使用R语言进行单（双）因素方差分析

最新推荐文章于 2024-09-02 01:00:00 发布

罗曼罗兰learnote

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分类专栏：数据分析文章标签： r语言

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_53514218/article/details/119849601

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本文介绍了如何使用R语言进行单因素和双因素方差分析（ANOVA）以及单因素协方差分析（ANCOVA）。通过aov()函数进行模型拟合，探讨TukeyHSD()和multcomp包中的glht()函数进行多重比较，以及利用car包的QQ图评估正态性。此外，文章还详细讲解了单因素ANCOVA的步骤，并使用litter数据集进行实例分析，最后探讨了双因素方差分析及其多种可视化方法，推荐使用HH包的interaction2wt()函数。

摘要由CSDN通过智能技术生成

使用R语言进行单（双）因素方差分析

9.1 先了解一些术语

方差分析： ANOVA，协方差分析：ANCOVA (analysis of covariance )，多元方差分析： muti-variate ANOVA，多元协方差分析：MANCOVA

9.2 ANOVA 模型拟合

R语言中使用 aov() 函数拟合 ANOVA模型，结果和回归模型中 lm() 函数一样

aov()函数

R 表达式中常见的特殊符号：

R 常见研究设计的表达式：

单因素ANOVA： y ~ A
协变量的单因素ANOVA： y ~ x + A
双因素： y ~ A + B

注意：因子的顺序很重要

9.3 one-way ANOVA

library(multcomp)
attach(cholesterol) # 加载数据
table(trt)
cholesterol
aggregate(response, by = list(trt), FUN = mean) # 求各组均值
aggregate(response, by = list(trt), FUN = sd)# 求标准差

fit <- aov(response ~ trt) # 检验组间差异
summary(fit)
install.packages('gplots')
library(gplots)
plotmeans(response ~ trt, xlab = 'treatmeat', 
          ylab = 'response', main = 'mean plot with 95% CI')
detach(cholesterol) # detach 数据