Krona绘制物种或功能组成圈图

简介：

Krona采用多图层饼图，交互式探索层级数据。软件同时支持Linux命令行脚本和图片界面下Excel插件+模板，方便所有用户使用。结果为html网页文件，可用浏览器方便交互式查看。

linux安装

应该是最新的安装方法，不知道为什么conda找不到资源

#安装
wget https://github.com/marbl/Krona/releases/download/v2.8/KronaTools-2.8.tar #或者下载到本地，再上传至服务器 
tar vxf KronaTools-2.8.tar
cd KronaTools-2.8.tar
./install.pl --prefix=`path` #不加路径也可以，直接默认安装在 KronaTools-2.8.tar/bin/下面
#测试
wget http://krona.sourceforge.net/examples/text.txt
ktImportText text.txt

生成text.krona.html，下载或直接查看吧。
其他问题相关链接：
Krona-issues
Installing

Excel插件安装和使用

插件安装

支持绝大多数Windows和Mac用户

Windows: Microsoft Office 97 or later 【只支持EXCEL，wps不可以】

Mac: Microsoft Office:Mac 2011 or later

插件下载链接 插件下载链接

，仅有364kb

下载后解压，双击运行install_Windows.vbs文件(Mac用户请选择install_Mac.app)，马上弹出安装完成提示。

绘图实战

1. 使用Excel打开下载解压目录中Krona.xltm，然后你会看到如下：

excel显示宏禁用，点击“启用内容”；
数据格式解读：
Granola列为样品名称，其中gram为是样品的物种丰度信息（统计数量）；healthiness（属性信息）列是非必须的，可以不填写。Serving列是对应的分类水平，每个Category是一个分类水平，如物种分类等级（可以是门纲目科属种），或KEEG功能3级注释），我们可以直接用该文件进行绘图。

我这里的文件只用了一个gram，有多个gram的话，可以点击选择不同样品的统计值构图。

我的文件：

数据可按参考格式填写，点击Create chart可弹出另存窗口，直接保存绘图结果为html网页格式。其中另一个Clear按扭可以清空数据，方便重新添写新数据。
图片：
注意图片是可交互的，双击局部可马上重新计算并绘图，查看数据很方便。

注：但是这个软件，不能将物种和属名字修改为斜体。
并且不能保存为矢量图，只能保存为png格式