DCM4CHE压缩DICOM文件

概要

随着医疗影像的发展，影像设备拍摄的图像越来越大，越来越多，但医疗影像的存储成本是很高的(云存储就更不用说了)，所以在存储的时候会先将医疗影像压缩，之后再存储，以节省存储成本，本文主要介绍dicom医疗影像的压缩。

一般来说dicom医疗影像的默认压缩协议Transfer Syntax UID是1.2.840.10008.1.2，这种是可以直接去pixelData字段拿去显示的，我们就要把这种dicom压缩成我们需要的压缩协议，压缩协议详情见DICOM之Transfer Syntax

具体代码实现(我们还是基于Maven工程进行说明)

1.在pom.xml里加入依赖的jar包:

		<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-imageio</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
		</dependency>
		<dependency>
				<groupId>org.dcm4che</groupId>
				<artifactId>dcm4che-imageio-opencv</artifactId>
				<version>5.21.0</version>
				<scope>runtime</scope>
		</dependency>

2.在eclipse里加入依赖的opencv库

在eclipse里加入opencv的动态链接库(如果你是通过源码编译的dcm4che，在你编译的dcm4che-assembly\target\dcm4che-5.21.0-bin\dcm4che-5.21.0\lib路径下，要是直接从网上下的编译好的直接就在lib目录下)

3.java代码：

public class Dcm4cheTranscode {
	private static List<Property> params = new ArrayList<Property>();

	public static void main(String[] args) {
		File src = new File("D:/dicomFile/test/src.dcm"); //带有压缩协议的dicom原始文件
		File dest = new File("D:/dicomFile/test/des.dcm"); //解压成未压缩的dicom目标文件		
		try {
			transcodeWithTranscoder(src, dest);
		} catch (IOException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}
	
	public static void transcodeWithTranscoder(File src, final File dest) throws IOException {
		try (Transcoder transcoder = new Transcoder(src)) {
            transcoder.setDestinationTransferSyntax("1.2.840.10008.1.2.4.51");
            transcoder.setIncludeFileMetaInformation(true);
            transcoder.setRetainFileMetaInformation(true);
            Property p = new Property("compressionQuality", 0.5);//压缩率
            params.add(p);
            transcoder.setCompressParams(params.toArray(new Property[params.size()]));
            transcoder.transcode(new Transcoder.Handler(){
                @Override
                public OutputStream newOutputStream(Transcoder transcoder, Attributes dataset) throws IOException {
                    return new FileOutputStream(dest);
                }
            });
        } catch (Exception e) {
            Files.deleteIfExists(dest.toPath());
            throw e;
        }
	}
}

4.结果：

可以看见dicom文件大小有明显的缩小，但是要注意会有一定量的像素损失。