成功安装ubuntu16.04+cuda9.0+cuDNN7.0.5+caffe+digits（附错误汇总）

最新推荐文章于 2023-02-01 15:33:30 发布

钟烁卓

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分类专栏：机器学习文章标签：深度学习机器学习 caffe cudn digits

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成功安装ubuntu16.04+cuda9.0+cuDNN7.0.5+caffe+digits（附错误汇总）

  本机硬件：双核i7 内存8G 显卡GTX070（不好意思，比较水） 

  安装顺序：依赖包-->驱动-->cuda-->cudnn-->caffe --> digits-->测试 

  时间：2017-12-26 

  转载请注明出处:  

  http://note.youdao.com/noteshare?id=fb9c38bd268d5bf353c38a89f546e6d7（我的云笔记） 

  http://blog.csdn.net/linyu2016/article/details/78903243 （我的csdn） 
 
 

  欢迎交流，请多多指教～ 

  前言: 

 
 有的显卡计算能力不够，例如GTX540的计算能力只有2.1, 而cudnn要求的显卡的计算能力至少是3.0以上,也就是至少GTX830，在此处可以查询计算能力。
cuda9.1与cudnn7是最新款的，但是在caffe编译的时候会出现问题，在make runtest 的时候不通过，所以不建议同时使用。
我的用户名是ly，所以要注意有的路径需要自己根据自己电脑的用户名来改。
 

  1、安装依赖 

  sudo apt-get install python-pip 

  sudo pip install easydict protobuf pydot 

  sudo apt-get install graphviz libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev python-tk python-numpy python-scipy python-matplotlib python-sklearn python-skimage python-h5py python-protobuf python-leveldb python-networkx python-nose python-pandas python-gflags 

  sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev 

  2、安装显卡驱动 

  方法1： 

  在“软件与更新”的“附加驱动”里查看，查看驱动版本： 

  执行以下指令安装驱动： 

  sudo add-apt-repository ppa:xorg-edgers/ppa 

  sudo apt-get update 

  sudo apt-get install nvidia-375 或者是(384) #注意在这里指定自己的驱动版本！ 

  重启 

  方法2： 

  在“软件与更新”的第二项（另外源）的 canonical partners 打上沟，或者全部都打钩（保险起见） 

  在倒数第二项的 “附加驱动”里，系统会自动搜索N卡驱动，选择优先级高的英伟达驱动安装，重启 

  注意： 

  一般需要重启才能检测到安装成功 

  sudo nvidia-smi 

  若列出了GPU的信息列表则表示驱动安装成功。 

  3、安装CUDA 

  下载CUDA 

  方法1： 

 
 从此处， 
 下载对应版本的cuda安装包， 我下载的是deb（ local） 版。 

 
 这种方法是下载最新的cuda，不一定适合显卡低级的电脑。 

  方法2： 

从此处可以下载各个历史版本的cuda，总有一款适合你的显卡，推荐使用此方法。

  安装CUDA， 运行如下命令， 即可安装CUDA； 

 
 sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1604-9-0-local_9.0.176-1_amd64.deb (具体看实际的包) 

  sudo apt-key add /var/cuda-repo-9-0-local/7fa2af80.pub（若cuda<9.0的，就不用，具体在下载的网页有提示） 

  sudo apt-get update 

  sudo apt-get install cuda 

  安装完成后， 重启一下； 

  4、安装cuDNN (计算能力小于3.0的，不兼容cudnn的英伟达显卡不需要装cudnn，则忽略此步骤) 

  从 
 此处下载cuDNN 。注册，然后下载，(注册邮箱最好是使用国外邮箱[Google， apple]， 验证邮件很快就能收到)，选择对应版本，可以与cuda相同的版本，或者比它小的版本。 

