使用python 读取不同格式文件的方法

整理下如何使用python查看不同格式文件的内容，涉及到的格式有plk, npy, mat, tif等。后面还有的话还会继续补充。

一、.plk格式文件

python中经常见到.plk格式的文件，如何读取并查看其内容呢？

import pickle

data_path = 'D:\\outputs.pkl'
with open(data_path, 'rb') as f:
     datas = pickle.load(f)

二、.npy格式文件

import numpy as np
datas = np.load('D:\\outputs.npy')

三、.mat格式文件

转自 https://www.jianshu.com/p/e14ba4d5fa18

import numpy as np
from scipy import io

mat = io.loadmat('D:\\outputs.mat')
# 如果报错:Please use HDF reader for matlab v7.3 files
# 改为下一种方式读取
import h5py
mat = h5py.File('D:\\outputs.mat')

# mat文件里可能有多个cell，各对应着一个dataset

# 可以用keys方法查看cell的名字, 现在要用list(mat.keys()),
# 另外，读取要用data = mat.get('名字'), 然后可以再用Numpy转为array
print(mat.keys())
# 可以用values方法查看各个cell的信息
print(mat.values())

# 可以用shape查看维度信息
print(mat['your_dataset_name'].shape)
# 注意，这里看到的shape信息与你在matlab打开的不同
# 这里的矩阵是matlab打开时矩阵的转置

保存npy格式文件

# 由于矩阵是matlab打开时矩阵的转置，所以，我们需要将它转置回来
# 再将其存为npy格式文件。其中mat_t 是numpy.ndarray格式
mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name'])
np.save('yourfile.npy', mat_t)

保存mat格式文件

from scipy import io

mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy')
io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})

四、.tif格式图片

from scipy import misc
misc.imread('D:\\figure.tif')