DNA序列

写博客是要继续写下去的,但是不能简单的把做好的结果粘贴就行了,而更多的应该是去记录解题的方法思路,以及遇到的错误,这样才是有意义的。


描述: 

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

 

 
知识点:  字符串 
题目来源:  内部整理 
练习阶段:  初级 
运行时间限制: 10Sec
内存限制: 128MByte
输入:  

输入一个string型基因序列,和int型子串的长度

 
输出:  

找出GC比例最高的字串

 
样例输入:
AACTGTGCACGACCTGA
5

                   
样例输出:
GCACG

                    



首先在做题之前,把思路写下来:

这题很简单,就是遍历定长字符串以寻找gc比率最高的段,并记录下来。不要考虑较大数据以及效率问题,我是没有能力再去考虑这些了,要看清啊。


遇到问题:

忘记c++字符串的截取操作函数,百度 c++ substr再次想起:

substr 方法
  返回一个从指定位置开始,并具有指定长度的子字符串。
  参数 
  start 
  必选。所需的子字符串的起始位置。字符串中第一个字符的索引为 0。
  length 
  可选项。返回的子字符串中包含的字符数。
  备注 
  如果 length 为 0 或负数,将返回一个空字符串。如果没有指定该参数,则子字符串将延续到字符串的结尾。

bug清理:

str.length(),以为string的字符串长度为其属性,其实是方法。


提交:


#include <iostream>;
#include <string>

using namespace std;
void main(){
	string str,outstr="";
	int size = 1;
	cin>>str;
	cin>>size;
	int times = str.length()-size + 1;
	int maxGC = 0;
	int GC;
	for(int i = 0 ; i < times ; i++){
		GC = 0;
		for( int  j = 0 ; j < size;j++){
			if(str[i + j ] == 'G' || str[i+j ] == 'C' )
				GC++;
		}
		if( GC > maxGC){
			maxGC = GC;
			outstr = str.substr(i,size);
		}
	}
	cout<<outstr;
}

结果:

正确通过。




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