单细胞数据分析
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酷爱药物与编程的生信打工人
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(七)单细胞数据分析——CellChat细胞间通讯差异分析
Cellchat差异分析不同组织之间的细胞间通讯结果,主要关注的是不同细胞群之间的细胞间通讯有何种差异!原创 2023-06-28 09:18:50 · 3067 阅读 · 2 评论 -
(六)单细胞数据分析——非负矩阵分解(NMF)识别功能模块
对上皮细胞进行非负矩阵分解获取细胞的状态,发掘潜在生物学意义的模块原创 2023-06-26 18:41:46 · 2901 阅读 · 10 评论 -
(五)单细胞数据分析——细胞亚群的表型特征刻画(补充工作)
通过热图和总UMAP全局观察细胞亚群,通过小提琴图刻画特征基因在细胞亚群中的表达原创 2023-05-31 18:55:30 · 363 阅读 · 1 评论 -
(四)单细胞数据分析——细胞亚群伪时序分析
对细胞亚群进行伪时序分析,发现细胞可能的分化轨迹原创 2023-05-25 22:22:41 · 2493 阅读 · 2 评论 -
(三)单细胞数据分析——细胞亚群的表型特征刻画
细胞亚群注释,功能相关的分析,以刻画细胞亚群的部分特征原创 2023-05-17 12:32:33 · 1104 阅读 · 0 评论 -
(一)单细胞数据分析——单细胞数据预处理
单细胞分析流程之单细胞数据的预处理,包括数据读入,创建Seurat对象、质控等基本分析技术原创 2023-05-11 17:41:54 · 1767 阅读 · 6 评论 -
(二)单细胞数据分析——单细胞类型手动注释并浸润差异与Hallmarker功能差异分析
单细胞分析第二部分内容,涉及较难的分析过程,主要聚焦浸润差异分析以及Hallmarker功能差异分析,需要的友友进!原创 2023-05-11 20:00:45 · 2623 阅读 · 0 评论