安装conda,pytorch

发现cuda又不能用了，不知道怎么回事
1，gpu-2上重新安装pytorch,但是http错误，换源不能解决问题
2，尝试在v-100上安装conda，然后再安装pytorch
参考
vim ~/.bashrc
这步，进入这个文件，常用操作：
https://blog.csdn.net/ylhsuper/article/details/61925713?ops_request_misc=&request_id=&biz_id=102&utm_term=%E5%A6%82%E4%BD%95%E9%80%80%E5%87%BA_{/.bashrc%E6%96%87%E4%BB%B6&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2}all_sobaiduwebdefault-3-.first_rank_v2_pc_rank_v29&spm=1018.2226.3001.4187

2021-06-03
更新，之前是在v-100上安装anacconda，这次尝试在gpu-2上重装anaconda

为什么要重装gpu-2的conda,因为安装了合适版本的pytorch之后，运行：

torch.cuda.is_available()   # 在my-rdkit-env环境中

结果为False

先查看gpu-2 和v-100 的anaconda版本：

conda -V

结果：
gpu-2

v-100

说明conda4.8.3的是可用的，4.10.1是不可用的，可能。。。

开始！！！

还是按照这个教程来参考
1，下载anaconda，

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh

运行完成之后 conda -V 发现还是4.10.1版本，不知道为啥

conda list

尝试重装pytorch

首先需要查看cuda版本

网上的办法不可行，只有用如下命令才行得通：

nvidia-smi

可知gpu-2的cuda版本为10.0

可以顺便查看v100 cuda版本

CUDA Version: 11.2

安装对应版本的pytorch

采取官网安装：

        如果命令输错了，但是已经按下enter健时可以用ctrl+c终止

查看后决定安装：pytorch==1.7.1

conda install pytorch==1.7.1 torchvision==0.8.2 torchaudio==0.7.2 cudatoolkit=10.0 -c pytorch
# 官网是cudatoolkit=10.1， 我改成了cudatoolkit=10.0

运行不成功

按照报错提示查看channels:

conda config --show channels

这里对比着看了一下：
gpu-2的channels有很多，都是后来添加的

v100的channels只有默认的

关于channels的其他命令：

conda config --show channels   # 显示有哪些channels
conda config --show-sources    # 显示channels文件所在位置，同时显示有哪些channels

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/    # 添加channel
conda config --set show_channel_urls yes 

conda config --remove channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/' # 删除channel

报channel的错误的话就尝试删除掉channels,只剩默认

conda config --remove channels 链接

最后只剩下defaults

重新运行安装代码

conda install pytorch==1.7.1 torchvision==0.8.2 torchaudio==0.7.2 cudatoolkit=10.0 -c pytorch

安装完成了，但是发现导入torch模块时报错找不到该模块，于是尝试重新安装1.7.版本的

conda install pytorch==1.7.0 torchvision==0.8.0 torchaudio==0.7.0 cudatoolkit=10.0 -c pytorch
# 同样还是官网是cudatoolkit=10.1， 我改成了cudatoolkit=10.0

还是不行，后来看到python是3.8.5的所以，尝试降到3.7

创建一个新环境: test

conda create --name test python=3.7

pytorch包是安装在当前所在环境下的，需要在当前所在环境下删除

在my-rdkit-env环境下删除pytorch包

conda uninstall pytorch

经检查卸载成功

在my-rdkit-env环境下安装pytorch包

conda install pytorch==1.7.0 torchvision==0.8.0 torchaudio==0.7.0 cudatoolkit=10.0 -c pytorch

说明想要换pytorch版本是需要先卸载后安装的
想到前面的重新安装conda可能也是需要先卸载再安装的

我的天呐！！！好像从一开始就搞错了一件事情，好像只是下载了anaconda并没有安装，我去！！！

按照之前的步骤重新安装anaconda ,提示该文件夹已经存在，（安装到了服务器 /home/zhangzimei 目录下）

运行如下刚刚下载的.sh文件，进行anaconda的安装（命令行输入ls可以找到这个文件）

bash Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh

还需要导入环境变量 ，vim ~/.bashrc 进入这个文件

vim ~/.bashrc

点击 i 可以对这个文件进行编辑
在文件末尾加入语句

export PATH=/home/user_name/anaconda3/bin:$PATH

按下Esc 退出编辑模式

输入 :wq 写入并退出

     其他常用的命令：
     
     :wq! 是写入并强制退出
     :w    保存但不退出（常用）
     :w!   若文件属性为『只读』时，强制写入该档案
     :q    离开 vi （常用）
     :q!   若曾修改过档案，又不想储存，使用 ! 为强制离开不储存档案
     :e!   将档案还原到最原始的状态！

