生物信息与数据挖掘

接触一段时间的蛋白质组的生物信息数据处理，我认为有三个方面技能是学习生物信息必备的。

1 编程技能，包括以下几种技能。

（1）用R语言做统计与数据可视化。

（2）python做数据处理，代码更简洁一点。

（3）Linux系统，目前主要用Maxquant 软件在Linux 系统搜库。

（4）Matlab接触不多，也有人用这个软件处理质谱数据。

2 数学与算法。数据挖掘的下限是编程技能，上限是数学能力。包括以下技能：

（1）高等代数。最近在看《线性代数的几何意义》，通俗易懂。其他书籍需要慢慢啃。

（2）概率论与数理统计。

（3）深一点的理论，比如李航的《统计学习方法》和周志航《机器学习》。

 （4）未完待续。。。

3 业务能力。需要一定生物背景，能综合运用前两种能力（编程和数学）建立一个完整的数据分析流程。如何提出生物问题，如何解决生物问题，需要长时间的积累。