Slicer学习笔记（二十）slicer编写自己的扩展模块

最新推荐文章于 2024-05-21 15:31:09 发布
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分类专栏： slicer 文章标签： slicer
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本文档详细介绍了如何在Slicer中创建并调试自定义扩展模块Crop_data。首先，按照步骤创建扩展模块，接着设计UI，包括数据选择、保存路径设置和裁剪参数。然后，通过PyCharm进行远程调试，配置Slicer的Python调试器，并在Slicer中连接调试器。调试时，可以在PyCharm中设置断点，并在暂停时使用Python终端查看和操作Slicer变量。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Slicer学习笔记（二十）slicer编写自己的扩展模块

如果需要调试参考官网：Python debugging

调试如果使用pycharm，需要pycharm专业版。
参考：SlicerRt/SlicerDebuggingTools

  • In PyCharm:

    • In the menu select: Run / Edit configurations
    • Click the small + icon in the top-left (Add new configuration)
    • Select Python remote debug configuration or Python debug server as template
    • Set Name: Slicer remote debugger
    • Set Port: 5678
    • Click OK

  • In Slicer:

    • Install the DebuggingTools extension
    • Open the Python
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Slicer学习笔记（十二）编写扩展模块
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Slicer学习笔记（三十）slicer编写c++扩展
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11-19 3037
Slicer学习笔记（三十）slicer编写c++扩展1、c++扩展模块 CMake文件2、程序执行3、编辑UI4、 编辑代码 1、c++扩展模块 CMake文件 准备操作，参考我的笔记十 Slicer学习笔记（十）怎样写一个slicer c++ 扩展模块 和笔记十二 Slicer学习笔记（十二）编写扩展模块 cmake_minimum_required(VERSION 3.13.4) project(cpp_regist_seg) #----------------------------------
SlicerRadiomics:Slicer扩展，可提供有关pyridomics的GUI
05-15
关于 SlicerRadiomics是的扩展，它封装了可计算各种特征的库。 请参见列表和计算特征的详细描述。 安装说明 SlicerRadiomics当前通过3D Slicer ExtensionManager作为扩展分发。 请按照以下步骤安装扩展程序： 从下载适用于您平台的最新夜间版本。 不要使用标记为“稳定发行版”的安装程序！ 如果您使用的是Mac，请确保在启动前将Slicer应用程序移动到计算机上的Applications文件夹中！ 安装后，通过单击图标打开扩展管理器，如下所示。 单击“安装”按钮，搜索Radiomics并安装扩展。 一旦完成Radiomics和相关性的安装，您将需要重新启动Slicer应用程序以访问该模块。 如果安装成功，您应该能够在切片器模块列表中看到Radiomics模块。 从源代码构建SlicerRadiomics 为了构建此扩展，您需要具有一个从
3D Slicer扩展程序：编辑视图布局
聆雨。
01-11 348
标题
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创建一个3Dslicer的（Extension）扩展包,并做简单的修改实现
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juluwangriyue的博客
09-27 1962
Slicer学习笔记（十七）编写一个python扩展模块1、安装并打开slicer2、选择扩展向导3、选择创建扩展4、增加python扩展模块5、编写自己的python扩展 1、安装并打开slicer 2、选择扩展向导 3、选择创建扩展 先起个名字 practice1，并选定一个保存路径。 此时在指定路径下生成两个文件。 并弹出一个对话窗口，选择 OK 就可以。 之后slicer 左侧界面如下： 4、增加python扩展模块 选择Add Module to Extension，弹出右侧窗口，名
Slicer学习笔记（十一）pycharm 配置slicer python环境
juluwangriyue的博客
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下面是我自己给pycharm配置的环境，可以使用。
3DSlicer中自己创建一个Extension项目（下篇）
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3DSlicer打包，整理发布Extension
SLicerRT 源码
