Python脑电图(EEG)青光眼即时诊断神经网络模型

脑电图(EEG)

EEG 测量由大脑神经元内的离子电流引起的电压波动。 临床上,EEG 是指在一段时间内记录大脑的自发电活动,如从放置在头皮上的多个电极记录的那样。EEG 结果显示大脑活动的变化可能有助于诊断大脑状况。

对 EEG 数据集进行目视检查的最简单方法是使用 plot() MNE 函数,该函数如其名称所示绘制时期。 y 轴显示通道名称,而 x 轴显示时代编号。 此外,在图上方,我们可以看到每种事件类型的比率。

青光眼

青光眼是一组视神经病变,它们共同具有视网膜神经节细胞 (RGC) 及其轴突的进行性退化,导致视盘的特征性外观和视野丧失。 青光眼功能丧失的评估传统上使用标准自动视野检查 (SAP)。 然而,SAP 需要患者进行大量的主观输入,并且受到重测变异性大的限制。 由于 SAP 测试通常在基于诊所的环境中进行,有限的资源经常导致患者随着时间的推移无法进行必要数量的测试,这可能导致延迟诊断或延迟检测进展。

神经网络

神经网络是一系列算法,通过模拟人脑运作方式的过程,努力识别一组数据中的潜在关系。 从这个意义上说,神经网络是指神经元系统,无论是有机的还是人工的

在神经网络中,除了输入是二进制的,输出是二进制的,我们有相同的基本原理。 进行计算的对象是感知器,他们调整自己以最小化损失函数,直到模型非常准确。

目标

在此,我们提出了新的方法,旨在通过消除现有视野评估中的认知方面,为青光眼患者提供快速的即时诊断。 与大多数报告中央凹目标检测准确性的现有方法不同,我们采用了多任务学习架构,可有效地同时从周边视觉中的中央凹和邻近目标捕获信号,生成视觉响应图。 此外,我们设计了一个多任务学习模块,可以有效地并行学习多个任务。 我们在 40 类数据集上评估了我们的模型分类,准确率和 F1 分数分别为 92% 和 95%。 我们的模型能够在无需校准的用户独立场景上执行,这对于临床诊断来说是可取的。 我们提出的方法可能是客观评估青光眼患者视野的垫脚石。

模型

我们的神经网络由四个卷积块组成,负责学习所有目标频率的脑电图表示。 第五卷积层是一个多任务学习块,它在其中学习以区分多个目标频率。

数据集

使用方法

model = Model(
    num_channel=11,
    num_classes=40,
    signal_length=250,
)

x = torch.randn(2, 11, 250)
print("Input shape:", x.shape) 
y = model(x)
print("Output shape:", y.shape)

模型分类器

model = ModelClassifier(
    num_channel=11,
    num_classes=40,
    signal_length=250,
)

x = torch.randn(2, 11, 250)
print("Input shape:", x.shape) 
y = model(x)
print("Output shape:", y.shape) 

结果显示

源代码

参阅 - 亚图跨际
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对于 EEG脑电图)特征提取,可以使用神经网络来实现。神经网络是一种模拟人脑神经元之间相互连接的数学模型,可以用来学习和提取数据中的特征。 在 EEG 特征提取方面,常用的神经网络包括卷积神经网络(CNN)和循环神经网络(RNN)。 1. 卷积神经网络(CNN):CNN 可以有效地提取时域和空域特征。对于 EEG 数据,可以将电极通道作为输入,并使用卷积层来捕捉时域特征。卷积层之后可以添加池化层来减少维度,并通过全连接层进行最终的分类或回归任务。 2. 循环神经网络(RNN):RNN 是一种能够处理序列数据的神经网络。对于 EEG 数据,可以将每个时间点的电极通道作为序列输入,并使用 RNN 单元(如 LSTM 或 GRU)来建模序列之间的依赖关系。RNN 可以捕捉到时间上的动态变化,适用于时序数据的特征提取。 除了 CNN 和 RNN,还可以结合两者的优势,使用卷积神经网络和循环神经网络的结合模型,如 Convolutional Recurrent Neural Network (CRNN)。CRNN 可以同时捕捉时域和空域特征,并具有较强的特征提取能力。 需要注意的是,在使用神经网络进行 EEG 特征提取时,需要预处理和标准化数据,选择合适的损失函数和优化算法,并进行适当的超参数调整,以获得较好的性能。此外,数据量的大小和质量也会对神经网络的训练和泛化能力产生影响。

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