聚类分析的Matlab 程序—系统聚类（附有案例分析）

聚类分析的Matlab 程序—系统聚类

(1)计算数据集每对元素之间的距离,对应函数为pdistw.

调用格式：Y=pdist(X),Y=pdist(X,’metric’), Y=pdist(X,’distfun’),Y=pdist(X,’minkowski’,p)

说明：X是m*n的矩阵，metric是计算距离的方法选项：

metric=euclidean表示欧式距离（缺省值）；

metric=seuclidean表示标准的欧式距离；

metric=mahalanobis表示马氏距离。

distfun是自定义的距离函数，p是minkowski距离计算过程中的幂次，缺省值为2.Y返回大小为m(m-1)/2的距离矩阵，距离排序顺序为(1,2),(1,3),…(m-1,m)，Y也称为相似矩阵，可用squareform将其转化为方阵。

（2）对元素进行分类，构成一个系统聚类树，对应函数为linkage.

调用格式：Z=linkage(Y), Z=linkage(Y,’method’)

说明：Y是距离函数，Z是返回系统聚类树，method是采用的算法选项，

如下：method=single表示最短距离(缺省值)；

complete表示最长距离；median表示中间距离法；

centroid表示重心法；average表示类平均法；

ward 表示离差平方和法（Ward法）。

（3）确定怎样划分系统聚类树&#