vasp文件准备和配套软件

vasp使用流程：

1）使用Materials Studio（MS）准备结构文件， 

2）采用vaspkit生成vasp的4个输入文件：POSCAR，POTCAR，KPOINTS，INCAR。其中生成POSCAR需要使用MS制作的结构文件（*.xsd），生成POTCAR文件需要使用POSCAR和赝势库。生成KPOINTS文件时会自动生成INCAR文件。

3）提交vasp执行命令（mpirun -np 50 vasp_std），获得OUTCAR、CONTCAR、DOSCAR、EIGENVAL、CHGCAR、IBZKPT以及ELFCAR等输出文件

4）采用VESTA可视化输出结果

注：编辑输入输出文件可使用VS code、Sublime Text、Atom等软件

配套软件

1. vaspkit

官方教程和下载地址：Installation — VASPKIT 1.5 documentation

解压缩

tar -zxvf vaspkit.1.3.5.tar.gz

配置文件

cd vaspkit.1.3.5
cp -f how_to_set_environment_variable ~/.vaspkit
gedit ~/.vaspkit

通常只需要修改.vaspkit文件中如下内容

LDA_PATH       ~/POTCAR/LDA     #  Path of LDA potential.
PBE_PATH       ~/POTCAR/PBE     #  Path of PBE potential.
GGA_PATH       ~/POTCAR/GGA     #  Path of PW91 potential.
POTCAR_TYPE    PBE              #  PBE, PW91 or LDA

上述内容代表赝势的类型和路径，此处采用PBE赝势

附：赝势库下载地址https://download.csdn.net/download/liouver/89306389?spm=1001.2014.3001.5503

最后将vaspkit的绝对路径加入环境变量

echo 'export PATH=~/vaspkit.1.3.5/bin/:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

使用vaspkit生成KPOINT文件，参考：vaspkit生成vasp的KPOINT文件-CSDN博客

2. VEST

官方教程和下载地址：Download - VESTA

下载稳定（Stable version）版本，development version可能会出问题。

解压缩

tar -xvjf VESTA-gtk3.tar.bz2 

创建环境变量

echo 'export PATH=~/VESTA-gtk3/bin/:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

在终端输入VESTA即可运行软件

注：若出现如下错误 error while loading shared libraries: libGLU.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory，则需要安装libglu

 sudo apt install libglu1