SMOKE、WRF、CMAQ安装步骤（自用）

王德芙捏

已于 2022-08-28 08:07:44 修改

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文章标签： linux

于 2022-07-11 13:55:44 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/hy19990903/article/details/125702519

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前期准备

在根目录下建立zip、tool、models文件夹。下载的压缩包放在models下，依赖库安装在tool目录下，SMOKE、CMAQ、WRF安装在models文件夹下。

mkdir -p zip
mkdir -p tool
mkdir -p models

设置环境变量。本教程使用intel编译器进行编译。

vi ~/.bashrc

#netCDF4
export CC=icc
export CXX=icpc
export FC=ifort
export F90=ifort
export F77=ifort
export zlib_dir=/home/H/tool/zlib
export hdf_dir=/home/H/tool/hdf5
export netcdf_dir=/home/H/tool/netcdf4
export PATH=${netcdf_dir}/bin:$PATH
export CPPFLAGS="-I${netcdf_dir}/include"
export LDFLAGS="-L${netcdf_dir}/lib"

#NCL
export NCARG_ROOT=/home/H/tool/ncl
export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

#CMAQ
export CMAQ_HOME=/home/H/model/CMAQ/CMAQ-main
export CMAQ_LIB=$CMAQ_HOME/lib
export CMAQ_DATA=$CMAQ_DATA/data
export WRF_EM_CORE=1
export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1
export I_MPI_SHM_LMT=shm
ulimit -s unlimited

1.基础库安装

1.1 GIT(CMAQv5.0.2以上版本需要安装)

使用yum命令进行安装

yum -y install git

安装结束使用version查看安装版本以及是否安装成功

git --version

1.2 intel编译器安装

在官网（Intel® oneAPI standalone component installation files）下载intel编译器，选择offline。下载之后上传至服务器进行安装。安装结束后mpich随intel一同安装。

1.3 zlib、hdf5安装

zlib与hdf5是安装netCDF所必须的依赖库，所以先对其进行安装。在官网下载安装包

hdf5：Index of /ftp/HDF5/releases (hdfgroup.org)

zlib：zlib Home Site

安装包下载好上传至服务器，解压完成之后，进行环境变量设置。

export CC=icc
export CXX=icpc
export FC=ifort
export F90=ifort
export F77=ifort
export zlib_dir=./zlib #自定义安装路径
export hdf_dir=./hdf5 #自定义安装路径
export netcdf_dir=./netcdf4 #自定义安装路径

之后分别在zlib与hdf5目录下进行编译

zlib：./configure --prefix=${zlib_dir}
      make
      make install

hdf5：./configure --with-zlib=${zlib_dir} --prex=${hdf_dir} -enable-fortran -enable-cxx
      make
      make check
      make install

安装结束后检查对应的文件夹下文件，zlib文件夹下的lib、include等，hdf5文件夹下的lib文件夹等。某些错误并不会影响安装，以最终文件夹下的文件为主。

检查完成后，将zlib库文件拷贝到hdf5目录下，完成安装。

cp $zlib_dir/lib/lib* $hdf5_dir/lib/

1.4 netCDF4安装

官网下载安装包，先安装C包在安装fortran包。

解压C包：netcdf-4.4.1.1.tar.gz

解压fortran包： netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz

tar -zxvf  netcdf-4.4.1.1.tar.gz -C /home/H/zip
tar -zxvf  netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz -C /home/H/zip

安装完成后进入$netcddf_dir/lib查看是否生成libnetcdf.a与libnetcdff.a，输入ncdump查看是否安装成功。

#netcdf-c
cd /home/H/tool/netcdf-4.4.1.1

./configure --prefix=$netcdf_dir CC="icc" --disable-dap --disable-netcdf-4 --disable-shared
make
make check
make install

#netcdf-fortran
cd /home/H/tool/netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz

./configure --prefix=$netcdf_dir FC="ifort" CC="icc" CXX="icpc" LDFLAGS="-L${netcdf_dir}/lib" CPPFLAGS="-I${netcdf_dir}/include" --disable-shared
make
make check
make install

cd /home/H/tool/netcdf4/lib
ls
ncdump

1.5 I/O API安装

官网下载安装包，解压。进入解压后的文件夹，进行编译。

tar -zxvf ioapi-3.2.tar.gz -C /home/H/tool/ioapi32
cd /home/H/tool/ioapi32
cp Makefile.template Makefile
vi Makefile

修改Makefile

#NCFLIBS = -lnetcdff -lnetcdf，FORTRAN 依赖库必须在 C 依赖库之前

设置环境变量，建立Linux2_x86_64ifort文件夹，将netcdf依赖库复制到Linux2_x86_64ifort文件夹中。

export BIN=Linux2_x86_64ifort
export BASEDIR=/home/H/tool/ioapi32
export CPLMODE=nocpl
mkdir $BIN
cp ${netcdf_dir}/lib/libnetcdf.a $BIN
cp ${netcdf_dir}/lib/libnetcdff.a $BIN
cd ioapi
vi Makeinclude.Linux2_x86_64ifort

进入ioapi文件夹，修改Makeinclude.Linux2_x86_64ifort，注释掉openmp。

之后在ioapi32目录下进行编译，make。安装成功后检查文件夹，出现绿色可执行文件即为安装成功。

cd $BASEDIR
make
make check
make install

cd $BASEDIR/$BIN
ls

1.6 NCL安装

官网下载安装包，解压。写入环境变量，输入ncl验证安装是否成功。

#ncl
export NCARG_ROOT=/home/H/tool/ncl #NCL解压目录
export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

ncl

2.CMAQ下载

使用git clone进行下载

git clone -b main https://github.com/USEPA/CMAQ.git CMAQ_REPO

也可在官网（CMAS: Community Modeling and Analysis System (cmascenter.org)）下载压缩包，自行上传服务器。进入官网，点击DOWNLOAD，选择需要的版本、操作系统、编译器进行下载。

3. CMAQ安装

解压压缩包至model文件夹下。

unzip CMAQ-main.zip /home/H/model

进入CMAQ-main，建立lib文件夹。链接ioapi、netCDF4、mpi库文件。

ln -s /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.0.117/linux/mpi/intel64 ./mpi
ln -s /home/H/tool/ioapi32 ./ioapi
ln -s /home/H/tool/netCDF4 ./netcdf

3.1 icon编译

进入CMAQ目录下的PREP文件夹，进入icon/script，修改bldit_icon.csh。修改ioapi文件路径。出现BLD_ICON_v532_intel文件夹，并且出现可执行文件ICON_v532.exe即可视为编译成功。

cd /home/H/model/CMAQ/CMAQ-main/PREP/icon/script
vi bldit_icon.csh
./bldit_icon.csh intel |& tee build.icon.log

3.2 bcon编译

bcon编译过程同icon。出现BLD_BCON_v532_intel文件夹，并且出现可执行文件BCON_v532.exe即可视为编译成功。

cd /home/H/model/CMAQ/CMAQ-main/PREP/bcon/script
vi bldit_bcon.csh
./bldit_bcon.csh intel |& tee build.bcon.log

3.3 mcip编译

修改makefile文件，更改netcdf、ioapi路径。出现mcip.exe即可视为编译成功。

cd /home/H/model/CMAQ/CMAQ-main/PREP/mcip/src
vi Makefile
make

3.4 combine编译

cd /home/H/model/CMAQ/CMAQ-main/POST/combine
vi bldit_combine.csh
./bldit_combine.csh intel

3.5 CCTM 编译

进入CCTM文件夹，打开scripts目录下的bldit_cctm.csh。修改版本号、ioapi路径、化学机制等信息，之后进行安装。安装成功后会在BLD_CCTM_v532_intel文件夹下出现可执行文件CCTM_v532.exe。

cd /home/H/model/CMAQ/CMAQ-main/CCTM/scripts
vi bldit_cctm.csh
./bldit_cctm.csh intel |& tee build.cctm.log

4.CMAQ运行

在CMAQ目录下新建data文件夹

王德芙捏

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