  切换到cudnn所在的目录下 

  sudo tar -zxvf cudnn-9.0-linux-x64-v4.0-prod.tgz (具体看实际的包) 

  sudo cp cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/include 

  sudo cp cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64 

  sudo chmod a+r /usr/local/cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/lib64/libcudnn* 

  cd /usr/local/cuda/lib64/ 

ls

  sudo chmod +r libcudnn.so.7.0.5（具体的版本要自己查） 

  sudo rm -rf libcudnn.so libcudnn.so.7 #删除原有动态文件 

  sudo ln -s libcudnn.so.7.0.5 libcudnn.so.7 #生成软衔接（注意这里要和自己下载的cudnn版本对应，可以在/usr/local/cuda/lib64下查看自己libcudnn的版本） 

  sudo ln -s libcudnn.so.7 libcudnn.so #生成软链接 

  sudo ldconfig -v 

  5、设置环境变量， 

  在/etc/profile中添加CUDA环境变量 

 
 sudo gedit /etc/profile 

 
 在打开的文件最后加入如下3句话 

  export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH 

  export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH 

  export PYTHONPATH=/home/用户名/caffe/python:$PYTHONPATH （具体注意用户名） 

  保存后， 使环境变量立即生效， 

  source /etc/profile 

  sudo gedit ~/.bashrc 

  在打开的文件最后加入如下3句话 

  export PATH=/usr/local/cuda-9.0/bin${PATH:+:${PATH}}（具体要注意cuda的版本号） 

  export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-9.0/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}（具体要注意cuda的版本号） 

  export PYTHONPATH=/home/用户名/caffe/python:$PYTHONPATH 

  source ~/.bashrc 

  进入/usr/local/cuda/samples， 执行下面的命令来build samples， 

  cd /usr/local/cuda/samples 

  sudo make all -j16（如果电脑CPU比较低，则用-j16或者不加） 

  全部编译完成后， 进入 

  cd /usr/local/cuda-9.0/samples/1_Utilities/deviceQuery（具体要注意cuda的版本号） 

  sudo ./deviceQuery 

  如果出现显卡信息，结果为pass， 则驱动及显卡安装成功。 

  6、配置caffe 

  （1）下载caffe（也可以复制源代码到用户名文件夹下） 

cd

  sudo git clone https://github.com/BVLC/caffe.git 

  网速如果比较慢的话，可用ctrl+c结束进程。再次输入语句，重新开始下载。 

  （2）配置caffe文件 修改caffe/Makefile.config， 

  cd /home/用户名/caffe（具体路径自己改） 

  sudo cp Makefile.config.example Makefile.config 

  sudo gedit Makefile.config 

  USE_CUDNN := 1#去掉这个注释，因为要使用cudnn（但是假如显卡太低级，兼容性不够，就用不了cudnn） 

  # CPU_ONLY := 1#加上这个注释（因为要使用cuda，所以就不用改） 

  WITH_PYTHON_LAYER := 1 #去掉这个注释，因为以后经常会用到caffe 的 Python layer 

  然后根据自己的cuda根据该文档提示删去或者注释掉相应的版本的，例如 

  CUDA_ARCH := #-gencode arch=compute_20,code=sm_20 \ 

  #-gencode arch=compute_20,code=sm_21 \（要根据自己实际才cuda版本注释，文件本身有提示） 

将

  INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include 

  LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib 

  修改为： 

  INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/include/hdf5/serial 

  LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial（一般是这两条，具体路径可以自己看机器的hdf5文件夹路径） 

  保存退出。 

  （3）编译caffe 

  方法1（传统版）: 

  sudo make all -j16 （在make pycaffe -j16前的话会有很多编译错误，以后的bug） 

  sudo make runtest -j16（测试） 

  sudo make pycaffe -j16（警告不用在意，在make all -j16前会好一点，很少error） 

  sudo make pytest -j16 

  若报错，则需要 

  sudo make clean 

  然后修改错误后，重新编译 

  方法2（社区版）: 

  sudo mkdir build 

  sudo cd build 

  sudo cmake .. 

