lammps教程：in文件结构详解以及一个比较实用的in文件模板

lammps软件只是一个求解器，没有可视化的前处理和后处理软件，所有的命令只能通过代码的方式输入到求解器进行求解计算。

所有的命令都被写到一个称为“in”的文件里，对于初学者来说，熟悉in文件的编写是一个难点。

in文件其实就是一个文本文档，也没有要求文件名或者后缀名中必须带有“in”字样，用任何文件名均可运行。

in文件里的代码是按照编写的顺序进行解释执行，对于大部分命令行来说，前后顺序影响并不是很大，但是，对于一些命令，在执行过程中需要某个参数，则这个参数的定义和计算必须写在命令执行之前。

例如，对晶体使用fix deform命令进行拉伸时，应变速率代码必须写到fix deform命令行的前面。

lammps命令非常丰富，官方给出的说明手册就达2000多页，我们也不可能记住和使用所有的命令。

对于某一个研究方向来说，常用的命令可能也就那么几十个，只要我们掌握这几十个命令基本上能够满足模拟要求。

in文件按照模块，大体可以分为以下几类：

（1）模拟环境参数设置

这一部分主要设置一些模拟参数，比如模拟体系的单位（units）、边界条件（boundary）、原子类型（atom_style）、邻居列