【BME2112】 W2notes

Quiz

Rat 一般比 mouse 大，成年rat 200~800g，mouse只有15g。
“rat”（大鼠）通常指的是较大的老鼠，而"mouse"（小鼠）指的是较小的老鼠。在生物学上，"rat"通常指的是属于Rattus属的老鼠，而"mouse"则可以指不同属下的小型老鼠。

1. According to Azevedo et al. (2009), there are (8.6 ± 0.8) X 10¹⁰ neurons in the human brain.
2. Please sort the following species in ascending order according to their brain size:cat, chimpanzee, dolphin, human, mouse, rabbit, rat, sheep.
   mouse < rat <rabbit < cat < Sheep < Chimpanzee <human <dolphin
3. Please list the names of ventricles in the human brain. telencephalon, third ventricle, diencepalon, midbrain, cerebral
   aqueduct, pons, fourth ventricle,medulla,cerebellum
   Or lateral ventricles,third ventricle, fourth ventricle
4. Nematode ’s connectome has been mapped entirely, and there are 302 neurons in this connectome.
5. (True or false) The axons of some neurons in the rat and human brain can project to very distal brain regions even in the other hemisphere.
6. (True of false) Functional MRI can be used to map activations in specific cellular layers of the human or rat cortex.
7. (True of false) The UK Biobank subjects have better socioeconomic status than the general population of the UK.
8. The command used to start an interactive session is as follows: “qsub -I -X -l nodes=1:ppn=4 -l mem=30gb -l walltime=1:00:00 -q pub_jx”. Please explain the following flags used in this command: “-l nodes=1:ppn=4”, “-l mem=30gb”, and “-l walltime=1:00:00”.
   -l nodes=1:ppn=4 means requesting one compute node with 4 processing cores (ppn stands for “processors per node”).
   -l mem=30gb means requesting 30 gigabytes of memory.
   -l walltime=1:00:00 means the job is allowed to run at most 1 hour.

核磁共振（NMR：nuclear magnetic resonance）的基本概念

微观：指在原子核

• 自旋（spin）：就像电荷和质量一样，是微观粒子的一种基本属性
  电子有负电荷
  运动轨迹：薛定谔方程

薛定谔方程（Schrödinger equation）是描述量子力学中的波函数演化的基本方程。这个方程由奥地利物理学家埃尔温·薛定谔（Erwin Schrödinger）于1925年提出。薛定谔方程用于预测微观粒子，如电子和原子，的行为和性质。
一维时间无关薛定谔方程的一般形式为：
ψ(r, t) * H * ψ(r, t) = iħ∂ψ(r, t)/∂t
在这个方程中：
ψ(r, t) 代表波函数，它描述了粒子的状态，其中 r 是空间坐标，t 是时间。
H 是哈密顿算符（Hamiltonian operator），它包含了系统的总能量和动能算子以及势能算子，用于描述粒子的动力学行为。
i 代表虚数单位。
ħ（h-bar）是约化普朗克常数，它等于普朗克常数 h 除以2π。
∂/∂t 表示对时间 t 的偏导数。
薛定谔方程描述了波函数如何随时间演化，以及如何受到系统的哈密顿算符影响。通过求解薛定谔方程，可以获得粒子的波函数，从而确定其可能的位置和动量。
薛定谔方程是量子力学的基石，它为我们提供了一种理解微观世界的工具，可以用于解释原子和分子的性质，以及更广泛的粒子物理现象。不同情况下，薛定谔方程可能有不同的形式，但其基本思想是相同的：描述粒子的状态如何随时间演化。

1. 原子核的角动量（angular momentum）

   • 原子核的角动量是构成这个原子核的质子和中子的轨道角动量和自旋角动量的矢量和。
     原子核 (Nucleus)，质子 (Proton)，中子 (Neutron)
     原子核的角动量 $P_I=\frac{h}{2\pi }\sqrt{I(I+1)}$
     $I$ 为整数或半整数，称为核自旋量子数（nuclear spin quantum number），它的值由构成原子核的质子和中子数目决定。$\hslash =\frac{h}{2\Pi }$, $\hslash$为普朗克常量。

     • 质子数和中子数都是偶数的核：$I$ ＝ ０ ，即原子核的自旋为零
     • 质子数和中子数有一个是奇数的核：$I$ 值为半整数（如１／２ 、３／２ 等）
     • 质子数和中子数都是奇数的核：$I$ 值为整数（如１ 等）

   • 轨道角动量（Orbital Angular Momentum）： 这是质子和中子绕原子核中心运动的角动量。它与粒子的轨道运动相关，就像行星绕太阳旋转一样。轨道角动量的大小和方向取决于粒子在核内的运动轨迹和速度。在原子核内，轨道角动量是量子化的，其大小由角量子数（l）决定，而方向由磁量子数（m）决定。

   • 自旋角动量（Spin Angular Momentum）： 这是质子和中子内在的自旋运动产生的角动量。自旋类似于地球自转，虽然粒子没有实际的尺寸，但它们有自旋。自旋角动量也是量子化的，其大小由自旋量子数（s）决定，通常为1/2，而方向可以是两种取向：上自旋或下自旋。

   • 总角动量的大小和方向对于核物理研究非常重要，因为它影响原子核的性质、能级结构和反应过程。

   • 如果原子核处于外磁场B0（设沿z 方向）中，则Pl在外磁场方向的投影为$P_{I_Z}=m_I\frac{h}{2\pi }$, 其中$m_I$ 称为核的磁量子数，对于某一确定的$I$ 值，它可取$\mathrm{２}I＋１$个值，为$m_I$ ＝ $I,I-1,I-2,...,-I+1,-I$；即$\mathrm{２}I＋１$个取向，被称为角动量空间取向量子化（Vector quantization of angular momentum space）。

   • 对于氢原子核，它的自旋量子数$I$＝ １／２ ，故$m_I$＝ １／２ ，－ １／２ 。说明在外磁场中质子的角动量仅有两个可能取向。

     • 角动量平行于外磁场 (parallel state)：当$m_I$ ＝ １／２ 时，角动量与外磁场方向之间夹角为锐角（acute angle）。
     • 角动量反平行于外磁场 (antiparallel state)：当$m_I$ ＝ － １／２ 时，角动量与外磁场方向之间夹角为钝角（obtuse angle）。

2. 原子核的自旋磁矩（NMM：nuclear magnetic moment）

   • 原子核的自旋磁矩，简称核磁矩（magnetic moment）：原子核由质子和中子组成，质子（proton）带有正电荷，质子的运动会激发磁场，即质子的自旋运动等效于一个环电流因而具有磁矩，所以原子核具有磁矩。
     • 中子（neutron）、质子（proton）和中子的轨道运动对原子核的磁矩有影响。
     • 质子自旋磁矩方向与核角动量方向相同且共线，磁矩为正
     • 中子磁矩与自旋角动量共线但方向相反，磁矩为负
     • 质子和中子的磁矩虽然符号相反，但绝对值不相等，不能相互抵消。由于核子的磁矩通常也成对的抵消，即两个质子（或中子）配成对，配对的质子（或中子）其磁矩大小相等但方向相反，所以配成对的质子（或中子）总磁矩为零，对外不显磁性。因此，任何质子、中子或两者均为奇数的原子核内均存在磁矩，为未配对质子和中子磁矩的矢量和根据量子力学的理论，原子核的磁矩大小${\mu }_I$与原子核的角动量大小$P_I$的关系为： μ I = g I e 2 m P I = g I e h 4 π m I ( I + 1 ) = g I I ( I + 1