Igraph入门指南 1

Igraph入门指南

一、图的结构

图是顶点和边的集合，而边是通过顶点来描述。顶点和边，要用集合的理念去操作。

1、igraph中与图结构相关的函数

 +.igraph(),
add_edges(), add_vertices(), 
complementer(),compose(), connect(), contract(), 
delete_edges(), delete_vertices(), 
difference(), difference.igraph(),
disjoint_union(),
edge(), 
igraph-minus, intersection(), intersection.igraph(), 
path(),
permute(),
rep.igraph(), reverse_edges(), 
simplify(), union(), union.igraph(), 
vertex()

2、图的基本要素——顶点(vertex)

2-1 检索顶点序列：V(g)函数

V(g)得到图的顶点序列。这个顶点序列通常用作igraph其他函数的参数，用于指代图的顶点。顶点序列被限定到具体图的特定顶点，一个图的V(g)不能与另一个图一起使用。

在实现级别上，顶点序列只是一个包含数字顶点id的向量，但它有一个特殊的类属性，可以对其执行特定于图的操作，例如基于图结构或顶点属性选择顶点的子集。

# 未名图的顶点id
> g <- make_ring(10)
> V(g)
+ 10/10 vertices, from d684cd6:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10


# 命名图的顶点id
> g <- make_ring(10) %>% set_vertex_attr('name',value=letters[1:10])
> V(g)
+ 10/10 vertices, named, from 2f141f4:
 [1] a b c d e f g h i j

 # 注意，命名图的名只能用'name'，用'label'不会给图的顶点命名
 > g <- make_ring(10) %>% set_vertex_attr('label',value=letters[1:10])
> V(g)
+ 10/10 vertices, from 935689e:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

顶点序列通常由V（g）函数创建。这样做的结果包括按顶点id递增顺序排列的所有顶点。顶点序列可以通过数字向量进行索引，就像其他R向量一样。

用V(g)可以查询或设置图顶点的所有属性，在实际操作中，可以把V(g)的结果当作一个对象，与图顶点相关的属性是这个对象的属性（也就是变量），可以通过V(g)$attrib的语法来访问和设置这些顶点属性，这与面向对象编程的语法也是相似的。

> V(g)[3:5]
+ 3/10 vertices, from 935689e:
[1] 3 4 5
> V(g)[3:5]