解决已经下载了包但是报错ModuleNotFoundError: No module named ‘bx.interval’

解决已经下载了包但是报错ModuleNotFoundError: No module named ‘bx.interval’

在跑hic-pro的test文件的时候，总是在一步卡住，追溯到log文件显示：
前面显示的是from intervals import intersection in啥啥的，然后就显示没有这个‘bx.intervals’的模块。

ModuleNotFoundError: No module named 'bx.intervals'

1. 错误的尝试
   那查询了一下，说可能就是bx-python这个python包没有下载好，遂删掉了环境下的所有bx相关的，然后再重新下载，用以下命令：

pip install bx-python

但是还是一样的报错，我甚至怀疑和这个包根本没有关系，因为bx-python 和intervals包是并列放在了/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.conda/envs/py3.7/lib/python3.7/site-packages/路径下面的。（至于如何找一个下载好的包的路径就是 “pip install 包的名称”就会显示环境下的路径）
当我退回到 site-packages的路径下的时候，打开python（这个时候的环境要是再py3.7)，然后

python3.7.7
>>>import bx.intervals
>>>
#显示是可以导入的

那这时候经过网页查询额书籍查询，了解到可能是导入模块的时候路径搜索出现了问题。
首先我们可以在site-packagesx下去查找sys.path文件

Python 3.7.7 (default, Mar 23 2020, 22:36:06) 
[GCC 7.3.0] :: Anaconda, Inc. on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sys
>>> sys.path
['', '/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.conda/envs/py3.7/lib/python3.7/site-packages', '/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.conda/envs/py3.7/lib/python37.zip', '/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.conda/envs/py3.7/lib/python3.7', '/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.conda/envs/py3.7/lib/python3.7/lib-dynload', '/lustre/home/acct-agrfyd/agrfyd/.local/lib/python3.7/site-packages']
>>> 

这里出现的输出结果是由四个部分组成

1. 程序的主目录：即程序（顶层）文件所在的目录，而非启动程序所在的目录（当前工作日目录）
2. 环境变量（PYTHONPATH）目录
3. 标准连接库目录
4. 任何.pth文件的内容（如果存在的话），在安装目录下找到该文件，以行的形式加入所需要的目录即可。

那么这个sys.path文件保存了模块搜索路径在机器上的实际配置，可以通过打印内置的sys.path来查看路径。
作用：导入模块的时候，python会由左至右搜索列表中的每一个目录，直到找到对应的module后。
其中①③是系统自定义的，而②④可以用于拓展路径，从而加入自己的源代码目录。

考虑是模块搜索路径出了问题，需要配置搜索路径，配置搜索路径的方式主要有3种：

一：用于当前终端：在当前终端中输入：export PATH=$PATH:<你的要加入的路径>不过上面的方法只适用于当前终端，一旦当前终端关闭或在另一个终端中，则无效。 export
NDK_ROOT=/home/jiang/soft/Android-ndk-r8e #只能在当前终端使用。
二：用于当前用户：在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件，可以在此文件中加入 PATH 的设置如下： $ gedit
~/.bashrc 加入：export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH如果要加入多个路径，只要：exportPATH=<你要加入的路径1>:<你要加入的路径2>:......:$PATH当中每个路径要以冒号分隔。这样每次登录都会生效
添加PYTHONPATH的方法也是这样，在.bashrc中添加
export PYTHONPATH=/home/zhao/setup/caffe-master/python:/home/zhao/setup/mypy:$PYTHONPATH
保存后在终端输入 $ source ~/.bashrc 使环境变量立即生效

三：用于所有用户：$ sudo gedit /etc/profile 加入： export PATH=<你要加入的路径>:$PATH
就可以了。 终端输入：echo $PATH 可以查看环境变量
注意，修改环境变量后，除了第一种方法立即生效外，第二第三种方法要立即生效，可以source ~/.bashrc或者注销再次登录后就可以了！

因此我通过vi ~/.bashrc添加PYTHONPATH来修改了之后，就可以成功地调用模块，在任何目录下都可以了。