ggplot2箱线图的美化之路: 箱线图到直方图加散点图再加误差线的美化之路

本文详细介绍了如何使用ggplot2进行箱线图的美化,从一个基础的箱线图开始,逐步添加误差线、散点信息,去除网格线和背景,并转换为带误差线、散点的柱形图。通过ggsci主题包,实现了颜色的美观搭配,并推荐使用Adobe Illustrator进一步完善图表。
摘要由CSDN通过智能技术生成

前言

由于自己科研工作的需要,经常需要画一些箱线图,比较2个样本的基因表达量啊什么的,这个时候,就会想说如何实现箱线图的美化,以及最近看到一个把正常基因表达量的箱线图画成了直方图加散点图再加误差线的形式,因此想趁空闲来写下我的ggplot2的箱线图的美化之路。

数据准备

首先先生成一个测试数据集

data <- c(rnorm(200))
name <- c(rep("control", 99),rep("treat",101))
res <- data.frame(data,name)

得到的数据集就是这样子的:
head 查看res数据框内容

箱线图美化

01 一个平平无奇的箱线图

library(ggplot2)
g <- ggplot(res, aes(name, data))+geom_boxplot(aes(fill = name ))

在这里插入图片描述

02 给箱线图加上误差线

library(ggsignif)
compared_list = lis
在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制多个箱线图。首先,需要载入相应的包和数据。通过使用ggplot函数创建绘图对象,并指定数据集和x、y轴变量。然后,可以使用geom_boxplot函数绘制箱线图,并通过fill参数指定组别的填充颜色。下面是一个示例代码: ```R # 载入相关包和数据 library(ggplot2) library(ggpubr) # 创建绘图对象 p <- ggplot(df, aes(x = group, y = value)) # 绘制箱线图 p + geom_boxplot(fill = "lightblue") # fill参数可以指定填充颜色 ``` 这样,就可以绘制出多个箱线图,每个箱线图代表一个组别。其中,group变量表示组别,value变量表示数据值。可以根据具体需要,调整绘图的其他参数和样式,如调整箱线图的宽度等。 请注意,代码中的df是一个示例数据集,你可以根据自己的需要替换成你自己的数据集。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* [基于OpenGL的计算机图形学实验NURBS曲线算法](https://download.csdn.net/download/weixin_53249260/88236784)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *2* *3* [R语言绘图丨论文中最常用箱线图绘制教程,自动进行显著性检验和误差线标注](https://blog.csdn.net/ZaoJewin/article/details/131550937)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]
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