浅谈Slurm作业调度系统

1.相关基本概念

资源（Resource）

• 作业运行过程中使用的可量化实体都是资源；
• 包括硬件资源（节点、内存、CPU 、GPU等）和软件资源（ License ）；

集群（Cluster）

• 包含计算、存储、网络等各种资源实体且彼此联系的资源集合；
• 在物理上，一般由计算处理、互联通信、I/O 存储、操作系统、编译器、运行环境、开发工具等多个软硬件子系统组成；
• 节点是集群的基本组成单位，从角色上一般可以划分为管理节点、登陆节点、计算节点、存储节点等。

作业（Job）

• 物理构成，一组关联的资源分配请求，以及一组关联的处理过程；
•  交互方式，可以分为交互式作业和非交互式作业；
• 资源使用，可以分为串行作业和并行作业；

分区（Partition）

• 带名称的作业容器；
• 用户访问控制；
•  资源使用限制；

 作业调度系统（Job Schedule System）

• 负责监控和管理集群中资源和作业的软件系统；
•  通常由资源管理器、调度器、任务执行器，以及用户命令和API组成；

调度系统主要作用

单一系统映像

• 解决集群结构松散问题；
• 统一用户接口，使用简化；

系统资源整合

• 管理异构资源和异构系统；

多任务管理

• 统一管理任务，避免冲突；

 资源访问控制

• 基于策略的资源访问控制；

换句话说，调度系统是面向集群的操作系统。

Slurm

        Slurm是一个开源，容错，高度可扩展的集群管理和作业调度系统，适用于大型和小型Linux集群。Slurm不需要对其操作进行内核修改，并且相对独立。作为集群工作负载管理器，Slurm有三个关键功能。首先，它在一段时间内为用户分配对资源（计算节点）的独占和/或非独占访问，以便他们可以执行工作。其次，它提供了一个框架，用于在分配的节点集上启动，执行和监视工作（通常是并行作业）。最后，它通过管理待处理工作的队列来仲裁资源争用。

2.Slurm的运行架构

（1）主控服务slurmctld

故障切换 资源监控 队列管理 作业调度

（2）记账存储服务slurmdbd
  记账数据 配置信息 故障切换
 （3）数据库MySQL
  记账和配置信息存储
（4）计算代理slurmd
  启动任务 监控任务 分层通信
 （5）认证服务munge
     内部通信认证

3.Slurm的主要特点

• 架构设计优秀

扩展性（功能/规模）高性能（提交/调度）灵活性（自定义插件）容错性（服务/节点/作业

• 特色功能突出

资源绑定（CPU、MEM、类GPU加速卡等各类资源）关联调度（如类GPU加速卡关联CPU）

能耗管理（限频、开关机、记账等）拓扑调度（基于拓扑结构调度，限定交换机数等）

• 基础功能完善

优先级策略（Multi-Factor）
作业调度（FairShare/Backfill/ FCFS, etc）
资源竞争（Exclusive/Preempt/Gang, etc）
多级限制（Cluster/Account/User/Partition, etc）
资源预留（CPU/MEM/类GPU加速卡/License等）

• 兼容性/交互性良好

MPI兼容（IntelMPI/MVAPICH/OpenMPI,etc）
LSF兼容（bsub/bjobs/bqueue/bhosts, etc）
PBS兼容（qsub/qstat/pbsnodes/pestat, etc）
分析工具（融合Influxdb/ES/HDF5等，方便分析）

4.三种模式

批处理作业（采用sbatch命令提交，最常用方式）：

        对于批处理作业（提交后立即返回该命令行终端，用户可进行其它操作）使用sbatch命令提交作业脚本，作业被调度运行后，在所分配的首个节点上执行作业脚本。在作业脚本中也可使用srun命令加载作业任务。提交时采用的命令行终端终止，也不影响作业运行。

交互式作业提交（采用srun命令提交）：

        资源分配与任务加载两步均通过srun命令进行：当在登录shell中执行srun命令时，srun首先向系统提交作业请求并等待资源分配，然后在所分配的节点上加载作业任务。采用该模式，用户在该终端需等待任务结束才能继续其它操作，在作业结束前，如果提交时的命令行终端断开，则任务终止。一般用于短时间小作业测试。