更新配置文件

source ~/.bashrc

完成之后发现还是不能用，pytorch无法安装，报错好像是找不到匹配的包
尝试安装2020.07版本的
安装过程中提示 已经存在anaconda3文件夹（由于刚刚安装过了）
使用命令：

bash Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh -u

即可解决这个问题

这次安装过程中发现之前操作有误：忘记改加入语句export PATH=/home/user_name/anaconda3/bin:$PATH 中的user_name改为zhangzimei
这可能就是之前一直不成功的原因
还有需要注意的一点是anaconda配置好以后自动退回到base，所有环境的conda版本都变为了新安装的这个版本，说明所有的环境使用的conda是一个

接下来安装pytorch

提示10.0那里错了，说明不能简单地修改那里
又修改回10.1进行尝试 ，安装成功，可以导入，但是torch.cuda.is_available()时，是False
卸载以后，重新安装，cudatoolkit=9.2，终于是True了！！！太不容易了！

最后在gpu2上面都安装好了，可以使用了，但是v100不能使用，因为输入jupyter notebook时不能够弹出X-manager 之后再想办法解决吧，可以先使用gpu2

发现gpu-2也不能使用，在终端就可以导入torch，输入jupyter notebook中就找不到模块，用!conda list查看后确定是已经安装好了。

后来发现是jupyter notebook没有配置，多亏了童师姐，以下是配置过程：

注意：安装ipykernel和运行这个模块这些操作必须在你想要使用的这个环境下进行，如下：必须在my-rdkit-env虚拟环境下进行
不管是从哪个虚拟环境中弹出来的jupyter notebook jupyter notebook的运行环境都是默认的环境变量，因此需要改变jupyter notebook的kernel。
需要安装ipykernel模块：

conda install ipykernel

python -m ipykernel install --user --name my-rdkit-env --display-name "Python [conda env:my-rdkit-env]"
# 这里 -m 的意思是以模块形式运行

然后输入jupyter notebook弹出，然后选择或切换 “Python [conda env:my-rdkit-env]” kernel

这就成功了！！

补充：jupyter kernel创建 删除
conda create -n py36 python=36 # 创建一个python36的环境，名为py36
source activate py36 # 激活py36环境
conda install ipykernel # 安装ipykernel模块
#进行配置 名字为py36显示为py3636
python -m ipykernel install --user --name py36 --display-name “py3636”
jupyter notebook # 启动jupyter notebook

查看安装的内核和位置
jupyter kernelspec list

删除py36
jupyter kernelspec remove py36
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版权声明：本文为CSDN博主「ying______」的原创文章，遵循CC 4.0 BY-SA版权协议，转载请附上原文出处链接及本声明。
原文链接：https://blog.csdn.net/weixin_44135282/article/details/90704266

但是v100的还是不能用，弹不出来jupyter notebook,先用gpu-2把，之后再说

————————2021年6月7日 下午更新————————————
今天请教了吴师兄，终于把这个问题解决了，感谢！

解决方案，弹不出来就不让他往出弹了，可以直接复制网址

这里出现很多网址其实都是同一个
复制网址，把//和端口号8890之间的替换为ip地址：172.21.8.36

http://172.21.8.36:8890/?token=da130a5edd6f5929532f06dadc7a734951bddc802b6063ce

修改jupyter notebook的配置文件

# 以下来自与博客，用于学习记录，侵删
# 可解决No web browser found: could not locate runnable browser.的问题

ipython

from IPython.lib import passwd
passwd() #得到加密后的hash
exit
jupyter notebook --generate-config
vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py

c.NotebookApp.ip = '*'
c.NotebookApp.allow_root = True
c.NotebookApp.open_browser = False
c.NotebookApp.port = 8888
c.NotebookApp.password = u'sha1:...' #输入上面加密后得到的密文
c.ContentsManager.root_dir = '/root'

#如果还是无法访问添加
iptables -I INPUT -p tcp -m state --state NEW -m tcp --dport 端口号 -j ACCEPT

#原文链接：https://blog.csdn.net/Martind/article/details/79117830

吴师兄给的解决方案

jupyter_notebook_config.py
vim 进入这个文件进行修改（之前也用vim进入过文件，修改文件，是在安装anaconda时）

vim .jupyter/jupyter_notebook_config.py

# 通过以下命令可以查看上述配置文件的位置
jupyter notebook --generate-config

vim进入这个文件以后, / 可以进行检索，搜索App.ip
找到这一行：

c.NotebookApp.ip = '*'

这行代码本来是注释的，取消注释以后，将 等于号后面引号里面的内容修改，修改完以后如上代码。

i 进入编辑模式，esc退出编辑模式，：wq 写入并退出

成功了！在ie和google上都可以使用，反应灵敏，特别丝滑，我终于摆脱x-manager了！

jupyter notebook弹出时遇到问题：

Firefox is already running, but is not responding. To use Firefox, you must first close the existing Firefox process, restart your device, or use a different profile.

解决方法:参考博客
在linux的终端输入：
firefox -profilemanager
回车后会出现一个小窗口让你选择使用哪个 profile 来启动 firefox。
首先将当前出错的Profile删除掉，然后新建个即可。