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原创 配置深度学习pytorch/tensorflow环境

1、下载anaconda3.5.0.1------python3.6.3版本,3.6.0版本调用pytorch会出问题。。anaconda下载地址2、配置pytorch1.4.0 & torchvision0.5.0。。pip install torch===1.4.0 torchvision===0.5.0 -f https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/si

2020-08-25 23:51:06 451

原创 NVIDIA Jetson AI边缘计算盒子

选择一台Linux系统,或者VMware的电脑作为主机,烧录系统和后面安装Jetpack都会用到。下载,千万不要下官方给的最新版本(因为他们文档是以前写的,下载他们这个版本登不上)。根据供应商的指令烧录的,暂时还没验证官方烧录(后续验证补充)。如果报错nvcc命令无法识别,需要将nvcc添加到环境变量。输入NVIDIA Developer账户。在主机安装SDK Manager,去。

2024-06-11 16:36:18 431

原创 N随手小记

如果还是不行,就是没有安装。如果第一种方式显示没有。指定环境变量,再运行。

2024-05-29 14:54:43 189 1

原创 nnunet入门之三(2D图像分割)

nnunet用于2D图像分割。

2023-03-12 03:23:21 640 1

原创 nnunet入门之二 (MRI图像分割)

nnunet用于MRI图像分割。

2023-03-12 01:50:46 589

原创 nnunet入门之一 (CT图像分割)

nnunet用于CT图像分割。

2023-03-12 00:40:15 923 2

原创 NotImplementedError: cannot instantiate ‘PosixPath‘ on your system

NotImplementedError: cannot instantiate 'PosixPath' on your system

2022-10-18 15:43:57 2628 2

原创 Docker记录(四):Docker更改配置

Docker更改配置。

2022-10-16 02:10:14 2376

原创 Docker记录(二):Docker端口映射

Docker端口映射。

2022-10-10 15:08:24 391

原创 Docker记录(一):安装nvidia-docker

安装nvidia-docker。

2022-10-10 14:56:31 551

原创 Docker记录(三):Docker Registry

Docker Registry。

2022-10-10 14:48:41 443

原创 plt图像保存到pdf文件

plt图保存到pdf文件

2022-07-25 22:08:20 2027

原创 常用自定义函数

常用的一些自定义的函数,不定时增加。

2022-07-25 22:05:59 115

原创 c++测试pytorch训练的模型

c++测试pytorch训练的模型pytorch训练的pth模型转换成onnx模型,使用c++测试onnx模型。1. 模型.pth转.onnx化繁为简写那么多废话不如简单明了import torchfrom Unet import Unetdef pth2onnx(input, pth_path, onnx_path): model = Unet() # 导入自己的网络模型 model.load_state_dict(torch.load(pth_path))

2021-12-15 17:38:43 4757 17

原创 服务器端口映射

docker run -it -p 8050:22 nnunet /bin/bashcd /etc/ssh/apt-get install openssh-servervim sshd_configpasswd rootservice ssh start

2021-10-28 17:21:31 289

原创 linux系统安装anaconda无法conda

linux系统安装anaconda之后无法conda,且python没有生效。echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"' >> ~/.bashrcsource ~/.bashrc

2021-10-21 17:19:32 1258

原创 算法1-递归算法

推荐个优秀的学习网站递归算法,顾名思义就是调用自己的算法。条件:子问题须与原始问题为同样的事,理解为中学时候学习的数列找规律,根据规律设计算法。需要有出口,不能无限制的调用,设置结束条件。经典案例n!, 斐波那契数列…斐波那契数列代码:# pythondef fibonacci(n) : # 出口,结束条件 if n== 1 or n== 2: return 1 # F(n) = F(n- 1) + F(n- 2) return fi

2021-10-15 10:47:43 106

原创 ModuleNotFoundError: No module named ‘dllogger‘

ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement dllogger (from versions: none)ERROR: No matching distribution found for dllogger参考进入git地址,你就会发现,人家已经把安装方法告诉你了。pip install nvidia-pyindexpip install nvidia-dllogger...