  sudo make all -j16 

  sudo make install -j16 

  sudo make runtest -j16 

  （4）检查编译是否成功 

  从终端进入python 

  python 

  import caffe 

  ctrl + d退出Python 

  cd caffe (如果不在这个目录下测试，会有bug，好坑) 

  sudo ./data/mnist/get_mnist.sh #下载数据 

  sudo ./examples/mnist/create_mnist.sh #把数据改造成lmdb格式 

  sudo ./examples/mnist/train_lenet.sh #训练模型 

  8、安装digits（最好参考 
 官网） 

  方法1，安装digits5.0.0（首选）： 

  # 对于Ubuntu 16.04 

  CUDA_REPO_PKG=http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu1604/x86_64/cuda-repo-ubuntu1604_8.0.61-1_amd64.deb 

  ML_REPO_PKG=http://developer.download.nvidia.com/compute/machine-learning/repos/ubuntu1604/x86_64/nvidia-machine-learning-repo-ubuntu1604_1.0.0-1_amd64.deb 

  # 安装repo包 

  wget "$CUDA_REPO_PKG" -O /tmp/cuda-repo.deb && sudo dpkg -i /tmp/cuda-repo.deb && rm -f /tmp/cuda-repo.deb 

  wget "$ML_REPO_PKG" -O /tmp/ml-repo.deb && sudo dpkg -i /tmp/ml-repo.deb && rm -f /tmp/ml-repo.deb（这段时间有点问题，假如有错误，则参考本小节最后的 
 提示） 

  # 安装digits 

  sudo apt-get update 安装digits 

  sudo apt-get install digits（首选方式，这种方法只是安装digits5.0.0版本，bug比较小，官网说这个就已经自动附带安装很多依赖） 

  启动digits 

 
 在浏览器中填入： 

 
 http://localhost/ 
 （这是按照sudo apt-get install digits 
 这种方式安装的打开方法） 

 
 按回车即可 

 
 #卸载digits 

 
 比较容易卸载 

 
 sudo apt-get remove digits 

 
 sudo apt-get autoremove 

 
 注意：这个是老式的装法，虽然官网已经改为下面的方法了，但任然可以用。 

  方法2，安装digits6.1.0（bug很多）： 

  # For Ubuntu 16.04 

  CUDA_REPO_PKG=http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu1604/x86_64/cuda-repo-ubuntu1604_8.0.61-1_amd64.deb 

  ML_REPO_PKG=http://developer.download.nvidia.com/compute/machine-learning/repos/ubuntu1604/x86_64/nvidia-machine-learning-repo-ubuntu1604_1.0.0-1_amd64.deb 

  # Install repo packages 

  wget "$CUDA_REPO_PKG" -O /tmp/cuda-repo.deb && sudo dpkg -i /tmp/cuda-repo.deb && rm -f /tmp/cuda-repo.deb 

  wget "$ML_REPO_PKG" -O /tmp/ml-repo.deb && sudo dpkg -i /tmp/ml-repo.deb && rm -f /tmp/ml-repo.deb（这段时间有点问题，假如有错误，则参考本小节最后的 
 提示） 

  # Download new list of packages 

  sudo apt-get update 安装digits 

  下载源文件 

  DIGITS_ROOT=~/digitsgit 

  clone https://github.com/NVIDIA/DIGITS.git $DIGITS_ROOT 

  按照依赖 

  sudo pip install -r $DIGITS_ROOT/requirements.txt 

  sudo pip install -e $DIGITS_ROOT 

  启动 

  cd 
 ~/digitsgit  

  ./digits-devserver 

 
 http://localhost:5000 

  卸载: 

这个卸载直接删除digits文件夹便可,因为是直接克隆下来的.

注意：

  1, digits6.1.0的bug很多，我碰到最多的问题是尽管caffe用命令行可以使用cudnn，但是在digits6.1.0就经常有下面这个错误 

  “cudnn_conv_layer.cpp:53] Check failed: status == CUDNN_STATUS_SUCCESS (4 vs. 0) CUDNN_STATUS_INTERNAL_ERROR” 

  而我最后还是不知道怎么搞，一个星期的时间还是搞不定，所以放弃了，选择了安装digits5.0.0。 

  2, digits是需要cudnn的,所以显卡计算能力小于3的电脑没办法用digits. 

