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原创 立个Flag(停更后浅浅回复)

Flag立完~大家就不要给我评论和私信,我确实回复不了,对我要求不要太高。等6年毕业之后,我再成为一名合格的博主吧!而不是挂名的文章的时候,就把这些学习内容,以及当时一些经验找一个难得的闲暇时光和大家分享吧!

2024-04-18 11:31:08 192 1

原创 (七)单细胞数据分析——CellChat细胞间通讯差异分析

Cellchat差异分析不同组织之间的细胞间通讯结果,主要关注的是不同细胞群之间的细胞间通讯有何种差异!

2023-06-28 09:18:50 2831 2

原创 (六)单细胞数据分析——非负矩阵分解(NMF)识别功能模块

对上皮细胞进行非负矩阵分解获取细胞的状态,发掘潜在生物学意义的模块

2023-06-26 18:41:46 2704 10

原创 (五)单细胞数据分析——细胞亚群的表型特征刻画(补充工作)

通过热图和总UMAP全局观察细胞亚群,通过小提琴图刻画特征基因在细胞亚群中的表达

2023-05-31 18:55:30 353 1

原创 (四)单细胞数据分析——细胞亚群伪时序分析

对细胞亚群进行伪时序分析,发现细胞可能的分化轨迹

2023-05-25 22:22:41 2346 2

原创 (三)单细胞数据分析——细胞亚群的表型特征刻画

细胞亚群注释,功能相关的分析,以刻画细胞亚群的部分特征

2023-05-17 12:32:33 1069

原创 (二)单细胞数据分析——单细胞类型手动注释并浸润差异与Hallmarker功能差异分析

单细胞分析第二部分内容,涉及较难的分析过程,主要聚焦浸润差异分析以及Hallmarker功能差异分析,需要的友友进!

2023-05-11 20:00:45 2479

原创 (一)单细胞数据分析——单细胞数据预处理

单细胞分析流程之单细胞数据的预处理,包括数据读入,创建Seurat对象、质控等基本分析技术

2023-05-11 17:41:54 1670 6

原创 利用AUCell计算自定义基因集的活性

利用AUCell计算自定义基因集的活性

2023-01-05 12:05:07 990 1

原创 基于R语言利用CIBERSORT分析免疫浸润(二)

CIBERSORT常见问题以及操作代码,数据可视化分析全过程。新手即可学会!

2022-08-28 16:20:06 8180 18

原创 基于R语言Rcpp包解决单细胞数据过大无法转换为Matrix的问题(附AUCell的简单使用)

解决单细胞数据过大无法转换为Matrix的问题

2022-08-26 15:58:21 962 2

原创 基于R语言利用CIBERSORT分析免疫浸润(一)

学习CIBERSORT心得

2022-07-26 15:57:05 6217 3

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