2021-10-12 11:58:48 919

原创 Missing key(s) in state_dict

这种错误多半是模型加载错误导致。排查测试代码的模型,与加载的模型是否是同一个。错误代码:Missing key(s) in state_dict: "input_block.conv1.conv.weight",...Unexpected key(s) in state_dict: "module.input_block.conv1.conv.weight",...错误分析:区别在于一个加了module,一个没加。解决办法:训练模型时,在服务器使用了多GPUtorch.nn.DataPara

2021-10-11 11:21:35 3984

原创 损失函数之图像分割

损失函数Cross Entropy LossDice LossIoU LossFocal LossBoundary Loss1、Cross Entropy LossLCE=−∑i=1Ny(i)logy^(i)+(1−y(i))log(1−y^(i))L_{CE} = - \sum_{i=1}^N y^{(i)}log\hat{y}^{(i)} + (1-y^{(i)})log(1-\hat{y}^{(i)})LCE​=−i=1∑N​y(i)logy^​(i)+(1−y(i))log(1

2021-09-30 14:01:59 584

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公式编辑

2021-09-30 13:04:06 89

原创 MONAI深度学习

参考:MONAI Projectmonai是一款基于pytorch的深度学习开源框架,主要用于医学图像的处理(分类、分割等)。主要优点:集成性好,训练速度快,涵盖当今流行的分类/分割网络。(更多优点待探索)缺点:对硬件要求较高,处理3D图像时,电脑配置太低就算了。安装MONAI推荐安装方式:git clone https://github.com/Project-MONAI/MONAI.gitcd MONAI/pip install -r requirements-dev.txtAPI

2021-09-26 10:50:02 1330

转载 plt图像保存

参考【https://www.cnblogs.com/cgmcoding/p/14244735.html】plt.savefig()可以保存plt的图像,但是迭代保存的时候,plt.plot()会出现多根线在一张图叠加解决方法参考上面,f = plt.gcf() #获取当前图像f.savefig(r'D:\{}.png'.format(col))f.clear() #释放内存...

2021-09-18 16:07:40 18823

原创 混淆矩阵(Confusion Matrix)

混淆矩阵(Confusion Matrix)label poslabel negpred posTPFPpred negFNTNTP(真正例):预测+ 实际+FP(假正例):预测+ 实际-TN(真负例):预测- 实际-FN(假负例):预测- 实际+Precision(精确率,P)P=TPTP+FPP= \frac {TP} {TP+FP}P=TP+FPTP​TPR(真正例率,灵敏度,Sensitivity,召回率,Recall)TPR=TPT

2021-09-17 10:32:15 448

转载 docker常用命令

docker常用命令

2021-09-08 10:43:23 62

原创 nii文件读取显示操作

1. 读取&显示niiimport nibabel as nibimport osfrom nibabel.viewers import OrthoSlicer3Droot_path = r'E:\data\CTA\test\images'files = [file for file in os.listdir(root_path)]for file in files: example_filename = os.path.join(root_path, file) im

2021-08-27 16:49:40 1376 1

原创 爬虫--1

爬取中国证券投资基金协会中私募基金管理人分类查询中的公司名称1、第一步,获取headers,打开浏览器打开网页,F12→网络(Network)→managerList.html下面的标头就是Headers的内容headers = { 'Accept': 'application/json, text/javascript, */*; q=0.01', 'Accept-Encoding': 'gzip, deflate, br', 'Accept-Language': 'zh

2021-08-09 22:46:26 588

原创 图像质量评价-2

图像质量评价无参考有参考无参考图像质量评价1、Laplacian梯度D(f)=ΣyΣx∣G(x,y)∣D(f) = \Sigma _y \Sigma_x |G(x,y)|D(f)=Σy​Σx​∣G(x,y)∣G(x,y)G(x,y)G(x,y)是点(x,y)(x,y)(x,y)处Laplacian算子的卷积。Laplacian算子,L=16×[1414−204141]L = \frac 1 6 × \begin{bmatrix} 1&4&1 \\ 4&-

2021-07-29 17:18:46 229

原创 图像质量评价-1

图像质量评价1、主观评价(1)绝对评价无参考图像,观察者根据预先规定的评价尺度或经验,对待测图像评价。(2)相对评价有参考图像,观察者对一批待测图像进行相互比较、评价。2、客观评价客观评价是用恢复图象偏离原始图象的误差来衡量恢复图象的质量, 源于数据传输过程中均方信噪比的思想。最常用的有均方误差和峰值信噪比。(1)全参考,需要原始图像全部信息(2)半参考,需要原始图像部分特征信息(3)无参考,不需要原始图像图像质量评价方法:基于视觉感知的图像质量评价方法(图像像素的质量)

2021-07-28 17:41:58 877

原创 5个经典激活函数

激活函数1.sigmoid函数σ(x)=11+e−x \sigma(x) = \frac{1}{1+e^{-x}}\,σ(x)=1+e−x1​过去反向传播很流行使用,但随着神经网络层数增加,反向传播过程中会出现梯度消失。sigmoid函数导数梯度消失:反向传播利用的是梯度下降法,反向传播时,每经过一个sigmoid层,就需要乘以一个小于0.25的梯度(也就是sigmoid函数的导数),随着神经网络层数增加,梯度会越来越小,最后梯度衰减到接近0,即梯度消失。2.tanh函数tanh⁡