  提示：在安装digits的时候，有一个bug是： 

  Failed to add GPGKEY at http://developer.download.nvidia.com/compute/machine-learning/repos/ubuntu1604/x86_64/7fa2af80.pub to apt keys. 

  可以参考 
 帖子 
 解决，我已经解决。 

常见错误汇总

  错误：ImportError: No module named caffe 

  原因：就是说没有在bash的引用的环境变量中添加caffe 

  解决方法： 

  sudo gedit /etc/profile 

  export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/home/learning/caffe/python #这个结合自己自身电脑caffe文件夹下哒python文件夹路径设置 

  source /etc/profile 

  如果还报错，那就之前没有编译好caffe，所以从第6步开始: 

  make clean 

  make all 

  make pycaffe -j16 

  make test -j16 

  make runtest -j16 

  错误：ImportError: No module named skimage.io 

  解决方法： 

  sudo apt-get install python-skimage 

  sudo apt-get update 

  错误：python/caffe/_caffe.cpp:10:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory 

  解决方法： 

  cd caffe 进入caffe根目录 

  打开Makefile.config，在PYTHON_INCLUDE上，将路径设置为 

  /usr/local/lib/python2.7。 

  将原来/usr/include/python2.7的文件全部复制到/usr/local/lib/python2.7下。 

  错误：./train_lenet.sh: 4: ./train_lenet.sh: ./build/tools/caffe: not found 

  原因：因为错误提示找不到caffe工具，但工具存在，所以要在caffe根目录下执行，才可以寻找到其他目录的路径。 

  解决方法： 

  cd caffe 

  ./examples/mnist/train_lenet.sh 

  错误：Cannot use GPU in CPU-only Caffe: check mode. 

  原因：因为在make caffe的时候，把Makefile.config设置成了只要CPU计算 

  解决方法：所以需要把mnist文件夹下的lenet_solver.prototxt改成CPU训练。 

  错误：mdb_status == 0 (2 vs. 0) No such file or directory 

  原因：因为没有准备好数据 

  解决方法： 

  ./caffe/data/mnist/get_mnist.sh #下载数据 

  ./caffe/examples/mnist/create_mnist.sh #把数据改造成lmdb格式 

  ./caffe/examples/mnist/train_lenet.sh #训练模型 

  错误：AttributeError: 'google.protobuf.pyext._message.RepeatedScalarConta' object has no attribute '_value 

  原因：因为你的protobuf的版本不对造成的，用pip install protobuf安装的版本号默认是最新的3.2.0。但是caffe不支持高于3.0.0版本的protobuf。 

  解决方法： 

  pip uninstall protobuf（卸载当前protobuf） 

  pip install protobuf==2.6.1（再指定安装低版本的，版主这里用的是2.6.1） 

  注意：发现在终端安装protobuf的时候，是将其安装到python3.5中，我的解决方法是同时在python3.5，python2.7中收索protobuf相关的文件。之后复制3.5里边有关protobuf的文件替换掉2.7里边相应的protobuf文件。 

  错误：Exception: "dot" not found in path. 

  解决方法： 

  安装：sudo apt-get insall graphviz 

  然后安装pydot：pip install pydot 

  错误：Check failed: status == CUDNN_STATUS_SUCCESS (6 vs. 0) CUDNN_STATUS_ARCH_MISMATCH 

  原因：项目默认是开启cudnn的，而CUDNN要求GPU CUDA Capability 不小于3.0（对于不满足条件的GPU，需要在项目中关闭CUDNN。preprocessor definitions 里面删除USE_CUDNN，也就是说本机显卡不支持cudnn。所以需要Makefile.config中注释掉USE_CUDNN这行，重新编译caffe。 

