实际问题 安装gatk4过程中,conda个gatk4 env,报错
channel配置 和 报错
Anaconda channel 配置笔记 - 知乎 (zhihu.com)ihttps://zhuanlan.zhihu.com/p/349081344
install用法
简洁 GATK4 conda 安装
GATK4 conda 安装 - 简书 (jianshu.com)https://www.jianshu.com/p/e9bdaaaf2e6f
conda gatk4 如何配置Java版本
问题:GATK4 需要Java 1.8版本,默认的1.8 headless COS7 X390无法安装。默认安装11.8
最终方法: conda install openjava=8.0