华为OJ:DNA序列

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。
给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度

输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

输入例子:
AACTGTGCACGACCTGA
5

输出例子:
GCACG

解析:
#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;

int main()
{
    string str;
  int i,j,n;

  //string max_str;
    while(cin>>str)
    {
        cin>>n;
        int max_sum = 0;
        int maxi;
        for(i=0;i<str.length();++i)
        {
            int count_gc = 0;
            for(j=0;j<n;++j)
            {
                if(str[i+j]=='G'||str[i+j]=='C')
                    {
                        count_gc++;
                    }
            }
            if(count_gc>max_sum)
                {
                    max_sum = count_gc;
                    maxi = i;
                }
        }
        for(i=0;i<n;++i)
        {
            cout<<str[maxi+i];
        }
        cout<<endl;
    }
    return 0;
}
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