变量。
注意:如果一个项目要依赖其他项目,可以 选中项目→右键『属性』→VC++ 目录→包含目录和库目录把 GSL 的路径添加进去。
测试代码如下:
#include <stdio.h>
#include <gsl/gsl_matrix.h>
int main(void)
{
int i, j;
gsl_matrix* m = gsl_matrix_alloc(3, 3);
for (i = 0; i < 3; i++) {
for (j = 0; j < 3; j++) {
gsl_matrix_set(m, i, j, i + j);
}
}
for (i = 0; i < 3; i++) {
for (j = 0; j < 3; j++) {
printf("m(%d,%d) = %g\n", i, j, gsl_matrix_get(m, i, j));
}
}
gsl_matrix_free(m);
return 0;
}
运行结果如下:
Chap.III 基于 CMake 的使用
基于 CMake 的使用其实和上面的差不多,就是“ 加入『附加包含目录』、『附加库目录』、『附加依赖项』”这几步操作变成了 CMake 语句,主要的语句为:
CMake | 含义 | VS 操作 |
---|---|---|
include_directories / target_include_directories | 附加包含目录 | VS 右键『属性』→『C/C++』→『常规』→『附加包含目录』 |
link_directories / target_link_directories | 附加库目录 | VS 右键『属性』→『链接器』→『常规』→『附加库目录』 |
link_libraries / target_link_libraries | 附加依赖项 | VS 右键『属性』→『链接器』→『输入』→『附加依赖项』 |
最好用 target_xx ,因为它只会影响当前 target,而另一个会影响所有的 target。
因为文件比较多,不方便都放上来,感兴趣的朋友可以戳我下载,文件树如下:
.
─app_test
│ ├─TEMP_TestGSL
│ └─TEMP_TestPython
├─LibGSL
│ ├─example
│ └─gexport
├─LibPython
│ ├─example
│ │ └─__pycache__
│ └─gexport
└─_doc
使用教程压缩包里有,另外也开了一篇博文介绍。
Part.III GSL 内置分布
Chap.I 一些常量
GSL_POSINF // +∞
GSL_NEGINF // -∞
GSL_NAN // NAN
GSL_POSZERO // +0
GSL_NEGZERO // -0
M_PI // PI
Chap.I gamma 分布
需包含头文件
#include <gsl/gsl_sf.h>
gsl_sf_gamma(a)
,计算得到 Γ ( a ) \Gamma(a) Γ(a), a a a 要大于 0gsl_sf_gamma_inc(a,x)
,计算得到不完全伽马函数 Γ ( a , x ) \Gamma(a,x) Γ(a,x)(其积分下限是 x x x)gsl_sf_gamma_inc_Q(a,x)
,计算得到归一化的不完全伽马函数 Q ( a , x ) Q(a,x) Q(a,x) ( Γ ( a , x ) Γ ( x ) \frac{\Gamma(a,x)}{\Gamma(x)} Γ(x)Γ(a,x))gsl_sf_gamma_inc_P(a,x)
,计算得到互补归一化的不完全伽马函数 P ( a , x ) = 1 − Q ( a , x ) P(a,x)=1-Q(a,x) P(a,x)=1−Q(a,x)
Chap.II t 分布
需包含头文件
#include <gsl/gsl_randist.h>
#include <gsl/gsl_cdf.h>
gsl_ran_tdist_pdf(x,n)
,计算得到自由度为 n,变量值为 x 的概率密度gsl_ran_tdist_pdf((x - mu) / sigma, n) / sigma
,计算得到自由度为 n,变量值为 x,位置参数为 mu,标准差为 sigma 的gsl_cdf_tdist_P(x,n)
,计算得到自由度为 n 的 t 函数从负无穷到 x 的积分值;或者说得到自由度为 n,变量值为 x 的累积分布函数值gsl_cdf_tdist_Q(x,n)
, 1 − P ( x , n ) 1-P(x,n) 1−P(x,n)
关于位置尺度 t 分布
f
(
t
)
=
Γ
(
n
+
1
2
)
σ
π
n
Γ
(
n
2
)
(
1
+
(
t
−
μ
σ
)
2
n
)
−
n
+
1
2
f(t)=\frac{\Gamma\left( \frac{n+1}{2} \right) }{\color{red}\sigma\sqrt{\pi n}\ \Gamma\left( \frac{n}{2} \right)}\left( 1+\frac{\left(\color{red} {\frac{t-\mu}{\sigma}} \right)^2}{n} \right)^{-\frac{n+1}{2}}
f(t)=σπn Γ(2n)Γ(2n+1)(1+n(σt−μ)2)−2n+1
# python 代码
print(t.pdf(2,3,0,2)) # x, n, mu, sigam
print(t.pdf(1,3)/2) # x, n
可以用下面一行的代码,使得位置尺度 t 分布与通常意义上的 t 分布进行转换。
Chap.III 其他分布
- Laplace 分布:
gsl_ran_laplace_pdf(double x, double a)
GSL 只定义了稳定分布随机数生成,没有定义它的 pdf
double gsl_ran_levy(const gsl_rng * r, const double c, const double alpha);
double gsl_ran_levy_skew(const gsl_rng * r, const double c, const double alpha, const double beta);
Part.IV 随机数的生成
生成随机需要引用头文件#include <gsl/gsl_rng.h>
重要函数
- gsl_rng_uniform:返回一个在
[0,1)
区间内的随机数 - gsl_rng_uniform_pos:返回一个在
(0,1)
区间内的随机数 - gsl_ran_exponential:返回一个服从指数分布 1 μ e − x μ , x > 0 \frac{1}{\mu}e^{-\frac{x}{\mu}}, x>0 μ1e−μx,x>0 的随机数
Chap.I 报错的代码
下面的代码会报错,无法解析的外部符号 gsl_rng_default
#include <iostream>
#include <gsl/gsl_rng.h>
#include <gsl/gsl_randist.h>
int main()
{
gsl_rng* r;
int i, n = 10;
double low = 1;
double up = 10;
const gsl_rng_type* T;
gsl_rng_env_setup();
T = gsl_rng_default;
r = gsl_rng_alloc(T);
for (i = 0; i < n; i++)
{
double u = low + gsl_rng_uniform(r) * (up - low);
printf("%.5f\n", u);
}
gsl_rng_free(r);
return 0;
}
Chap.II 可以跑通的
#include <iostream>
#include <gsl/gsl_rng.h>
#include <gsl/gsl_randist.h>
using namespace std;
int main()
{
gsl_rng* rng;
const gsl_rng_type** r;
const gsl_rng_type** rngs = gsl_rng_types_setup();
double a = 1.85361, b = 0.612543, c = 3.78207, d = -0.749357;
for (r = rngs; *r != 0; r++)
{
rng = gsl_rng_alloc(*r);
double u = gsl_ran_levy_skew(rng, c, a, b);
cout << u << " " << rng->type->name << endl;
gsl_rng_free(rng);
}
cout << "---------------------------" << endl;
rng = gsl_rng_alloc(*rngs);
for (int i = 0; i < 10; i++)
{
double u = gsl_ran_levy_skew(rng, c, a, b);
cout << u << " " << rng->type->name << endl;
}
gsl_rng_free(rng);
getchar();
return 0;
}