dbscan聚类算法的R实现

最新推荐文章于 2024-04-26 13:28:25 发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/hy_3210/article/details/50595158
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本文介绍了如何利用DBSCAN算法分析基因位置上的聚集情况。通过R语言处理输入的基因位点数据，根据DBSCAN的核心思想进行聚类，并展示R代码实现过程。最终输出聚类结果的start和end坐标。
摘要由CSDN通过智能技术生成

首先，先讲下需要解决的问题：

问题：挑选出了一条染色体上的一些gene位点，用dbscan算法检查下这些基因在位置上有没有聚集。

输入文件：（ID,start,end） 

gene0001        1       1323
gene0002        1483    2619
gene0003        2580    4889
gene0009        14089   14664

PS：基因已按照起始位置排序


DBSCAN核心思想：如果一个点，在距它Eps

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hy_3210
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