我的AI存储实践及思考

lizhongwen1987

已于 2023-10-11 14:35:30 修改

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分类专栏：存储文章标签：人工智能存储

于 2023-10-11 14:35:02 首次发布

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本文作者分享了人工智能行业存储方案从Lustre到BeeGFS+Ceph再到DAOS的变迁，强调了AI训练对存储系统的新需求，特别是高吞吐、低延迟和扩展性。作者认为DAOS可能成为未来的选择，因为其支持新技术和更高的性能要求。

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前言

我从2020年进入人工智能行业，开始为AI训练提供存储解决方案及技术支持，随着这几年行业以及公司的发展，采用的存储方案经历了几次大的演变，最开始使用的是分布式并行文件系统Lustre，接着是BeeGFS+Ceph，再到最近的分布式异步对象存储DAOS，本文结合自己的经历，将历次存储架构/方案选型的背景，考量及部署，思考记录如下（保密要求，略过了部分配置及拓扑细节），供参考。

第一阶段

在2020年之前，国内AI还是以计算机视觉为主，如：AI四小龙，聚焦在计算机视觉，语音识别等方向的算法优化，以提高人脸，图形，物体的识别率，主要用于智能安防，智慧城市，智慧教育等行业。主要的训练数据类型是图片，音频。

AI与HPC有相似的地方，比如：都能用于科学技术，都需要高效的计算能力，都需要处理不断增长的数据集等，TensorFlow，PyTorch等机器学习框架对posix文件系统接口支持也更友好，因此在这个时期我们直接选用了HPC领域使用最广泛的文件系统Lustre作为AI存储基础设施。Lustre是一个Linux集群并行文件系统，提供了符合POSIX标准的UNIX文件系统接口，这对于不熟悉/没有存储背景的科研人员/Ai研究员非常友好，可以像访问本地文件数据一样访问Lustre文件系统上的数据。

与现在流行的分布式存储系统不同，Lustre没有实现原生的数据可靠性机制，服务的可用性也需要借助外部机制实现。为提供可靠的存储服务，综合考虑性价比，对于容量集群：在硬件层面，我们提供2节点MDS+2（2+）节点OSD的Lustre集群，采用IP-SAN盘阵作为Lustre系统的后端持久化介质，典型的配置：每个机头节点包含2颗62xx系列的CPU+512GB DDR4内存+100Gbps RoCE网络，24盘位的SATA-SSD盘阵组成RAID10作为Lustre MDT通过多路径挂载到两个MDS节点，80盘位的SAS-HDD盘阵组成RAID6作为Lustre OST通过多路径挂载到两个OSD节点；在系统和软件层面，2.10.x/2.12.x版本的Lustre部署在CentOS7.6/7.9系统上，2节点MDS组成Active-standy模式，通过crosync+pacemaker实现故障时的MDT和OST资源转移，提供5分钟级的故障恢复能力。

Lustre缓存集群没有强可靠性要求，因此直接使用存储节点上的本地NVMe SSD来搭建，6节点组成100TB的高性能集群，典型的硬件配置：每个节点包含2颗62xx系列的CPU+512GB DDR4内存+100Gbps RoCE网络+若干4TB的 NVMe SSD，在系统和软件层面，2.10.x/2.12.x版本的Lustre部署在CentOS7.6/7.9系统上。MemCache缓存集群使用各计算节点上的内存构成分布式缓存（提供对小于1MB图片的缓存）。

得益于Lustre系统良好的稳定性及性能，该存储方案较好的支持了公司的Ai训练业务及工作负载，截止2021年底，我们上线了数十套容量在500TB~3PB不等的Lustre容量集群以及数十套容量在100TB的Lustre缓存集群，总计存放了数十PB的数据集。在每个Ai训练（Slurm计算）分区，我们提供一套Lustre容量集群、一套Lustre缓存集群以及一套MemCache缓存集群作为整套存储方案，Lustre容量集群用于存储本分区的所有数据集，Lustre缓存集群作为用户家目录，主要用于存放训练代码，MemCache缓存集群用于加速训练中的图片访问。

第二阶段

从2021年初开始，随着积累的训练数据越来越多，每套集群数十亿平均几十KB的小图片以及单次Ai训练数据集规模从数十万~ 数百万增长到数千万~亿级小图片，运营Lustre集群过程中遇到的问题越来越多：

