lammps常见设置误区:“刚体”和“固定”命令分不清

在lammps模拟中,有“刚体”和“固定”的设置,在平时咨询过程中,发现还有小伙伴对两者的区别分不大清楚。

在设置”刚体“的时候使用固定的命令,反之也有。

”刚体“和”固定“的设置有相同点,也有不同点。

(1)相同点

被设定为”刚体“以及”固定“的结构,原子之间的间距保存相对固定,在模拟过程中,这个结构不会发生变形。

换一句描述,可以理解为:”刚体“是一个刚体,被“固定”的结构也是一个刚体,这是两者之间相同点。

(2)不同点

第一个不同:“刚体”可以移动,被“固定”的结构静止不动。

比如,在摩擦模拟中,磨粒可以设为一个“刚体”,在摩擦时磨粒自身不发生变形,但是磨粒可以移动以产生磨削效果。

水分子可以设置为一个“刚体”,水分子的键角在模拟时不再发生变化,便于简化运算,加快计算速度。

第二个不同:“刚体"可以具有一定的温度,被”固定“的原子温度为0K。

可以对刚体设置系综,进行控温控压,被“固定”的原子不能具有温度,否则原子就会有移动速度,产生移动。

(3)设置方法

“刚体”设置:

刚体设置主要使用fix rigid、fix rigid/nve、fix rigid/nvt、fix rigid/npt等命令,另外有些命令自带刚体效果,如fix move命令。

“固定”设置:

velocity fixed set 0 0 0

fix 1 fixed setforce 0 0 0

“固定”原子的基本原理是原子的速度设置为0,同时,原子的受力设置为0,两个条件必须同时具备,缺一不可。

如原子的初速度不为0,仅受力被设置为0,原子会沿初始速度进行匀速运动。如果初速度为0,但受力不为0,原子会产生新的速度,也会产生移动。

在模拟时,如果发现被“固定”的原子产生了移动,需要考虑以上两个条件是否同时满足。

以上是对“刚体”和“固定”的简单对比介绍,希望对你有用。


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