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原创 R语言officer包批量生成word文档

R语言officer包批量生成word文档。

2022-09-27 23:03:58 714 1

原创 minicoda3那点事

Anaconda channel 配置笔记 - 知乎 (zhihu.com)​​​​​​i。实际问题 安装gatk4过程中,conda个env,报错。channel配置 和 报错。

2022-09-21 01:09:13 334

原创 Ubuntu 20.0.4 linux生信服务器笔记

Linux生信服务器备忘

2022-09-18 19:51:56 614

原创 华为云服务部署Rstudio Server

华为云服务HECS 成功部署Rstudio Server open source。

2022-09-18 11:18:37 728

原创 R语言ggplot统计图之:小提琴图geom_violin

分组小提琴图 ggplot实现

2022-08-17 10:26:15 2426

原创 搜索结果词频可视化: R语言wordcloud(词云图)

R语言文本词频统计,可视化 词云 wordcloud

2022-08-17 09:13:45 998 4

原创 机器学习数据集pima-indians-diabetes.data 及R语言读入命令

这个数据集是机器学习常用练习集,包括768个observation,原链接如下https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/pima-indians-diabetes/已经失效,原因是permission restriction。从网上搜索到了数据集的内容,并将其转换为tab分隔的文本文件。主要参考了CSDN博主...

2019-09-29 00:54:01 4810 8

原创 NCBI genebank refseq 编号意义

最近在做virus detection用到NCBI genebank的病毒库,发现gene bank refseq里面编号很多,贴在下面,有助记忆。genebank的病毒参考序列库,最近一次更新去掉了GI号,只保留NC或AC号,可以看出全部是完整基因组序列。另外, 该序列库是非冗余库(non-redundant),总共只有9556个序列,其中NC 9533个,AC 23个,可以用g...

2017-10-18 16:05:55 5708

原创 Editplus 里面的正则表达式

Editplus 是windows平台里常用的多功能编辑器,本人认为最喜闻乐见的功能是支持多文件查找。一直不忍放弃。其实它也支持RE,只是功能有限。参考博文http://www.williamlong.info/archives/4448.html总结如下:1.不支持 重复频度 的定义,如:{3}、{3,}、{3,6}...2. 支持的元字符比较少,列表如下:  ...

2017-09-24 23:56:03 3331

原创 linux 命令备忘随笔

仅仅是记录一些,我自己会用到,但不容易记住的命令, 方便自己查找。 如果你恰好也在找这些命令,那真是缘分啊。1.ls 命令显示文件的绝对路径    ls | sed "s:^:`pwd`/:"    其实用了管道 |, 后面sed 加了个正则表达式,把行首^替换成了pwd的返回值,就是当前的绝对路径。    s替换,:是界定符,程序猿都首选"/",其实啥符号都可以,我喜欢用#,其他

2017-09-08 21:17:58 394

pima-indians-diabetes.csv

pima-indians-diabetes.data是机器学习常用的数据集,原数据集位置已经搬空,原因是permission restriction。本数据集是作者网上收集数据文本转换为最常用的csv格式。共768个observation,9个变量"npregant", "glucose", "BP", "triceps", "insulin", "bmi", "pedigree", "age", "class"。变量解释见 博客。

2019-09-29

Modeltest 使用说明

modeltest 是选择核苷酸替代模型 的软件,通过和PAUP配合使用,可选择出合适的 MODEL, 并同时计算出相关 参数。 目前是英文版,看要是大家需要,把它翻译成中文版 哈哈

2009-09-07

空空如也

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