  解决方法： 

  sudo gedit caffe/Makefile.config 

  注释掉USE_CUDNN 

  make all 

  进入python 

  import caffe （测试） 

  错误： File "/home/ly/caffe/python/caffe/pycaffe.py", line 13, in <module> 

  from ._caffe import Net, SGDSolver, NesterovSolver, AdaGradSolver, \ 

  ImportError: No module named _caffe 

  原因：提示说在 "/home/ly/caffe/python/caffe/pycaffe.py"中需要用到几个梯度优化，但是没有模块叫caffe，因为没编译好pycharm，所以python接口不完善 

  解决方法： 

  cd caffe 

  sudo make clean 

  sudo make pycaffe 

  错误：Check failed: error == cudaSuccess (38 vs. 0) no CUDA-capable device is detected 

  原因：是cudn、cudnn出错了， 

  进入 samples/bin/x86_64/linux/release， 

  ./deviceQuery（运行deviceQuery），可以测试 

  解决方法： 

  我是重装cudn、cudnn 

  错误：E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1) 

  原因：缺失依赖包 

  解决方法： 

  sudo apt-get check 

  sudo apt-get clean 

  sudo apt-get install -f 

  错误：Unsupported gpu architecture 'compute_20 

  原因：cuda版本与兼容性 

  解决方法： 

  sudo gedit Makefile.config 

  然后根据自己的cuda根据该文档提示注释掉相应的版本的 

  CUDA_ARCH := #-gencode arch=compute_20,code=sm_20 \ 

  #-gencode arch=compute_20,code=sm_21 \ 

  错误：[ FAILED ] RMSPropSolverTest/0.TestSnapshotShare, where TypeParam = caffe::GPUDevice<float> 

  原因：可能是因为配置了多显卡环境，可以使用安装CUDA时运行./deviceQuery时标注的0号GPU("Device 0")跑跑测试试试看。 

  解决方法： 

  export CUDA_VISIBLE_DEVICES=0 

  然后重新make runtest 

  错误： [ FAILED ] RMSPropSolverTest/0.TestSnapshot, where TypeParam = caffe::CPUDevice<float> 

  原因：如果使用了Intel MKL作为BLAS,可能是Intel MKL的浮点数计算功能没有设置正确。 

  方法：使用如下命令： 

  export MKL_CBWR=AUTO 

  然后重新make runtest 

我的Makefile.config内容：

## Refer to http://caffe.berkeleyvision.org/installation.html
# Contributions simplifying and improving our build system are welcome!

# cuDNN acceleration switch (uncomment to build with cuDNN).
 USE_CUDNN := 1

# CPU-only switch (uncomment to build without GPU support).
# CPU_ONLY := 1

# uncomment to disable IO dependencies and corresponding data layers
# USE_OPENCV := 0
# USE_LEVELDB := 0
# USE_LMDB := 0

# uncomment to allow MDB_NOLOCK when reading LMDB files (only if necessary)
#	You should not set this flag if you will be reading LMDBs with any
#	possibility of simultaneous read and write
# ALLOW_LMDB_NOLOCK := 1

# Uncomment if you're using OpenCV 3
# OPENCV_VERSION := 3

# To customize your choice of compiler, uncomment and set the following.
# N.B. the default for Linux is g++ and the default for OSX is clang++
# CUSTOM_CXX := g++

# CUDA directory contains bin/ and lib/ directories that we need.
CUDA_DIR := /usr/local/cuda
# On Ubuntu 14.04, if cuda tools are installed via
# "sudo apt-get install nvidia-cuda-toolkit" then use this instead:
# CUDA_DIR := /usr

# CUDA architecture setting: going with all of them.
# For CUDA < 6.0, comment the *_50 through *_61 lines for compatibility.
# For CUDA < 8.0, comment the *_60 and *_61 lines for compatibility.
# For CUDA >= 9.0, comment the *_20 and *_21 lines for compatibility.
CUDA_ARCH := -gencode arch=compute_30,code=sm_30 \
		-gencode arch=compute_35,code=sm_35 \
		-gencode arch=compute_50,code=sm_50 \
		-gencode arch=compute_52,code=sm_52 \
		-gencode arch=compute_60,code=sm_60 \
		-gencode arch=compute_61,code=sm_61 \
		-gencode arch=compute_61,code=compute_61