2021-07-27 16:37:10 1803

原创 np.reshape增加一维

np.reshape增加一维举例import numpy as np# 数组img, (10, 10)img = np.arange(100).reshape(10, 10)print(img)[[ 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9] [10 11 12 13 14 15 16 17 18 19] [20 21 22 23 24 25 26 27 28 29] [30 31 32 33 34 35 36 37 38 39] [40 41 42 43 44 45

2021-07-27 13:19:38 393

原创 虚拟环境创建和使用

一、命令行安装命令行输入pip install virtualenv创建虚拟环境virtualenv envname进入虚拟环境cd envname\Scriptsactivate.bat可以在虚拟环境中安装需要的库二、pycharm安装File→Settings→Project→Python Interpreter→Add可以在任意位置建立虚拟环境可以寻找到电脑中已有的虚拟环境(比如上一步命令行建立的虚拟环境)...

2021-05-08 16:19:25 138

原创 写论文自动生成目录

适用于自动生成目录(未找到目录项)1、选中标题–右键段落–大纲级别(选择一级/二级标题)–保存。2、引用–目录–自动生成目录

2021-02-24 00:35:38 3092

原创 图上画矩形框并切割相应区域

import cv2name = 'C:/Users/Desktop/data/drive/2_M3_x4.bmp'img = cv2.imread(name)img1 = img[100:201, 300:401]cv2.rectangle(img, (300,100), (400,200), (0,255,0), 1)cv2.imwrite('C:/Users/Desktop/data/drive/2draw_M3_x4.bmp', img)cv2.imwrite('C:/Users/De

2021-02-03 22:12:09 540

原创 求文件夹中的3通道图像的均值、方差

求文件夹中的3通道图像的均值、方差;数据处理步骤转化成tensor用的import osfrom PIL import Imageimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npimport cv2 filepath = r'F:/Pytorch/data' # 数据集目录pathDir = os.listdir(filepath) R_channel = 0G_channel = 0B_channel = 0for idx i

2021-02-03 22:07:24 833

转载 visdom服务启动时提示Downloading scripts, this may take a little while解决办法

参考:添加链接描述

2020-11-24 15:24:09 836

原创 视网膜数据集

1、STAREhttp://cecas.clemson.edu/~ahoover/stare/2、DRIVEhttps://drive.grand-challenge.org/Download/链接可能不能下载了,可以百度云下载。链接:https://pan.baidu.com/s/1exkCmKMmC6Zmq66IKxia-A 提取码:1vt5 3、CHASEhttps://blogs.kingston.ac.uk/retinal/chasedb1/...

2020-10-10 00:36:40 2944

原创 tqdm报错!!

ERROR conda.core.link:_execute_actions(337): An error occurred while installing package 'defaults::tqdm-4.49.0-py_0'.安装其他库,依赖包更新tqdm报错!!conda install tqdm -f然后再继续安装其他库

2020-09-27 13:38:21 1001

原创 在windows10上配置tensorflow-gpu!!!

环境: 1. cuda8.0 2. cudnn5.1 3. tensorflow-gpu==1.2.0 4. keras==2.1.1cuda8.0+cudnn5.1!!!别问为什么,就是好用!!!首先,将电脑上的nvidia卸载干净。百度一下很多的可以参考!!然后,就直接下载cuda8.0和cudnn5.1!!!百度网盘:链接:https://pan.baidu.com/s/1OR4laGCavSoMoytdkoEZ2g 提取码:fdjn1、cuda安装默认路径,点ok直接安装

2020-09-10 18:27:23 171

原创 qDebug打印list表

QList<cv::Point> points;打印points。for (cv::Point pt : points){ qDebug() << pt.x <<pt.y;}或者://打印第一行的x,y的值。qDebug() << point[0].x <<point[0].y;打印points的大小。qDebug() << points.size();...

2020-09-07 18:08:16 865

nnUnet和nnDet的使用教程

nnUNet和nnDet的安装教程和使用教程; 数据的存放方式。

2022-08-23

spleen图像3D分割-train-labels

monai中用到的3D分割医学图像。

2021-08-27

spleen图像3D分割-test

monai中用到的3D分割医学图像。

2021-08-27

retina datasets

bmp格式的retinal datasets,bmp格式的视网膜数据集!

2020-10-10

pcnn人脸识别matlab

pcnn人脸识别,python,matlab实现人脸识别代码。

2018-12-09

空空如也

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