升级困难，集群可用性降低：Lustre是纯内核态实现，支持不足，修复Bug或者想要使用新特性需要停机升级，导致数小时不可用
数据孤岛，数据归集困难：分散各地的训练集群通过专线连接，跨地域跨集群访问效率低下，数据迁移困难
大量小文件，集群性能遇瓶颈：单集群数十亿单数十KB的图片，Lustre 元数据服务MDS遇到容量和性能瓶颈
并发训练，集群稳定性降低：训练程序与MemCache集群争抢内存，导致oom，Lustre过载导致客户端hang
集群众多，管理复杂：数十套集群，权限管理及资源分发运营量大，数据管理复杂

于是我们启动了Lustre的替代计划，首先我们分析了Ai训练过程及对存储的要求，如下表

		数据采集	预处理	模型训练	推理
		是指通过网络爬虫，数据采购等方式收集模型训练所需要的原始数据并储存起来（主要是图片）	对采集的原始数据进行清洗和处理，如：去重，填充缺失值、删除异常值，（人工）标注等	主要是根据预定的目标和要求，选择合适的机器学习算法或构建深度学习网络（主要是CNN，RNN等），对预处理后的数据进行训练，建模	利用训练好的模型对新的数据进行预测，并将预测结果应用到实际场景中，例如分类、回归、聚类等
存储需求		具备处理高度多变数据格式的灵活性	减少数据准备时间	缩短训练时间	具备处理高度多变数据格式的灵活性
对存储系统的要求	访问模式	随机写	随机	随机	随机
	工作负载	写密集型	读写混合	读密集型（某些写入来自checkpoint）	读密集型
	I/O大小	小	小	小	小
	服务质量	高	高	非常高	非常高
	IOPS	非常高	非常高	非常高	中等

厘清需求后，我们分析调研了IO 500榜单中及各流行的开源存储系统，如：Ceph，BeeGFS，Glusterfs，SeaweedFS，JuiceFS，CubeFS，DAOS等，结合上述的存储需求及自身的研发能力，从存储系统的可靠性，可用性，可维护性，可扩展性，社区支持能力，性能等11个指标对主流的系统进行了评估以及测试，鉴于BeeGFS对Posix的良好支持、优秀的扩展能力及优异的性能表现等，Ceph优秀的稳定性及活跃的社区支持等，最终我们选择了BeeGFS+Ceph OSS作为我们新的Ai存储技术方案。

BeeGFS可以看作是应用态实现的增强型的Lustre版本，其除私有客户端在内核态实现，服务端组件都在应用态实现，相比Lustre极大的简化了维护成本以及降低了开发难度，相比Lustre，BeeGFS的增强主要体现在：分布式的MDS集群，可以轻松扩展到数十组节点，支持数PB的容量以及基于副本的可靠性，BeeGFS也有不足的地方，如：单节点MGS，不支持QoS，依赖本地文件系统（Ext4、XFS、ZFS）的Quota，单目录文件数受限等，因此在上线前，我们也对这些方面进行了增强：实现了基于Raft的MGS，多副本的可靠性，基于目录的QoS，基于目录/用户/用户组的Quota等。在我们的方案中，BeeGFS用作用户家目录，存放代码仓库以及训练数据缓存，因此，我们采用高配置部署，每套集群包含数十台节点，提供数PB容量，千万级IOPS：每个节点包含2颗63xx系列的CPU+512GB DDR4内存+100Gbps RoCE网络+若干7.68TB的 NVMe SSD。

Ceph OSS得益于其优秀的稳定性，在国内被大规模的使用，是用作数据湖的不错选项。在我们的方案中，Ceph OSS用作原始数据仓，提供HDD存储池以及SSD存储池，HDD存储池用于存放采集的原始数据，鉴于数据量较大，我们采用了大容量HDD磁盘，每套集群包含近百台节点，提供数十PB容量：每台节点包含2颗63xx系列的CPU+256GB DDR4内存+100Gbps RoCE网络+数十块18TB的SATA HDD，SSD用于存放处理后的数据以及checkpoint，兼具容量和性能，每套集群包含数十个节点，提供数PB容量：每个节点包含2颗63xx系列的CPU+512GB DDR4内存+100Gbps RoCE网络+若干7.68TB的 NVMe SSD。

