edcoder数据结构第1关：基于BF算法的病毒感染监测

第1关：基于BF算法的病毒感染监测

来源BJFUOJ

任务描述

医学研究者最近发现了某些新病毒，通过对这些病毒的分析，得知它们的DNA序列都是环状的。现在研究者收集了大量的病毒DNA和人的DNA数据，想快速检测出这些人是否感染了相应的病毒。为方便研究，研究者将人的DNA和病毒的DNA均表示成由一些小写字母组成的字符串，然后检测某种病毒的DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过，如果出现过，则此人感染了病毒，否则没有感染。注意：人的DNA序列是线性的，而病毒的DNA序列是环状的。请使用BF算法检测人是否感染相应病毒。

编程要求

输入

多组数据，每组数据有一行，为序列A和B，A对应病毒的DNA序列，B对应人的DNA序列。A和B都为“0”时输入结束。

输出

对于每组数据输出一行，若患者感染了病毒输出“YES”，否则输出“NO”。

测试说明

平台会对你编写的代码进行测试：

测试输入： abbab abbabaab baa cacdvcabacsd abc def
0 0

预期输出： YES YES NO

//
// Created by feiji on 2022/11/15.
//

#ifndef DATASTRUCTU_H1_H
#define DATASTRUCTU_H1_H

#endif //DATASTRUCTU_H1_H
#include<iostream>
#include<fstream>
#include<string.h>
using namespace std;
#define MAXSIZE 2000

//- - - - - 串的堆式顺序存储结构- - - - -
typedef struct
{
	char *ch;				//若是非空串，则按串长分配存储区，否则ch为NULL
	int length;			//串的当前长度
}HString;

int Index_BF(HString S,HString T,int pos)
{//返回模式T在主串S中第pos个字符开始第一次出现的位置。若不存在，则返回值为0
	//其中，T非空，1≤pos≤StrLength(S)
	int i=pos,j=0;

	while(i<=S.length&&j<T.length){
		if(S.ch[i]==T.ch[j]){
			++i;++j;
		}else{i=i-j+1;j=0;}
	}

	if(j>=T.length) { return 1;}
	else{
		return 0;
	}

}


bool Virus_detection(HString Virus,HString Person)
{//判断是否匹配，如果可以，返回true，否则返回false
//模式匹配算法调用Index_BF函数
	HString temp;
	int m=Virus.length;
	//将病毒长度扩展为2m,复制一份
	for(int i=m, j=0;j<m;j++,i++){
		Virus.ch[i]=Virus.ch[j];
	}
	Virus.length=strlen(Virus.ch);
	temp.ch = new char[100];
	int flag=0;
	for(int i=0;i<m;i++){
		for(int j=0;j<m;j++){
			temp.ch[j]=Virus.ch[i+j];
		}//取出长度为m的所有组合
		temp.length=strlen(temp.ch);
		 flag=Index_BF(Person,temp,0);
		if (flag>0||Person.length==1){return true;}

	}

		return false;
	
}

BF算法：用于子串的匹配,子串从第一个位置j与模式串i的一个位置依次比较，如果相等++后移，否则i到模式串1的位置，j到子串第一个位置重新匹配。

本题注意：子串为环所以复制一份长度为2m,依次循环取长为m的子串放入temp数组中，执行BF

BF为暴力求解：时间复杂度 n+m<=T(0)<=n*m