实时分配模式作业（采用salloc命令提交）：

         分配作业模式类似于交互式作业模式和批处理作业模式的融合。用户需指定所需要的资源条件，向资源管理器提出作业的资源分配请求。提交后，作业处于排队，当用户请求资源被满足时，将在用户提交作业的节点上执行用户所指定的命令，指定的命令执行结束后，运行结束，用户申请的资源被释放。在作业结束前，如果提交时的命令行终端断开，则任务终止。典型用途是分配资源并启动一个shell，然后在这个shell中利用srun运行并行作业。

注意：

（1）salloc后面如果没有跟定相应的脚本或可执行文件，则默认选择/bin/sh，用户获得了一个合适环境变量的shell环境。

（2）salloc和sbatch最主要的区别是salloc命令资源请求被满足时，直接在提交作业的节点执行相应任务，而sbatch则当资源请求被满足时，在分配的第一个节点上执行相应任务。

（3）salloc在分配资源后，再执行相应的任务，很适合需要指定运行节点和其它资源限制，并有特定命令的作业。

5.相关命令

（1）查看分区——sinfo

sinfo命令参数
-p <partition>, --partition=<partition>	查看指定分区的状态，对应环境变量SINFO_PARTITION。 示例：sinfo -p caspra
-n <nodes>, --nodes=<nodes>	查看指定节点的信息。 示例：sinfo -p caspra -n e02r4n[00-19]
-N, --Node	以面向节点（默认为分区）的格式打印信息，每行一个节点。 示例：sinfo -N -p caspra -n e02r4n[00-19]
-t <states> , --states=<states>	查询指定节点状态的分区或节点的信息。 常见状态包括：alloc idle drain down drng
-t <states> , --states=<states>	查询指定节点状态的分区或节点的信息。 常见状态包括：alloc idle drain down drng
-s, --summarize	查看分区中节点状态的摘要信息。 主要是限制分区中节点的状态统计，如已分配数alloc、空闲数idle、总数total等
-o <output_format>, --format= <output_format	按照指定的格式显示信息，对应变量SINFO_FORMAT。 格式为“%[[.]size]<type> %[[.]size]<type> …”。 其中，点号（.）表示右对齐，size表示字段长度，type为代表特定字段的字符（或字符串）。 示例如下： sinfo -o %all 以数显分隔的形式显示所有字段。 sinfo -o "%9P %.5a %.10l %.6D %.6t %N" 显示内容：分区名-分区状态 -最大运行时间-节点数-节点状态-节点列表
-O <output_format>, --Format= <output_format>	按照指定的字段显示状态信息。 格式为“type[:[.]size],type[:[.]size],…”。 其中，type为代表特定字段的字段名，点号（.）表示右对齐，size表示字段长度。示例如下： sinfo -O all sinfo -O Partition:9,available:.6,time:.11,nodes:.6,statecompact:.6,nodelist:.12

（2）查询排队和运行状态的作业——squeue

参数	说明
-A, --account=account(s)	查询指定账号的作业，默认全部账号下的作业
-j, --jobs <job_id_list>	查看指定JOB IDS的作业信息， 默认显示全部
-n, --name=<name>	查看指定名称的作业信息
-p, --partition=<names>	查看指定分区的作业信息
--state=<names>	指定状态查看作业信息
--users=<names>	指定用户名称查看作业信息

（3）删除作业命令——scancel

命令	解释
scancel <jobid>	删除指定作业
scancel -t ST	删除指定状态的作业
scancel --account=<name>	删除指定账号的作业
scancel --name=<name>	删除指定名称的作业
scancel --partition=<names>	删除指定分区的作业
scancel --reservation=<name>	删除指定预约名称的作业
scancel --state=<names>	删除指定状态的作业
scancel --user=<name>	删除指定用户的作业
scancel --nodelist=<names>	删除指定节点的作业

（4）控制作业命令——scontrol

命令	解释	备注
scontrol suspend <jobid>	挂起作业	运行作业可挂起
scontrol resume <jobid>	恢复作业	挂起作业可恢复
scontrol requeue <jobid>	作业重新排队	运行作业可重新排队
scontrol hold <id/name>	保留作业	排队作业可保留
scontrol release <id/name>	释放作业	保留作业可释放