为方便系统的运营管理，我们开发了一套数据管理系统，用于上线后的系统运维和运营，实现资源的可视化发放，用户数据的可视化管理，数据迁移等。

随着新采集数据的存入以及Lustre数据逐步迁移到新集群，截止2022年下旬，我们在两个机房分别上线了一套新架构存储集群： 2PB的BeeGFS+30PB的Ceph OSS HDD+4PB的Ceph OSS SSD，支撑了公司绝大部分的Ai训练任务及工作负载（少部分在Lustre上），存储网络示意图如下：
存储组网
随着Lustre数据逐步迁移，新存储架构成为公司主要Ai存储设施，Lustre系统面临的升级问题，数据孤岛问题，性能问题以及管理问题等都得到了极大的缓解及改善。

当前

上线以来，基于BeeGFS+Ceph OSS的Ai存储系统整体运行良好，目前仍然是我们线上的主存储系统，使用率已超过60%，随着大模型的火爆也带来了一些挑战。2022年11月OpenAI发布ChatGPT3.5后，国内也掀起了“LLM百团大战”。与计算机视觉以图片，音频，视频为训练数据不同，大模型的训练数据为文本，多模态则包含了文本，图片，后面可能还会包含音频，视频等。采集的文本，通常是数GB的文本文件，生成的tokenize文件也在数（十）MB，与计算机视觉的处理过程相同，大模型训练也包含4个阶段：

		数据采集	预处理	模型训练	推理
		是指通过网络爬虫，数据采购等方式收集模型训练所需要的原始数据并储存起来（主要是文本）	对采集的原始数据进行清洗和处理，如：去重，去广告，格式化，tokenize等	主要是根据预定的目标和要求，选择合适的机器学习算法或构建深度学习网络（主要是Transformer），对预处理后的数据进行训练，建模	利用训练好的模型对新的数据进行预测，并将预测结果应用到实际场景中，例如问答，生图等
存储需求		具备处理高度多变数据格式的灵活性	减少数据准备时间	缩短训练时间	具备处理高度多变数据格式的灵活性
对存储系统的要求	访问模式	顺序写	随机	随机	随机
	工作负载	写密集型	读写混合（可能达到50/50）	读密集型（某些写入来自checkpoint）	读密集型
	I/O大小	大	大	小	小
	服务质量	高	高	非常高	非常高
	吞吐量	非常高	非常高	非常高	中等

对比上述的两个表格，可以发现大模型对存储系统的要求比计算机视觉更高。计算机视觉训练更多的是随机小I/O，对IOPS和延迟更敏感，大模型训练则是混合I/O，对IOPS，吞吐及延迟都提出了很高的要求。

2023以来，随着大模型参数的急剧增长，以及新热点的出现，如：长文本处理，文图多模态训练等，当前BeeGFS+Ceph OSS的存储方案也面临挑战，主要表现在：

吞吐不足，带来训练加载以及checkpoint写入等待（对于checkpoint目前是先写到计算节点的本地NVMe盘，再异步回写到后端存储上）
目录或存储桶性能扩展性不足，导致目录或存储桶存放的文件数受限，大目录访问性能下降
存储效率偏低，BeeGFS和Ceph引擎面向HDD设计，NVMe的性能效率较低

鉴于此，Intel Daos再次进入了我们的视线，在此前考虑到产品的成熟度，稳定性以及Intel Optane停产风险等因素后，Daos被排除出第二阶段的候选方案。经过两年多的发展，基于（intel Optane）的Daos版本开始成熟，商业及云方案也开始出现，如：Google Cloud和IBM Cloud上的DAOS方案， Metadata-on-SSD的技术落地社区也在如火如荼的推进中（第一版已经发布），根据社区计划，预计24年Q1发布完整的Metadata-on-SSD的功能，考虑到DAOS对新型硬件的支持能力及未来CXL技术的发展和应用，和存储的发展趋势，我们认为：用DAOS方案替代BeeGFS+Ceph OSS方案是个值得尝试的选项，目前已经在内部测试及验证DAOS Metadata-on-SSD版本替代BeeGFS的可行性，第一阶段计划24年H1线上试点，取代新增的BeeGFS需求。

注：据观察了解，现在Ai项目还处于不计成本阶段，Ai基础设施的成本大头在计算（GPU）和高性能网络，而Ai的绝对数据量还不大（PB级），千亿级参数
Ai训练的数据集规模通常在数TB级别，就当下的实践而言，采用基于NVMe SSD的高性能分布式文件系统就能满足Ai工作负载要求。我们方案中采用的
BeeGFS是为HPC专门设计的并行文件系统，经过优化后也能很好的满足当前的需求。