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SLicerRT 源码，通过该源码阅读可以了解slicer中如何处理DICOMRT图像
Slicer安装包（用于放射组学特征提取等）
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3DSlicer20：GUI Structure
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1.前言 Slicer在Version4之前，GUI使用Kitware公司的GUI工具KWWidget开发，KWWidget不支持Unicode。而Slicer的最新Version4使用了Nokia公司的Qt代替KWWidget进行开发。 2.Slicer界面结构 Slicer应用程序的结构由应用程序核心、Slicer模块组成。 应用程序核心部分实现Slicer用户界面，提供数
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通常，在pycharm软件中的终端中输入pip install + 扩展包名可以很方便的下载外部扩展程序，但是在slicer中这种方式是行不通的。因为在slicer中有一套自己的开发环境，其中的内部库相对来说是稳定的，用惯用的方法去扩充其内部环境是不行的。下面以加入opencv-python库为例介绍加入外部扩展包的方法。首先我们可以在opencv库官方网站上找到我们想使用的opencv对应的版本库，将.whl文件（通常说轮子）下载到文件夹中，并在pycharm对应的环境中，在终端pip install +
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1.在slicer中添加sandbox插件 插件源码：https://github.com/PerkLab/SlicerSandbox 2.加载一组数据如图 3.点击Converters->Curved Planar Reformat，再如图所设置 4.在轴位图绘制曲线 5.点击apply效果如图 6.将拉直体显示出来 ...
支气管分割并3D展示效果
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slicer学习笔记(十七)编写一个python扩展模块
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Python是一门高级编程语言，它是一种动态类型、面向对象的语言，支持多种编程范式。Python在科学计算、数据分析、人工智能等领域有广泛的应用，越来越受到业界的关注。Python还有一个优点就是其灵活的扩展性，可以通过编写扩展模块来增强Python的功能。 编写一个Python扩展模块，需要先了解一下Python的C API，这是Python提供的一套C语言的API接口，可以用于编写Python扩展模块或者嵌入Python到其他应用程序中。扩展模块也可以用其他语言如C++、FORTRAN等编写，只要是遵循Python的C API规范即可。 编写Python扩展模块，可以使用Python自带的distutils模块来进行构建和安装。该模块可以用setup.py脚本来配置扩展模块的编译参数、依赖库等，并可以生成可执行文件或者扩展模块所需的动态链接库等文件。 下面是一个简单的Python扩展模块的例子，该模块可以计算两个数字的乘积： // test_module.c #include <Python.h> static PyObject* multiply(PyObject* self, PyObject* args) { int x, y; if (!PyArg_ParseTuple(args, "ii", &x, &y)) { return NULL; } return Py_BuildValue("i", x * y); } static PyMethodDef TestModuleMethods[] = { {"multiply", multiply, METH_VARARGS, "Returns the product of two integers."}, {NULL, NULL, 0, NULL} }; static struct PyModuleDef test_module = { PyModuleDef_HEAD_INIT, "test_module", "A test module that multiplies two integers", -1, TestModuleMethods }; PyMODINIT_FUNC PyInit_test_module(void) { return PyModule_Create(&test_module); } 在该模块中，我们定义了一个multiply函数，用于计算两个整数的乘积。该函数采用Python提供的PyArg_ParseTuple函数解析函数的输入参数，然后返回乘积。我们还定义了一个TestModuleMethods数组，它是一个PyMethodDef结构体的数组，里面记录了我们定义的函数的名称、函数指针、函数的参数类型等信息。最后我们使用PyModule_Create函数生成一个Python模块对象并返回。 我们需要将上面的代码保存到test_module.c文件中，并使用如下命令来构建并安装该模块： $ python setup.py build $ python setup.py install 在安装完成后，我们可以在Python解释器中使用该模块： >>> import test_module >>> test_module.multiply(10, 20) 200 编写Python扩展模块是一项有趣的工作，它可以让我们深入了解Python的内部机制，并且可以为我们解决一些实际问题带来便利。
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