# BLAS choice:
# atlas for ATLAS (default)
# mkl for MKL
# open for OpenBlas
BLAS := atlas
# Custom (MKL/ATLAS/OpenBLAS) include and lib directories.
# Leave commented to accept the defaults for your choice of BLAS
# (which should work)!
# BLAS_INCLUDE := /path/to/your/blas
# BLAS_LIB := /path/to/your/blas

# Homebrew puts openblas in a directory that is not on the standard search path
# BLAS_INCLUDE := $(shell brew --prefix openblas)/include
# BLAS_LIB := $(shell brew --prefix openblas)/lib

# This is required only if you will compile the matlab interface.
# MATLAB directory should contain the mex binary in /bin.
# MATLAB_DIR := /usr/local
# MATLAB_DIR := /Applications/MATLAB_R2012b.app

# NOTE: this is required only if you will compile the python interface.
# We need to be able to find Python.h and numpy/arrayobject.h.
PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7 \
		/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include
# Anaconda Python distribution is quite popular. Include path:
# Verify anaconda location, sometimes it's in root.
# ANACONDA_HOME := $(HOME)/anaconda
# PYTHON_INCLUDE := $(ANACONDA_HOME)/include \
		# $(ANACONDA_HOME)/include/python2.7 \
		# $(ANACONDA_HOME)/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include

# Uncomment to use Python 3 (default is Python 2)
# PYTHON_LIBRARIES := boost_python3 python3.5m
# PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python3.5m \
#                 /usr/lib/python3.5/dist-packages/numpy/core/include

# We need to be able to find libpythonX.X.so or .dylib.
PYTHON_LIB := /usr/lib
# PYTHON_LIB := $(ANACONDA_HOME)/lib

# Homebrew installs numpy in a non standard path (keg only)
# PYTHON_INCLUDE += $(dir $(shell python -c 'import numpy.core; print(numpy.core.__file__)'))/include
# PYTHON_LIB += $(shell brew --prefix numpy)/lib

# Uncomment to support layers written in Python (will link against Python libs)
 WITH_PYTHON_LAYER := 1

# Whatever else you find you need goes here.
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/include/hdf5/serial
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

# If Homebrew is installed at a non standard location (for example your home directory) and you use it for general dependencies
# INCLUDE_DIRS += $(shell brew --prefix)/include
# LIBRARY_DIRS += $(shell brew --prefix)/lib

# NCCL acceleration switch (uncomment to build with NCCL)
# https://github.com/NVIDIA/nccl (last tested version: v1.2.3-1+cuda8.0)
# USE_NCCL := 1

# Uncomment to use `pkg-config` to specify OpenCV library paths.
# (Usually not necessary -- OpenCV libraries are normally installed in one of the above $LIBRARY_DIRS.)
# USE_PKG_CONFIG := 1

# N.B. both build and distribute dirs are cleared on `make clean`
BUILD_DIR := build
DISTRIBUTE_DIR := distribute

# Uncomment for debugging. Does not work on OSX due to https://github.com/BVLC/caffe/issues/171
# DEBUG := 1

# The ID of the GPU that 'make runtest' will use to run unit tests.
TEST_GPUID := 0

# enable pretty build (comment to see full commands)
Q ?= @

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成功安装ubuntu16.04+cuda9.0+cuDNN7.0.5+caffe+digits（附错误汇总）

成功安装ubuntu16.04+cuda9.0+cuDNN7.0.5+caffe+digits（附错误汇总）本机硬件：双核i7 内存8G 显卡GTX070（不好意思，比较水）安装顺序：依赖包-->驱动-->cuda-->cudnn-->caffe --> digits-->测试时间：2017-12-26转载请注明出处: http://note.youdao.com/noteshar
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